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metainformant-src-metainformant-gwas

METAINFORMANT rules for directory src/metainformant/gwas. Use when editing, adding tests, or reviewing code under this path. Read the linked AGENTS.md first; use uv only, write outputs to output/, real implementations.

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docxology/MetaInformAnt

실행 점수 미검증

설치 방법 보기

포함된 파일(1)

  • SKILL.md1.6 KB

SKILL.md(원문)

설치하기 전에 에이전트에게 전달되는 지시 내용을 확인할 수 있습니다.

METAINFORMANT — src/metainformant/gwas

Before editing files in this subtree:

  • Read AGENTS.md for this folder (canonical technical context).
  • Optional overview: README.md.
  • Global rules: CLAUDE.md at repo root (uv, output/, .tmp/, real implementations).
  • Testing policy: docs/REAL_IMPLEMENTATION_POLICY.md.
  • Use metainformant.core.io for file I/O and metainformant.core.utils.logging for logs.

Module surface (generated, validated)

  • Purpose: Genome-Wide Association Studies (GWAS) module for METAINFORMANT.

The package exposes the historical convenience API lazily. Importing metainformant.gwas keeps subpackages and common functions discoverable without eagerly importing the full workflow and visualization stack.

  • Public submodules: analysis, data, finemapping, heritability, reporting, simulation, validation, visualization, workflow.
  • Canonical import: import metainformant.gwas (submodules: from metainformant import gwas then gwas.<submodule>).
  • Test entry point: uv run pytest tests/gwas -q (one pytest directory per invocation).

Keep changes scoped; match existing patterns in this directory.

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