Consults Fable as an independent, read-only reviewer at an effort the caller matches to the question. The calling session (usually Opus, or Haiku) holds the task and escalates one decision point. Use before committing to an interpretation or a substantial piece of writing or analysis, when stuck or not converging, when changing approach, or as a final check on a finished task. Fallback for when the native advisor tool is unavailable. Not for a session already running Fable.
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scdenney/open-science-skills☆ 692026년 10월 20일 업데이트
Audit a methods section against a 45-item checklist drawn from the APSA Experimental Section rubric, JARS-Quant, CONSORT, and DA-RT. Use before submission or archiving, or to document a pre-analysis-plan deviation.
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Advises on setting up and validating LLM text classification: codebook, learning regime and model choice, prompts, validation against human coding (kappa, F1), hybrid review, measurement error, and reporting, plus a short resumable batch pattern with a rule-based baseline. Use to classify, code, or label text at scale; category discovery goes to topic-modeling.
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Reads a model's own uncertainty from token log-probabilities: collecting and aggregating label logprobs, confidence tiers and margins for triage, calibration against human labels (ECE, Brier, reliability diagrams), downstream use, and reproducibility. Use for per-item classifier confidence or routing low-confidence cases to human review; codebook and validation design go to text-classification.
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Builds or audits a literature review: evidence map, closest prior work, gap verdict, and synthesis plan. Use to check whether a contribution is novel, map what a literature establishes, or organize a review; systematic reviews get a protocol scaffold.
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Designs and diagnoses list experiments (the item count technique): whether indirect measurement is warranted, control-list construction, design variants, estimators and assumption tests in the list package, and power. Use when measuring a sensitive item or debugging an implausible prevalence estimate.
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Draft a referee report on someone else's manuscript for a journal editor, using five adversarial finders, a Blue Team error filter, a Chief Reviewer synthesis, and a Tone Guard legal pass. Use when the user has been asked to referee a manuscript; self-audits go to paper-review-lite or presubmit, author responses to referee-response.
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Turns a theory into falsifiable, pre-registerable hypotheses: DGP and DAG, identification, estimands, SESOIs, test choice among NHST, equivalence, and minimum-effect tests, scope conditions, and hypothesis tiers. Use when converting a research question into testable predictions or predicting a null.
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End-of-session closure. Records what changed into the project's own handoff and log files, separating verified from attempted work, and reports what is uncommitted. Use when wrapping up a session. Twin of sitrep.
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Design and format publication-quality figures. Use for chart choice, color, scales, legends, captions, accessibility, and reproducible figure workflows.
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End-stage QA for a finished figure and table set (callouts, numbering, cross-references, text-to-exhibit consistency, captions and notes, accessibility, SI and replication linkage). Use when preparing a submission.
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Fact-check manuscript claims against their cited sources in a per-source Markdown knowledge base. Use to audit claim support, overclaiming, direction, scope, and misattribution after source intake is complete.
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Advises on setting up and validating topic models for survey and experimental text: discovery vs. measurement, STM/LDA/BERTopic choice, preprocessing, covariate formulas, choosing K across coherence, FREX, held-out likelihood, and residuals, validating topics against human coding, robustness, and reporting. Coding against a fixed codebook goes to text-classification.
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Read or convert documents (PDF, Office, OpenDocument, RTF, EPUB, CSV) in a research workflow: read directly or convert, pick the converter from document structure, and decide whether the Markdown is tracked or scratch. Use when a document must be read, quoted, summarized, searched, extracted, or added to a source library; scans go to $vlm-ocr.
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Generates 3-5 conceptually distinct approaches (Novel, Surprising, Diverse, Conventional) and holds for selection before implementing. Use before committing to an approach when a task has more than one non-obvious solution; --codex delegates the brainstorm to a fresh subagent.
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Opens a talk, module, paper, chapter, or referee report as a multi-session deliverable. Interviews the author, then scaffolds deliverable.yml, HANDOFF.md, the planning/ wiki, inbox/, and checks/. Use for deadline-driven work spanning sessions.
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Reviews a whole deliverable against its manifest without rewriting it — deterministic gate, per-section finders, a whole-work pass, and adjudicated findings.json and report.md with honest coverage. Use before shipping a deliverable or for the night shift.
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Turns dictated captures in a deliverable's inbox/ into a proposed planning-wiki diff, classifying and tracing each statement; decisions need the author's assent. Use to intake notes or process the inbox.
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Audits a manuscript's citations for fabricated or nonexistent sources, DOIs that resolve to a different work, mismatches between in-text citations and the reference list, APA 7 or journal style, and whether each source supports the claim it is attached to. Checks entries against Crossref, OpenAlex, and DataCite and labels anything it could not verify NOT CHECKED. Use to check citations, references, a .bib file, or DOIs, or when a source may be AI-invented. Figures and tables go to figure-table-audit.
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OCR scanned or image-only corpora with vision-language models in four phases: `triage` inventories the scans, identifies script and language, and shortlists models by script, hardware, and data constraints; `evaluate` picks a system by measured CER/WER against ground truth, using born-digital twins, a second reader, and decision rules set in advance; `run` builds the production pipeline; and `clean` removes model artifacts, audits what every cleaning rule deletes, corrects with rule-based and LLM passes, and records provenance. Born-digital documents with a text layer go to $doc-to-markdown; runs on Leiden's ALICE cluster add $vlm-ocr-alice.
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Designs multi-country survey experiments: case selection, localization and TRAPD translation, stimulus calibration, per-country power, and pooled versus per-country analysis with measurement-equivalence checks. Use when fielding the same experiment in several countries.
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Interviews a researcher in rounds (idea, design, or defend stage) until no decision in a research idea, design, or draft is left assumed, recommending an answer to each question and writing settled decisions to a file. Use for 'grill me', stress-testing a design, or an idea not yet a design; --plan for software or process plans.
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Scaffold or audit a social-science replication package, and audit the manuscript and archived research objects against FAIR. Use when setting up or repairing a package, checking one before submission, or drafting data, code, and materials availability statements. Adapted from Yusaku Horiuchi's replication-package-guide.
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Organize an author's response to peer review: extract every referee point, order the revision by dependency, flag possible pushbacks, and build the response-letter skeleton the author fills in. Use for revise-and-resubmit planning, response letters, or checking every point was answered.
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