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概要と使いどころ
Use when validating or evaluating a trained medical-imaging model. Audits split leakage and validation design, computes task-correct held-out metrics (Dice + HD95, AUROC + AUPRC, FROC, calibration), and covers uncertainty/OOD and Grad-CAM explainability, each with a gate.
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Use when a trained medical-imaging model needs its documentation. Fills a Model Card and a Datasheet for its dataset from facts you supply, adds a METRIC-informed data-quality pass and gates that no required section is empty. Never invents numbers, provenance or licence.
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Renamed to /model-assessment in v6 (removed in v7).
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Use when choosing the model for a medical-imaging study. Picks a paper-grounded architecture family (CNN/ViT, U-Net/nnU-Net, detection, SAM/foundation, GNN), then vets the concrete repo or checkpoint for licence, version pin, weight provenance and benchmark overlap.
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Renamed to /model-assessment in v6 (removed in v7).
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Use when turning a folder of research PDFs into Obsidian notes, even if Obsidian is not named. Writes one templated literature note per paper and extracts cross-linked atomic concept notes, never overwriting existing ones. A .bib or Zotero library is /lit-sync.
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Use when the user describes a research goal without naming a skill, or the task spans several skills. Classifies the request, plans the order and routes to the right medsci-skills skill(s) instead of producing their output itself.
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Use when a manuscript needs a copy-edit for consistency and non-native English clarity. Flags abbreviation, US/UK spelling, en-dash range, P/p, hyphenation, number-style and unit-spacing issues, then polishes style only. AI-tell removal is /humanize.
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Renamed to /imaging-data in v6 (removed in v7).
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Use when rendering a Markdown document (English or Korean) such as a proposal, IRB cover letter, handout or reference table to PDF via pandoc and xelatex, with auto-fitted table widths and CJK fonts. Not for manuscripts with a bibliography (/manage-refs) or Word forms.
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Use when data needs statistical analysis. Runs reproducible Python/R code for Table 1, diagnostic accuracy, agreement, regression, survival, propensity score, survey-weighted and repeated-measures models, with publication tables. Sample size is /calc-sample-size; pooling studies is /meta-analysis.
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Use when clinical data may contain PHI and must be de-identified before any LLM-assisted analysis. A local Python script (no network or AI calls) detects identifiers with regex and heuristics in 11 country locale packs, with interactive terminal review.
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Use when looking for research topics a longitudinal cohort database can answer (NHIS, UK Biobank, an institutional EMR or registry). Profiles the cohort, matches PI expertise, scans literature saturation and returns ranked topic proposals with gap evidence.
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Use when preparing a medical-imaging dataset (DICOM/NIfTI) for modelling. Profiles spacing, orientation, intensity, label integrity, foreground fraction and target volume, gates them against the plan, then plans and audits preprocessing and augmentation for leakage.
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Use when references in a .bib file (often from /search-lit) should land in Zotero and Obsidian. Syncs them to the Zotero library, writes Obsidian literature notes and extracts cross-cutting concept notes once enough accumulate. A folder of PDFs is /obsidian-paper-vault.
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Use when preparing an academic talk such as a journal club, grand rounds, seminar, conference presentation, or lecture/teaching deck. Analyzes the source, drafts audience-adapted speaker scripts, builds or augments the PPTX with speaker notes and prepares Q&A.
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Use when turning a personal agent skill into an open-source, distributable one. Runs a PII audit, generalizes personal details, checks licence compatibility, reviews cross-platform adapters and walks through packaging.
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Use when an institutional Word form (.doc/.docx IRB protocol, ethics application, grant template) must be filled without breaking its styles, tables, fonts or page layout. Renders content drafted by /write-protocol into the template; CJK-aware.
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Use when managing a manuscript project over time. Scaffolds the project structure, tracks writing progress across phases, maintains project memory files, and generates submission checklists and backwards timelines (commands init, status, sync-memory, checklist, timeline).
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Use when designing or auditing how an LLM or multimodal LLM is evaluated on a clinical task (report generation, VQA, text extraction). Covers reference standard, clinical-efficacy metrics beyond BLEU/ROUGE, hallucination, contamination and prompt sensitivity. Imaging models are /model-assessment.
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