Estimates time-scaled phylogenies, molecular clock rates, effective reproduction number R_e (or R_t), and population dynamics from dated pathogen genomes using TreeTime (maximum-likelihood) and BEAST2 (Bayesian; strict / uncorrelated lognormal / ORC clocks; constant / exponential / Bayesian Skyline / Skygrid / BICEPS / Birth-Death-Skyline / sampled-ancestor BDSKY priors; structured coalescent via MASCOT). Covers root-to-tip clock signal QC via TempEst, date-randomisation tests (Ramsden 2009; Duchêne 2015), recombination masking via Gubbins and ClonalFrameML before clock inference for recombining bacteria, BDSKY origin-vs-rootHeight pitfalls, sampling-bias correction (Volz & Frost 2014; preferential-sampling extensions), MASCOT structured coalescent for migration, BICEPS-vs-BSP skyline choice, multi-chain BEAST2 convergence diagnostics, and reconciliation between phylodynamic R_e and case-based R_t. Use when dating outbreak origins, estimating substitution rates, inferring R_e through time, building time-calibrated Nextstrain Augur trees, choosing between strict and relaxed clocks, fitting Birth-Death-Skyline (Stadler 2013) models, diagnosing temporal-signal failure, masking recombination before clock inference for *Streptococcus pneumoniae* / *Neisseria gonorrhoeae* / *Klebsiella* / *E. coli* phylodynamics, running MASCOT for structured-population analyses, or using UShER for pandemic-scale placement.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
peacezha/HPClaw☆ 32026年10月11日 更新
Bead-based signal normalization and cross-batch harmonization for CyTOF and high-parameter cytometry - EQ four-element bead normalization of instrument sensitivity drift (CATALYST normCytof, premessa), and reference-anchor cross-batch normalization (CytoNorm, per-cluster quantile splines). Covers the distinction between within-run drift correction and between-batch correction, the mandatory anchor/reference sample, why normalization is per-cluster with many quantiles, and the over-correction risk. Use when correcting CyTOF signal drift, harmonizing multi-batch or multi-site studies, or deciding whether to normalize data versus model batch in the design.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
peacezha/HPClaw☆ 32026年10月11日 更新
Segments the genome into chromatin states from combinatorial histone modification and chromatin factor ChIP-seq data. Uses ChromHMM (multivariate HMM on binarized signal, v1.27), Segway (Dynamic Bayesian Network on continuous signal), EpiSegMix (flexible-distribution HMM with duration modeling, 2024), EpiLogos (multi-biosample visualization), IDEAS (cell-type-aware joint), and full-stack ChromHMM (Vu Ernst 2022) for cross-cell-type segmentations. Handles state-count selection (15 vs 18 vs 25 states), binarization choice, OverlapEnrichment / NeighborhoodEnrichment downstream analysis, and cross-biosample integration. Use when learning chromatin states from a histone mark panel, characterizing learned states by genomic feature enrichment, or comparing chromatin landscapes across cell types.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
peacezha/HPClaw☆ 32026年10月11日 更新
Analyzes differential transcript usage (DTU) and isoform switches with functional consequence prediction (NMD via 50nt rule, ORF disruption, protein domain loss/gain, signal peptide changes, IDR alterations, coding-potential shifts). Tools include IsoformSwitchAnalyzeR v2 (auto-selects satuRn for >5 reps else DEXSeq), the manual DRIMSeq -> DEXSeq/satuRn -> stageR DTU pipeline, and fishpond/swish for inferential-uncertainty-aware DTE. Distinguishes DTU from DGE and DTE; integrates external annotators (CPC2, Pfam, SignalP, IUPred2A or DeepTMHMM). Use when investigating how splicing differences alter protein function or trigger NMD-mediated degradation.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
peacezha/HPClaw☆ 32026年10月11日 更新
ライブラリ非依存のFlutter/Dartコードレビューチェックリスト。ウィジェットのベストプラクティス、状態管理パターン(BLoC、Riverpod、Provider、GetX、MobX、Signals)、Dartイディオム、パフォーマンス、アクセシビリティ、セキュリティ、クリーンアーキテクチャをカバー。
hage-oyaji/everything-claude-code-jp-local☆ 32026年3月29日 更新
Apply 37signals/DHH Rails conventions when writing Ruby on Rails code. Use when building Rails applications, reviewing Rails code, or making architectural decisions. Covers various aspects of Rails application architecture, design and dependencies.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
MikeCheng1208/BattleTree☆ 22026年7月22日 更新
Quantitative trading expertise for DeFi and crypto derivatives. Use when building trading strategies, signals, risk management. Triggers on signal, backtest, alpha, sharpe, volatility, correlation, position size, risk.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
aAAaqwq/openclaw-team☆ 22026年6月18日 更新
Backtest crypto and traditional trading strategies against historical data. Calculates performance metrics (Sharpe, Sortino, max drawdown), generates equity curves, and optimizes strategy parameters. Use when user wants to test a trading strategy, validate signals, or compare approaches. Trigger with phrases like "backtest strategy", "test trading strategy", "historical performance", "simulate trades", "optimize parameters", or "validate signals".
