plurigrid

clj-kondo linter with Gay.jl 3-color integration for GF(3) conservation in Clojure code analysis.

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Deploy serverless applications on Cloudflare Workers. Covers project setup, JavaScript handler patterns, routing, deployment with Wrangler, and API token configuration. Suitable for APIs, proxies, edge computing, and request transformation.

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Generate professional clinical decision support (CDS) documents for pharmaceutical and clinical research settings, including patient cohort analyses (biomarker-stratified with outcomes) and treatment recommendation reports (evidence-based guidelines with decision algorithms). Supports GRADE evidence grading, statistical analysis (hazard ratios, survival curves, waterfall plots), biomarker integration, and regulatory compliance. Outputs publication-ready LaTeX/PDF format optimized for drug development, clinical research, and evidence synthesis.

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Constraint-based metabolic modeling (COBRA). FBA, FVA, gene knockouts, flux sampling, SBML models, for systems biology and metabolic engineering analysis.

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Query NCBI ClinVar for variant clinical significance. Search by gene/position, interpret pathogenicity classifications, access via E-utilities API or FTP, annotate VCFs, for genomic medicine.

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Query ClinicalTrials.gov via API v2. Search trials by condition, drug, location, status, or phase. Retrieve trial details by NCT ID, export data, for clinical research and patient matching.

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Write comprehensive clinical reports including case reports (CARE guidelines), diagnostic reports (radiology/pathology/lab), clinical trial reports (ICH-E3, SAE, CSR), and patient documentation (SOAP, H&P, discharge summaries). Full support with templates, regulatory compliance (HIPAA, FDA, ICH-GCP), and validation tools.

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Clojure ecosystem = babashka + clj + lein + shadow-cljs.

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Track Claude's best and worst questions in DuckDB. Use when Claude asks a notably good or bad question, or to review question quality. Triggers: leaderboard, bad question, good question, question quality.

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Diagnose and fix Claude in Chrome MCP extension connectivity issues. Use when mcp__claude-in-chrome__* tools fail, return "Browser extension is not connected", or behave erratically.

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This skill provides comprehensive CLI reference for the mcp-tasks command-line tool.

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**Category:** Phase 3 Core - Autopoietic Systems

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cats.for" (Categories for AI)

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Comprehensive Cloudflare platform skill covering Workers, Pages, storage (KV, D1, R2), AI (Workers AI, Vectorize, Agents SDK), networking (Tunnel, Spectrum), security (WAF, DDoS), and infrastructure-as-code (Terraform, Pulumi). Use for any Cloudflare development task.

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Bridge between Clifford Algebras (ganja.js/Grassmann.jl) and ACSets with grade-preserving morphisms

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Deploy applications and infrastructure to Cloudflare using Workers, Pages, and related platform services. Use when the user asks to deploy, host, publish, or set up a project on Cloudflare.

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3 parallel agents explore codebase improvements via GF(3) balanced prime geodesics

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Transform ChatGPT ZIP exports into ACSets (Attributed C-Sets) for:

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Quantum computing framework for building, simulating, optimizing, and executing quantum circuits. Use this skill when working with quantum algorithms, quantum circuit design, quantum simulation (noiseless or noisy), running on quantum hardware (Google, IonQ, AQT, Pasqal), circuit optimization and compilation, noise modeling and characterization, or quantum experiments and benchmarking (VQE, QAOA, QPE, randomized benchmarking).

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Bengio's causal inference for AI: Interventional reasoning, counterfactuals, and System 2 deep learning. World models with causal structure.

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Access ClinPGx pharmacogenomics data (successor to PharmGKB). Query gene-drug interactions, CPIC guidelines, allele functions, for precision medicine and genotype-guided dosing decisions.

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Comprehensive citation management for academic research. Search Google Scholar and PubMed for papers, extract accurate metadata, validate citations, and generate properly formatted BibTeX entries. This skill should be used when you need to find papers, verify citation information, convert DOIs to BibTeX, or ensure reference accuracy in scientific writing.

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A **samovar** (самовар) keeps water hot indefinitely through self-contained combustion.

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CatColab Schemas - database schema modeling distinguishing entities (tables) from attributes (columns). Foundation for ACSets (Attributed C-Sets) and AlgebraicJulia data structures.

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