データ・AIのスキル

选择在解析结构化文本时使用正则表达式还是大型语言模型的决策框架——从正则表达式开始，仅在低置信度的边缘情况下添加大型语言模型。

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ClickHouse database patterns, query optimization, analytics, and data engineering best practices for high-performance analytical workloads.

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苹果FoundationModels框架用于设备上的LLM——文本生成、使用@Generable进行引导生成、工具调用，以及在iOS 26+中的快照流。

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PostgreSQL 数据库模式，涵盖查询优化、架构设计、索引和安全。基于 Supabase 最佳实践。

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LLM API 使用成本优化模式 —— 基于任务复杂度的模型路由、预算跟踪、重试逻辑和提示缓存。

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在解析结构化文本时，用于在正则表达式（Regex）和大型语言模型（LLM）之间进行选择的决策框架——优先使用正则表达式，仅针对低置信度的边界情况引入 LLM。

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LLM API 使用成本优化模式——基于任务复杂度的模型路由、预算跟踪、重试逻辑和提示词缓存。

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PostgreSQL 数据库模式，用于查询优化、架构设计、索引和安全性。基于 Supabase 最佳实践。

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Apple FoundationModels 框架，用于设备端大语言模型（LLM）—— iOS 26+ 中的文本生成、配合 @Generable 的引导式生成、工具调用以及快照流式传输。

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Use when cleaning clinical trial data, preparing data for FDA/EMA submission, standardizing SDTM datasets, handling missing values in clinical studies, detecting outliers in lab results, or converting raw CRF data to CDISC format. Cleans and standardizes clinical trial data fo...

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Professional beautification tool for gene expression heatmaps, automatically adds clustering trees, color annotation tracks, and intelligently optimizes label layout.

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Use when analyzing FASTQC quality reports from sequencing data, identifying quality issues in NGS datasets, or troubleshooting sequencing problems. Interprets quality metrics and provides actionable recommendations for RNA-seq, DNA-seq, and ChIP-seq data.

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Generates Mermaid flowchart code and visual diagrams for pathophysiological.

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Filter compound libraries based on Lipinski's Rule of Five for drug-likeness.

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This skill is applicable when using LaminDB. LaminDB is an open-source data framework for biology that makes data queryable, traceable, reproducible, and FAIR-compliant. It is suitable for managing biological datasets (scRNA-seq, spatial transcriptomics, flow cytometry, etc.), tracking computational workflows, curating and validating data with biological ontologies, building data lakes, or ensuring data lineage and reproducibility in biological research. It covers data management, annotation, ontologies (genes, cell types, diseases, tissues), schema validation, integration with workflow managers (Nextflow, Snakemake) and MLOps platforms (W&B, MLflow), and deployment strategies.

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Statistical analysis and reporting for experimental datasets; use when you need to interpret experimental results, test significance (t-tests/ANOVA), or generate reproducible reports.

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Performs epidemiological analyses including disease modeling (SIR/SEIR), outbreak investigation, risk factor identification, incidence/prevalence estimation, and causal inference from observational data; trigger when users discuss disease spread, public health data, or populat...

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Perform statistical tests, hypothesis testing, correlation analysis, and multiple testing corrections using scipy and statsmodels. Works with ANY LLM provider (GPT, Gemini, Claude, etc.).

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Use facs gating viz style for data analysis workflows that need structured execution, explicit assumptions, and clear output boundaries.

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Constraint-based reconstruction and analysis (COBRA) for metabolic models; use when you need to simulate growth/production, analyze flux ranges, or run knockout and medium studies from SBML/JSON/YAML models.

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Generate graphical abstract layout recommendations based on paper abstracts.

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Generate Meta-analysis funnel plots and perform publication bias testing. Takes CSV file with Meta-analysis data as input, outputs funnel plot PNG, Egger test and Begg test results.

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DNAnexus cloud genomics platform. Build apps/applets, manage data (upload/download), dxpy Python SDK, run workflows, process FASTQ/BAM/VCF, for developing and executing genomics pipelines.

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Use gene structure mapper for data analysis workflows that need structured execution, explicit assumptions, and clear output boundaries.

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