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
aAAaqwq/openclaw-team☆ 22026年6月18日 更新
Tracks competitors weekly across 6 signals: pricing page diffs, homepage positioning changes, blog/RSS posts, job postings (hiring as strategy signal), GitHub star velocity and releases, and daily critical-change alerts for pricing or funding keywords. Delivers a structured digest to Slack, Telegram, WhatsApp, or Discord every Monday. Fires same-day alerts for critical changes. Use when asked to "add competitor", "track competitor", "competitor digest", "what changed at [company]", "competitor report", "monitor [company]", "who is [company] hiring", "did [company] change pricing".
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
aAAaqwq/openclaw-team☆ 22026年6月18日 更新
A specialized tool for sending quantitative trading signals to the FMZ platform via HTTP API.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
johnalbertini14-glitch/openclaw-skills☆ 22026年2月26日 更新
Full website audit for ICP alignment, messaging clarity, conversion optimization, and trust signals
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
ekatasingh1107/b2b-gtm-skills☆ 22026年4月12日 更新
Track Slack communities, Discord servers, Facebook groups, and forums for buying signals and engagement opportunities
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
ekatasingh1107/b2b-gtm-skills☆ 22026年4月12日 更新
Outreach triggered by funding events with post-funding needs analysis and personalized drafts
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
ekatasingh1107/b2b-gtm-skills☆ 22026年4月12日 更新
長いClaude Codeの作業で、会話や読み込んだ情報を圧縮するタイミングを提案します。文脈量とツール呼び出し回数を目安に、工程の区切りで重要な計画を残す判断を支援します。
- 長い会話が文脈上限に近づいたとき
- 調査内容をまとめて実装へ進みたいとき
- デバッグ後に別の作業へ移りたいとき
affaan-m/ECC☆ 27.9万2026年10月12日 更新
開発前に製品の狙いを検証し、企画の実行判断、利用開始時のつまずき、機能の優先順位を整理します。根拠と次の行動を含む企画書やロードマップにまとめます。
- 曖昧なアイデアを企画書にしたいとき
- 開発する機能の優先順位付け
- 公開前の導入体験の点検
affaan-m/ECC☆ 27.9万2026年10月12日 更新
営業・提携・資金調達の候補者を調べて優先順位を付け、共通の知人を通じた紹介経路を探し、相手の近況と送り手の文体に合わせてメールやSNSの連絡文を下書きします。
- 特定業界の見込み客を探したいとき
- 提携先や投資家候補の優先順位付け
- 共通の知人からの紹介経路の調査
affaan-m/ECC☆ 27.9万2026年10月12日 更新
Djangoアプリの構成、API設計、データ取得、キャッシュの実装とレビューを支援します。環境別の設定分離や処理の整理、不要な問い合わせを減らす設計例を示します。
- Djangoの構成と設定の整理
- Django REST FrameworkのAPI設計
- 不要なデータベース問い合わせの削減
affaan-m/ECC☆ 27.9万2026年10月12日 更新
XやLinkedInのつながりを現在の仕事や関心に合わせて見直します。整理・維持・追加の候補を理由付きで示し、本人の文体に合う連絡文の下書きまでまとめます。
- Xのフォロー解除候補を確認したいとき
- LinkedInのつながりを見直したいとき
- 今の関心に合うフォロー先を探したいとき
affaan-m/ECC☆ 27.9万2026年10月12日 更新
デスクトップアプリのクリックや文字入力を、利用者の作業を妨げにくい背景操作で進めるスキル。画面の要素を確認し、操作結果に応じて方法を切り替えます。
- 別のウィンドウで作業しながら自動操作
- アプリの入力欄やボタンの操作
- ブラウザのダイアログや拡張機能の操作
NousResearch/hermes-agent☆ 25.4万2026年10月13日 更新
Run the project's build / typecheck / lint / test commands and emit the build.passing + tests.passing signals devloop convergence reads.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
nexu-io/open-design☆ 10.1万2026年10月14日 更新
A consumer-feeling dating / matchmaking dashboard — left rail navigation, ticker bar of community signals, headline KPIs, a 30-day mutual-matches bar chart, and a match-rate trend block. Editorial typography, restrained accent. Use when the brief asks for a "dating site", "matchmaking", "community dashboard", "social network dashboard", or any consumer product where the data is the story.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
nexu-io/open-design☆ 10.1万2026年10月14日 更新
Turn messy user research notes, interviews, support tickets, surveys, and product context into an evidence-backed decision room: a single HTML artifact with an evidence ledger, theme map, confidence heatmap, opportunity matrix, decision memo, and experiment queue. Use when teams need to move from qualitative signals to product or design decisions without fabricating certainty.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
nexu-io/open-design☆ 10.1万2026年10月14日 更新
Senior Designer review: rates each design dimension 0-10, explains what a 10 looks like, and flags AI Slop signals. Useful as a gate before merging UI work.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
nexu-io/open-design☆ 10.1万2026年10月14日 更新
Train RuView models — camera-free WiFlow pose (10 sensor signals, no labels), camera-supervised pose (MediaPipe + ESP32 CSI → 92.9% PCK@20, ADR-079), RuVector contrastive embeddings (AETHER, ADR-024), domain generalization (MERIDIAN, ADR-027), local SNN environment adaptation, plus GPU training on GCloud and Hugging Face publishing. Use when building, fine-tuning, evaluating, or shipping a model.
日本語の概要は準備中です。原文の説明を表示しています。
ruvnet/RuView☆ 9.8万2026年10月13日 更新