「arize」の検索結果

Use before implementing any feature, behavior change, or refactor - settles requirements and design, then gets the design independently reviewed and approved by the user before code is written

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変更内容からミューテーション/E2Eの推奨度を判定し、強く推奨・範囲が小さい・副作用なしのものは確認なしで実施し、それ以外は最後の報告で確認する。quality-check Step 5から参照実行されるほか、開発中の任意タイミングで単体実行できる。

実装前に呼ぶ。High/Medium リスク変更のテストオラクル（期待値の根拠）とファルシフィケーション項目を定義する。

開発サーバー・E2E・ブラウザ検証時に使用。既存プロセスを停止してからプロジェクト指定ポートで起動し、作業後に必ず停止する。

マージ前に必ず実行。静的チェック・テスト・体制レビュー（変更内容で決まる統合レビュアー＋反証型QA＋専門家最大1体、基本1サイクル）と追加テスト（test-recommendation）を実施し、通過後のみmainへのマージ・直接pushが可能。

ログ設計の妥当性チェック。一般的なログ基準と日本国内法的要件（電子帳簿保存法・個人情報保護法等）に基づき、ログ設計・実装を検証する。

init 直後またはスタック変更時に実行。静的チェック基準カタログ（A1〜F2）を判断基準に、プロダクトへ決定的チェック（Lint / 静的解析）を選択・配線・補完し、カバレッジマップ（採否台帳）と `lint:all` コマンドを整備する。

PR作成時に使用。実装レポート（計画との対応、品質チェック結果、レビュー指摘対応）をPR descriptionに出力する。

フロントエンド実装時に使用。コーディング規約準拠。コンポーネント設計。

機能・サービス・要件・前提条件などプロジェクトの知識をドキュメント化する。新規機能/サービスを作るとき、または既存機能を変更するときに必ず実行。新規ならドキュメントを作成、既存があれば更新する。

DBマイグレーション作成時に使用。バージョン番号競合防止。mainブランチ確認必須。

UI実装後の検証時に使用。agent-browser CLIでブラウザ上の動作を手動検証する。「UIを確認」「画面テスト」と言われたら使用（プロジェクトの E2E スイート実行は quality-check Step 5（推奨度・範囲で自動実施または確認）/ server-startup が担当）。

作業開始時に使用。mainブランチでの作業禁止。Issue先行作成必須。

Use when continuing implementation from an existing plan

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Git worktree を使った並列開発時に使用。配置・ポート割当・環境コピー・クリーンアップを標準化する。

Use when recurring process failures, obsolete rules, or an explicit user request call for harness improvement.

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git logからCHANGELOGとリリースノートを自動生成する。リリース作業時に使用。

DON'T USE THAT SKILL. IT'S JUST AN EXAMPLE. Summarize today's Gmail inbox by category with anonymized senders and subjects, then surface the top 3 emails to focus on next. Run only when the user types /email-summary.

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Stores and operates on sparse expression matrices for single-cell and large bulk RNA-seq, covering dgCMatrix/dgRMatrix/dgTMatrix when-each-is-fast, the dgCMatrix (CSC, R) <-> CSR (Python) implicit transpose, AnnData (cells-rows) <-> SingleCellExperiment (cells-cols) orientation flip, HDF5/h5ad vs Zarr cloud-native shift, HDF5SummarizedExperiment + DelayedArray for out-of-memory bulk, scanpy backed mode for large h5ad, the ~10-15% density crossover where dense beats sparse, 10X format proliferation (MTX vs CellRanger H5 vs h5ad), the dense-conversion memory blow-up, and Dask + Zarr for consortium-scale matrices. Use when choosing sparse format, working with single-cell-sized matrices, importing/exporting 10X, debugging R/Python interop transposes, processing matrices too large for RAM, or building cloud-native pipelines.

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Reads, inspects, and writes Flow Cytometry Standard (FCS) files from conventional, spectral, and mass cytometry (CyTOF), and parses FlowJo/Cytobank/Diva workspaces. Covers FCS 2.0/3.0/3.1/3.2 internals ($PnE linear-vs-log, $DATATYPE, $SPILLOVER vs SPILL vs $COMP, $TIMESTEP), channel/parameter metadata, the silent linearize/truncate defaults, and R (flowCore, flowWorkspace, CytoML) plus Python (FlowKit, readfcs) readers. Use when loading flow or mass cytometry data, mapping detector channels to antibodies, extracting the event matrix, choosing a reader, or bridging FCS to the scanpy/AnnData ecosystem before preprocessing.

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Segments the genome into chromatin states from combinatorial histone modification and chromatin factor ChIP-seq data. Uses ChromHMM (multivariate HMM on binarized signal, v1.27), Segway (Dynamic Bayesian Network on continuous signal), EpiSegMix (flexible-distribution HMM with duration modeling, 2024), EpiLogos (multi-biosample visualization), IDEAS (cell-type-aware joint), and full-stack ChromHMM (Vu Ernst 2022) for cross-cell-type segmentations. Handles state-count selection (15 vs 18 vs 25 states), binarization choice, OverlapEnrichment / NeighborhoodEnrichment downstream analysis, and cross-biosample integration. Use when learning chromatin states from a histone mark panel, characterizing learned states by genomic feature enrichment, or comparing chromatin landscapes across cell types.

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AI-powered presentation generation via the 2slides API — create slides from text, match a reference image style, summarize documents into decks, add AI voice narration, and export pages/audio. Use for any "make slides", "create a deck", or "slides from this document" request.

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Summarize existing QA criteria, cases, evidence, defects, limitations, authorization, and verdict without mutation.

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Enable, record, query, summarize, or verify the opt-in PWDEV Flow semantic audit trail. Use when the user asks what Flow actions occurred, wants audit integrity checked, or needs a portable JSONL record of workflow gates and artifacts.

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