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CatColab Stock-and-Flow Diagrams - epidemiological and ecological modeling with stocks (accumulations), flows (rates), and mass-action ODE semantics for SIR models and population dynamics.

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clj-kondo linter with Gay.jl 3-color integration for GF(3) conservation in Clojure code analysis.

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Strange attractor with sensitive dependence on initial conditions

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3 parallel agents explore codebase improvements via GF(3) balanced prime geodesics

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Access ClinPGx pharmacogenomics data (successor to PharmGKB). Query gene-drug interactions, CPIC guidelines, allele functions, for precision medicine and genotype-guided dosing decisions.

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Semantic embeddings for Clojure code navigation via CIDER

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CIDER integration for Clojure development with nREPL

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Quantum computing framework for building, simulating, optimizing, and executing quantum circuits. Use this skill when working with quantum algorithms, quantum circuit design, quantum simulation (noiseless or noisy), running on quantum hardware (Google, IonQ, AQT, Pasqal), circuit optimization and compilation, noise modeling and characterization, or quantum experiments and benchmarking (VQE, QAOA, QPE, randomized benchmarking).

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Comprehensive citation management for academic research. Search Google Scholar and PubMed for papers, extract accurate metadata, validate citations, and generate properly formatted BibTeX entries. This skill should be used when you need to find papers, verify citation information, convert DOIs to BibTeX, or ensure reference accuracy in scientific writing.

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Track Claude's best and worst questions in DuckDB. Use when Claude asks a notably good or bad question, or to review question quality. Triggers: leaderboard, bad question, good question, question quality.

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Run x86 Linux binaries in the browser via WebAssembly. Self-host development environments, interpreters, and even this skill itself.

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CatColab Schemas - database schema modeling distinguishing entities (tables) from attributes (columns). Foundation for ACSets (Attributed C-Sets) and AlgebraicJulia data structures.

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cats.for" (Categories for AI)

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Query ChEMBL's bioactive molecules and drug discovery data. Search compounds by structure/properties, retrieve bioactivity data (IC50, Ki), find inhibitors, perform SAR studies, for medicinal chemistry.

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Automatically creates user-facing changelogs from git commits by analyzing commit history, categorizing changes, and transforming technical commits into clear, customer-friendly release notes. Turns hours of manual changelog writing into minutes of automated generation.

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Generate professional clinical decision support (CDS) documents for pharmaceutical and clinical research settings, including patient cohort analyses (biomarker-stratified with outcomes) and treatment recommendation reports (evidence-based guidelines with decision algorithms). Supports GRADE evidence grading, statistical analysis (hazard ratios, survival curves, waterfall plots), biomarker integration, and regulatory compliance. Outputs publication-ready LaTeX/PDF format optimized for drug development, clinical research, and evidence synthesis.

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This skill should be used to enforce token efficiency. Every token must pay rent - no preamble, hedging, restating, filler, or apologies. Evicts freeloading tokens from agent output.

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Berry & Boudol's CHAM: computation as chemical reactions on multisets.

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Invariant manifold tangent to center eigenspace

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Reverse engineer CGX Cognionics Quick-20 EEG acquisition protocol using MCP RE tooling (Binary Ninja, Ghidra, radare2)

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Comprehensive Cloudflare platform skill covering Workers, Pages, storage (KV, D1, R2), AI (Workers AI, Vectorize, Agents SDK), networking (Tunnel, Spectrum), security (WAF, DDoS), and infrastructure-as-code (Terraform, Pulumi). Use for any Cloudflare development task.

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CatColab Regulatory Networks - signed graphs for molecular biology modeling gene regulatory networks with positive (activating) and negative (inhibiting) edges.

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CoSProver framework for translating informal proofs to Lean4 via intermediate formal proof states.

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A **samovar** (самовар) keeps water hot indefinitely through self-contained combustion.

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