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概要と使いどころ
Generates the "Risk of Bias" results section for a meta-analysis based on assessment tables and statistics. Use when the user wants to draft the risk of bias analysis text from provided data tables.
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Use Bio.PDB to parse and analyze protein structures (PDB/mmCIF) for structural bioinformatics tasks; use when you need structure parsing, geometry calculations, or structural comparison/superposition.
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A comprehensive toolbox for computational molecular biology; use it when you need programmatic sequence/structure parsing, batch bioinformatics pipelines, or automated NCBI/BLAST workflows.
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Sequence alignment and alignment file processing with Biopython (Bio.Align/Bio.AlignIO), triggered when you need global/local pairwise alignment, MSA read/write/format conversion, or alignment statistics/filtering.
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Use Biopython to read/write/convert biological sequence files (FASTA/GenBank/FASTQ, etc.) and perform basic sequence operations; use when you need reliable sequence I/O, lightweight sequence manipulation, or scalable processing of large sequence datasets.
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Analyze data with `adme-property-predictor` using a reproducible workflow, explicit validation, and structured outputs for review-ready interpretation.
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Mock interview preparation tool for residency Match interviews. Generates.
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Generate 3D animation scripts and lay explanations for drug mechanisms.
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Write and revise the Methods section of research papers to ensure reproducibility; use when preparing an IMRAD manuscript or responding to journal/reporting-guideline requirements (e.g., CONSORT/STROBE/PRISMA).
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Generate ethical, compliant, and patient-friendly recruitment advertisements for clinical trials.
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Decompose genetic effects into direct and indirect paths through mediating variables using the mediation R package. Tests whether gene expression, methylation, or other molecular phenotypes mediate the effect of genetic variants on disease. Use when testing whether a molecular...
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Use this skill when converting academic papers to promotional and presentation formats, including interactive websites (Paper2Web), presentation videos (Paper2Video), and conference posters (Paper2Poster). This skill is suitable for paper dissemination, conference preparation, creating explorable academic homepages, generating video abstracts, or producing printable posters from LaTeX or PDF source.
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Rewrite drafts according to target writing style or target journal format. Triggers when user says "rewrite in XX style", "match this tone", "format for XX journal", "rewrite following this format". Input can be .docx / .md / .txt or conversation text.
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Detect and correct for horizontal pleiotropy in Mendelian randomization analyses using MR-PRESSO for outlier removal, MR-Egger regression for directional pleiotropy, and Steiger filtering for variant directionality. Use when validating MR results, detecting pleiotropic instrum...
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Data structure for annotated matrices in single-cell analysis; use when reading/writing .h5ad (or zarr) and exchanging data with the scverse ecosystem.
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Use study limitations drafter for academic writing workflows that need structured execution, explicit assumptions, and clear output boundaries.
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Orchestrates a systematic review and meta-analysis workflow following PRISMA 2020 guidelines, from protocol development through multi-database search, screening, data extraction, and evidence synthesis. Use when conducting evidence-based reviews, meta-analyses, or scoping revi...
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Use semantic consistency auditor for academic writing workflows that need structured execution, explicit assumptions, and clear output boundaries.
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Generates the "Results" section for meta-analysis sensitivity analysis based on statistical tables and titles. Use when the user wants to describe sensitivity analysis results or format sensitivity tables for a meta-analysis paper.
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Polish reviewer-response letters by softening defensive language, preserving factual meaning, and keeping responses professional, concise, and publication-appropriate.
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Use rebuttal letter strategist for academic writing workflows that need structured execution, explicit assumptions, and clear output boundaries.
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Interpret Alpha and Beta diversity metrics from 16S rRNA sequencing results.
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Use when converting medical text between academic and patient-friendly tones, translating medical jargon for patients, adapting research papers for public audiences, or rewriting clinical notes for patient handouts. Maintains medical accuracy while adjusting readability level.
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Advanced sample size and power calculations for complex study designs including survival analysis, clustered designs, and multiple comparisons.
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