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analysis-report

生成图文并茂的分析报告/实验报告/质检报告（固定模版）。当用户要求"生成报告/总结报告/实验报告/质检报告/QC报告"，或分析流程收尾需要交付报告时使用。报告必须基于真实分析输出，包含固定章节结构、关键指标表格和真实结果图。

한국어 요약은 준비 중입니다. 원문 설명을 표시하고 있습니다.

peacezha/HPClaw
설치 방법 보기

포함된 파일(1)

  • SKILL.md4.0 KB

SKILL.md(원문)

설치하기 전에 에이전트에게 전달되는 지시 내용을 확인할 수 있습니다.

分析报告生成规范（固定模版 · 图文并茂）

硬性要求

  1. 数据必须真实：报告中的每个数字、每张图都必须来自真实的输出文件（日志、QC 输出、统计结果）。先 cat/head 读取真实结果再写报告。禁止编造或"合理推测"数值。
  2. 图必须真实存在：引用的每张图先用 ls -l 确认存在，使用绝对路径引用。
  3. 报告写完必须自查：逐项核对模版章节是否齐全、图表路径是否存在。

产出约定

  • 目录：reports/<任务名>-<YYYYMMDD>/
  • 交付两个文件：report.html（自包含，图片 base64 内嵌，可直接发给用户/浏览器打开）和 report.md（同内容 markdown 源）
  • 关键原图复制到报告目录 figures/ 子目录（cp，不移动原文件）
  • 完成后在回复中给出：报告文件绝对路径 + 2~4 张关键图的绝对路径（前端会渲染成图片卡片）

固定模版（章节顺序不得更改）

1. 标题与概要

  • 报告标题、分析类型、生成日期、执行人（当前用户名）、集群与队列
  • 一段话说清：对什么数据做了什么分析、结论一句话

2. 样本与输入

项目内容
样本/数据名称、路径、文件数、总大小（真实 ls/du 结果）
参考基因组/数据库名称、版本、路径或来源
软件环境关键软件及版本（module list 或 --version 真实输出）

3. 分析流程与方法

  • 步骤列表：每步命令要点 + 作业 ID（若有）+ 状态（DONE/EXIT 以 bjobs 真实结果为准）
  • 资源使用：节点数、队列、运行时长（bacct/bjobs 真实数据）

4. 质控指标（QC 报告此项为核心）

用表格呈现真实 QC 输出，例如：

指标结果判定
总 reads 数（真实值）✅/⚠️/❌
Q30 比例（真实值）✅/⚠️/❌
GC 含量（真实值）✅/⚠️/❌
比对率（真实值）✅/⚠️/❌
判定阈值在表格下注明出处（如 FastQC 常规标准）。

5. 关键结果（图文并茂）

  • 每个结果小节：一段文字结论 + 紧跟对应的图（绝对路径）
  • 图的来源：分析工具直接产出的图（FastQC html 中的 png、MultiQC 图、peak 图、表达热图等）优先；没有现成图时，用真实数据生成（如 R/Python 画图），同样给路径

6. 问题与建议

  • 分析中出现的警告/失败步骤及处理（如实写）
  • 对后续分析的建议（如需要扩大节点数、换队列、补测等）

7. 附录

  • 输出文件清单（find <结果目录> -type f 真实列表，标注大小）
  • 关键日志路径
  • 报告生成时间

HTML 报告样式要求

  • 自包含单个 .html：内联 CSS（无需网络）、图片 base64 内嵌（base64 -w0 <图>）
  • 表格有边框和表头底色；✅/⚠️/❌ 用颜色区分
  • 章节编号与模版一致，不要自由发挥新结构

禁止事项

  • 禁止编造数值、图片或"示例"结果
  • 禁止引用不存在的文件路径
  • 禁止把报告写成纯文字流水账而没有表格和图
  • 路径、目录名、文件名必须逐字原样引用，禁止翻译或改写（如 04_results/03_align 不得写成「结果目录/比对」）

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