「openai」の検索結果

Run or plan targeted DNA panel variant workflows that use UMIs, duplex consensus reads, molecular barcodes, low-frequency calling, target coverage, and panel-specific QC.

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Submit compact NCBI Datasets v2 requests for assembly, genome, taxonomy, and related metadata endpoints. Use when a user wants concise NCBI Datasets summaries; save raw JSON or text only on request.

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Dispatch bulk RNA-seq requests to FASTQ-to-count QC or count-matrix differential-expression skills using nf-core/rnaseq, STAR, Salmon, featureCounts, MultiQC, and R/Bioconductor workflows.

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Validate FASTQ inputs, run local FastQC/MultiQC QC, interpret QC signals, and optionally execute fastp or Cutadapt trimming branches without overwriting raw reads.

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Prepare meeting materials with Notion context and supplemental research; use when gathering context, drafting agendas/pre-reads, and tailoring materials to attendees.

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Dispatch ATAC-seq, ChIP-seq, CUT&RUN, or CUT&Tag requests to assay-specific QC, alignment, signal-track, peak-calling, consensus, and differential peak workflows.

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Research across Notion and synthesize into structured documentation; use when gathering info from multiple Notion sources to produce briefs, comparisons, or reports with citations.

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Submit compact RCSB PDB requests for core metadata, Search API queries, and FASTA downloads. Use when a user wants concise RCSB summaries; save raw JSON or FASTA only on request.

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Capture conversations and decisions into structured Notion pages; use when turning chats/notes into wiki entries, how-tos, decisions, or FAQs with proper linking.

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Kick off public shotgun metagenomics QC, host-depletion, taxonomic profiling, and functional profiling workflows using nf-core/taxprofiler, Kraken2, Bracken, MetaPhlAn, and HUMAnN.

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Route BCL, FASTQ, BAM/CRAM, count-matrix, or VCF sequencing requests to the right public NGS analysis skill and ask only the missing assay-specific setup questions.

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Run or plan bulk RNA-seq differential-expression analysis from count matrices with replicate, design formula, contrast, batch, normalization, QC plot, and result-table checks.

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Fetch compact TPMI PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise TPMI association results for one variant

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Submit compact PubChem PUG REST requests for compound properties, descriptions, assay summaries, and substance metadata. Use when a user wants concise PubChem summaries

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Check whether public NGS tools and packages already exist before downloading, installing, or running a sequencing pipeline.

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Route broad or ambiguous life-sciences research requests to the right skills, normalize core entities, optionally parallelize independent evidence gathering with subagents when available, and synthesize a concise evidence-backed answer. Use when a user asks a general life-sciences question that could span multiple sources or analysis types.

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Submit compact PRIDE Archive API requests for proteomics project discovery and project-level metadata. Use when a user wants concise PRIDE summaries

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Submit compact Human Protein Atlas requests for gene JSON, search downloads, and page-level tissue or cell-line lookups. Use when a user wants concise Human Protein Atlas summaries; save raw JSON or HTML only on request.

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Fetch compact FinnGen PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise FinnGen association results for one variant

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Submit compact BindingDB REST API requests for ligand-target binding lookups by PDB, UniProt, or similarity search. Use when a user wants concise BindingDB summaries; save raw payloads only on request.

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Submit compact BioStudies and ArrayExpress API requests for free-text search and accession-based study retrieval. Use when a user wants concise BioStudies summaries

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Submit compact ChEMBL API requests for activity, molecule, target, mechanism, and text-search endpoints. Use when a user wants concise ChEMBL summaries

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Activate when the user explicitly names the narrator skill or requests production-ready narration in either case: (1) numbered takes fitted to fixed video windows, or (2) one continuous long-form story read in a locked voice that must be measured and retried for timbre or internal pauses. Collect missing text, voice_id, or voice_type after activation; their absence is not a reason to skip this workflow. Own pacing, speech-duration gates, retries, and ready audio delivery; never time-stretch. Do not use for ordinary TTS, "read this aloud", an unconstrained voiceover, voice browsing, music, SFX, singing, dubbing existing speech, or voice cloning.

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Submit compact MGnify API requests for microbiome studies, samples, and biome metadata. Use when a user wants concise MGnify summaries

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