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Submit compact Ensembl REST API requests for lookup, overlap, cross-reference, and variation endpoints. Use when a user wants concise Ensembl summaries

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Submit compact AlphaFold Protein Structure Database API requests for prediction, UniProt summary, sequence summary, and annotation lookups. Use when a user wants AlphaFold metadata or concise structure summaries

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Submit compact GWAS Catalog REST API v2 requests for studies, associations, SNPs, EFO traits, genes, publications, loci, and metadata. Use when a user wants concise GWAS Catalog summaries

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Submit compact IPD REST requests for HLA allele and cell-level metadata using the public IPD query API. Use when a user wants concise IPD summaries; save raw JSON or text only on request.

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Submit compact eQTL Catalogue API requests for association retrieval and documented metadata endpoints. Use when a user wants concise public eQTL Catalogue summaries

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Submit compact MGnify API requests for microbiome studies, samples, and biome metadata. Use when a user wants concise MGnify summaries

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Submit compact BindingDB REST API requests for ligand-target binding lookups by PDB, UniProt, or similarity search. Use when a user wants concise BindingDB summaries; save raw payloads only on request.

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HyperFrames CLI tool — hyperframes init, lint, inspect, preview, render, transcribe, tts, doctor, browser, info, upgrade, compositions, docs, benchmark. Use when scaffolding a project, linting, validating, inspecting visual layout in compositions, previewing in the studio, rendering to video, transcribing audio, generating TTS, or troubleshooting the HyperFrames environment.

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Submit compact ENCODE REST API requests for object lookups, portal-style search, and metadata retrieval. Use when a user wants concise ENCODE summaries

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Submit compact bioRxiv and medRxiv API requests for details, publication-linkage, and DOI lookups. Use when a user wants concise preprint metadata summaries

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Submit compact ChEBI 2.0 API requests for chemical search, compound lookup, ontology traversal, and structure metadata. Use when a user wants concise ChEBI summaries

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Map GWAS loci to ranked candidate genes using a deterministic multi-skill chain (EFO -> GWAS -> coordinates -> Open Targets L2G/coloc -> eQTL -> burden/coding context), with reproducible tables and optional figures. Use when a user provides a trait/EFO term and/or lead variants and needs locus-to-gene prioritization for downstream biology decisions.

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Guidelines for creating API routes in Expo Router with EAS Hosting

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Wire Expo projects into the Codex app with project-local run scripts and .codex/environments/environment.toml actions. Use when the user wants the Codex app Run button, build/run actions, action buttons, or a stable Expo start/run workflow from Codex.

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Guidelines for upgrading Expo SDK versions and fixing dependency issues

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Use Expo DOM components to run web code in a webview on native and as-is on web. Migrate web code to native incrementally.

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Guide for writing Expo native modules and views using the Expo Modules API (Swift, Kotlin, TypeScript). Covers module definition DSL, native views, shared objects, config plugins, lifecycle hooks, autolinking, and type system. Use when building or modifying native modules for Expo.

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Operate and troubleshoot CircleCI using the CircleCI CLI. Use when users ask to authenticate CLI access, inspect pipeline/workflow/job status, validate configuration locally, rerun pipelines/jobs, trigger pipelines, or gather actionable diagnostics from CLI outputs.

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Install, open, connect, or repair ChatCut Desktop when the chatcut_desktop MCP tools are missing or unavailable. Do not use from a managed agent already running inside ChatCut Desktop, or when chatcut_desktop tools are already available.

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Reviews code changes using CodeRabbit AI. Use when user asks for code review, PR feedback, code quality checks, security issues, or requests fix-review cycles.

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Build sandboxed applications for secure code execution. Load when building AI code execution, code interpreters, CI/CD systems, interactive dev environments, or executing untrusted code. Covers Sandbox SDK lifecycle, commands, files, code interpreter, and preview URLs. Biases towards retrieval from Cloudflare docs over pre-trained knowledge.

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Choose and apply automatic layout strategies for node-link diagrams and connected-node visuals. Use when the user asks how to auto-arrange nodes, reduce line crossings, route edges, avoid overlaps, stabilize layout, or choose graph-layout algorithms for network diagrams, dependency graphs, database schema diagrams, ERDs, state machines, decision trees, flow diagrams, box-and-line editors, or other line-connected nodes.

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Build AI agents on Cloudflare Workers using the Agents SDK. Load when creating stateful agents, durable workflows, real-time WebSocket apps, scheduled tasks, MCP servers, or chat applications. Covers Agent class, state management, callable RPC, Workflows integration, and React hooks. Biases towards retrieval from Cloudflare docs over pre-trained knowledge.

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Boltz CLI setup and auth. Use when installing, updating, verifying, or authenticating `boltz-api`, or fixing missing CLI, PATH, sandbox, browser login, or auth errors.

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