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Implement tasks from an OpenSpec change. Use when the user wants to start implementing, continue implementation, or work through tasks.

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Archive a completed change in the experimental workflow. Use when the user wants to finalize and archive a change after implementation is complete.

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Enter explore mode - a thinking partner for exploring ideas, investigating problems, and clarifying requirements. Use when the user wants to think through something before or during a change.

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Submit protein folding tasks to the AlphaFold3 C550 inference platform. Use when the user needs to run AlphaFold3 predictions with pre-prepared JSON input files on the AI4S Kubernetes cluster.

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Build and sharpen a project's domain model. Use when discussing codebase terminology, writing or editing a CONTEXT.md, or recording or editing an ADR.

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Grill the user relentlessly about a plan, decision, or idea. Use when the user wants to stress-test their thinking, or uses any 'grill' trigger phrases.

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Propose a new change with all artifacts generated in one step. Use when the user wants to quickly describe what they want to build and get a complete proposal with design, specs, and tasks ready for implementation.

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A relentless interview to sharpen a plan or design, which also creates docs (ADR's and glossary) as we go.

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Parse PDFs, Office files, images, and HTML into Markdown/structured outputs with MinerU. Use when SciForge or Codex needs document parsing/OCR for scientific papers, supplementary files, PDFs, scanned documents, tables, formulas, or URL/local-file parsing through MinerU standard or Agent lightweight APIs.

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Draft, confirm, and synchronize research status, evidence, blockers, and review-ready GitHub summaries using the Research Memory skill, GitHub conventions, and file templates.

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