「ray」の検索結果

Tools for parsing Illumina's microarray output files, including IDAT.

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The package contains functions for exploratory oligonucleotide array analysis. The dependence on tkWidgets only concerns few convenience functions. 'affy' is fully functional without it.

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Tools to analyze & visualize Illumina Infinium methylation arrays.

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Use when a phase has unresolved decisions before planning and no CONTEXT.md exists. Asks adaptive questions on the phase's gray areas and writes {phase_num}-CONTEXT.md with locked decisions; --auto, --chain, --power change the questioning.

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Create, modify, debug, or review Windows Forms applications only when the request contains a concrete Windows Forms marker. USE FOR: WinForms, Windows Forms, System.Windows.Forms, WinForms Form or UserControl designer files (*.Designer.cs or *.Designer.vb), Visual Studio WinForms Designer, TableLayoutPanel, BindingSource, DataGridView, Control.InvokeAsync, component-tray ownership, or custom control serialization. DO NOT USE FOR: WPF or WPF XAML, including Window.InputBindings, KeyBinding, commands, or DataContext; .NET MAUI; Avalonia; or any request where none of the listed Windows Forms markers is present.

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byted-emr-skills提供管理火山引擎EMR（火山引擎 E-MapReduce（简称“EMR”）是开源Hadoop生态的企业级大数据分析系统，完全兼容开源）的技能，包括管理EMR on ECS集群、EMR on VKE集群、EMR serverless队列、计算组、作业模板/实例、日志、监控并提供 EMR Agent 智能诊断与知识问答能力。当用户提及“EMR on ECS集群”、“EMR on VKE集群”、“Serverless 队列”、“Serverless 作业”、“SparkSQL/PrestoSQL/Ray/PySpark/SparkJar 作业”、“作业日志”、“作业监控”、“作业诊断”等需求时，应优先使用此技能。

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@delon/util skill - Utility functions library for array, string, date, number manipulation. For ng-events construction site progress tracking system.

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Electron desktop apps with React, TypeScript, and Vite. Use for IPC, window/tray, PTY terminals, WebRTC, and packaging.

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AMM pool mechanics comparison across Raydium, Orca, and Meteora including fee structures, pool types, creation patterns, and volume efficiency

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Access NCBI GEO for gene expression/genomics data. Search/download microarray and RNA-seq datasets (GSE, GSM, GPL), retrieve SOFT/Matrix files, for transcriptomics and expression analysis.

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PostgreSQL-specific development assistant focusing on unique PostgreSQL features, advanced data types, and PostgreSQL-exclusive capabilities. Covers JSONB operations, array types, custom types, range/geometric types, full-text search, window functions, and PostgreSQL extensions ecosystem.

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PostgreSQL-specific code review assistant focusing on PostgreSQL best practices, anti-patterns, and unique quality standards. Covers JSONB operations, array usage, custom types, schema design, function optimization, and PostgreSQL-exclusive security features like Row Level Security (RLS).

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QA engineering workflows on top of Playwright. Use when a QA engineer asks to design test cases from a ticket, PRD or acceptance criteria, decide what to automate, write a bug report from a failing test or trace, convert manual test cases (TestRail, Xray, CSV) into Playwright specs with case-ID traceability, or review Playwright test code and pull requests.

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Annotate bacterial and archaeal genomes and plasmids with Bakta's Prodigal/HMM/diamond pipeline. Identifies CDS, ncRNA, tRNA, rRNA, tmRNA, sORFs, CRISPR arrays, oriC/oriV/oriT, and gaps against a curated UniRef-derived database. Produces NCBI-compatible GFF3, GenBank, EMBL, JSON, FASTA, TSV, and a circular genome plot. Use Prokka for legacy pipelines or non-bacterial kingdoms; PGAP for NCBI GenBank submission.

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Parallel/distributed computing for larger-than-RAM data. Components: DataFrames (parallel pandas), Arrays (parallel NumPy), Bags, Futures, Schedulers. Scales laptop to HPC cluster. For single-machine speed use polars; for out-of-core without cluster use vaex.

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Interactive viewer for microscopy. Displays 2D/3D/4D arrays as Image, Labels, Points, Shapes, Tracks layers; supports annotation, plugin analysis, headless screenshots. Core visualization for Python bioimage workflows. Use ImageJ/FIJI for macro processing; napari for Python-native interactive visualization and DL segmentation review.

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Pure Python DICOM for medical imaging (CT, MRI, X-ray, ultrasound). Read/write DICOM, pixels as NumPy, edit tags, windowing (VOI LUT), PHI anonymization, build DICOM, series→3D volumes. Use histolab for WSI pathology; nibabel for NIfTI.

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Open-source bio-image data management. Use the omero-py client to connect to an OMERO server, retrieve images as numpy arrays, annotate with tags and key-value pairs, manage ROIs, and feed image data into Python analysis pipelines — programmatically, no GUI.

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Python library for biology: sequence manipulation (DNA/RNA/protein), pairwise/multiple alignment, phylogenetic trees (NJ, UPGMA), diversity (Shannon, Faith PD, Bray-Curtis, UniFrac), ordination (PCoA, CCA, RDA), stats (PERMANOVA, ANOSIM, Mantel), file I/O (FASTA, FASTQ, Newick, BIOM). Use for microbiome, community ecology, or phylogenetics.

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Audit, redesign, generate, and improve IEEE manuscript figures, tables, captions, result presentation, plotting scripts, visual polish, hybrid Python/R plus vector-editor workflows, publication-ready matplotlib house style, and layout using routed visual-evidence checks. Use when checking or creating plot readability, axes, legends, line overlap, table structure, metric reporting, captions, grayscale accessibility, IEEE one-column/two-column layout, figure/table placement, claim-evidence mapping, reviewer first-impression risks, matplotlib/seaborn or ggplot2 figure code, SVG/PDF/TIFF/PNG export, Illustrator/Inkscape/PowerPoint/Figma finishing plans, or IEEE-style engineering evidence graphics.

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Data-Juicer repo router for local recipes, Ray recovery, and service/MCP workflows.

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Route DataFlow workflows for pipelines, text and document processing, serving, evaluation, and Ray acceleration.

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Use this repo skill for Dask, the Python parallel computing library, when working with lazy task graphs, schedulers, Dask Array, Dask DataFrame, Dask Bag/bytes IO, configuration, diagnostics, CLI usage, or contributor validation.

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Use Augmentor for Pillow-based image augmentation pipelines, operation selection, mask-safe augmentation, array/generator workflows, and package-specific troubleshooting.

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