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Self-modifying AI agent configuration via ruler + MCP + DuckDB. All behavior mods become one-liners.

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Lee Cronin's Assembly Theory for molecular complexity measurement and life detection via assembly index computation.

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Primary Python toolkit for molecular biology. Preferred for Python-based PubMed/NCBI queries (Bio.Entrez), sequence manipulation, file parsing (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), advanced BLAST workflows, structures, phylogenetics. For quick BLAST, use gget. For direct REST API, use pubmed-database.

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Audit Orchestrator

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ASI Agent-O-Rama Skill

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Infer gene regulatory networks (GRNs) from gene expression data using scalable algorithms (GRNBoost2, GENIE3). Use when analyzing transcriptomics data (bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq) to identify transcription factor-target gene relationships and regulatory interactions. Supports distributed computation for large-scale datasets.

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Comprehensive Python library for astronomy and astrophysics. This skill should be used when working with astronomical data including celestial coordinates, physical units, FITS files, cosmological calculations, time systems, tables, world coordinate systems (WCS), and astronomical data analysis. Use when tasks involve coordinate transformations, unit conversions, FITS file manipulation, cosmological distance calculations, time scale conversions, or astronomical data processing.

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Assets skill

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Suite of tools for creating elaborate, multi-component claude.ai HTML artifacts using modern frontend web technologies (React, Tailwind CSS, shadcn/ui). Use for complex artifacts requiring state management, routing, or shadcn/ui components - not for simple single-file HTML/JSX artifacts.

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Clarify requirements before implementing. Use when serious doubts araise.

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Python fuzzing with Atheris for discovering vulnerabilities in Python code.

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Backend API design, database architecture, microservices patterns, and test-driven development. Use for designing APIs, database schemas, or backend system architecture.

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Tour of Alice's heavily-customized terminal Emacs — Causal transients, Worlding org, proof tooling, MLX chat, voice, and clipboard.

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Creating algorithmic art using p5.js with seeded randomness and interactive parameter exploration. Use when users request creating art using code, generative art, algorithmic art, flow fields, or particle systems.

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Anoma intent-centric architecture for cross-chain obstruction passing with Geb semantics and Juvix compilation

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This skill should be used when working with annotated data matrices in Python, particularly for single-cell genomics analysis, managing experimental measurements with metadata, or handling large-scale biological datasets. Use when tasks involve AnnData objects, h5ad files, single-cell RNA-seq data, or integration with scanpy/scverse tools.

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Primary Aptos testnet wallet for transaction origination. Use when initiating test transactions.

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Comprehensive Artificial Life skill combining ALIFE2025 proceedings, classic texts (Axelrod, Epstein-Axtell), ALIEN simulation, Lenia, NCA, swarm intelligence, and evolutionary computation. 337 pages extracted, 80+ papers, 153 figures.

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Interact with Aptos blockchain - check balances, transfer APT, swap tokens, stake, and execute Move view functions. Features game-theoretic decision analysis with Nash equilibrium detection. All transactions require explicit approval.

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Persist and retrieve repository-specific knowledge using AGENTS.md files. Use when you want to save important information about a codebase (build commands, code style, workflows) for future sessions.

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Skill aptos-ecosystem

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Build AI agents on Cloudflare Workers using the Agents SDK. Load when creating stateful agents, durable workflows, real-time WebSocket apps, scheduled tasks, MCP servers, or chat applications.

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ANIMA as limit construction over condensed skill applications. Formalizes prediction markets as belief ANIMAs, structure dishes as condensation media, and impact as equivalence class change. Use for understanding agency at maximum entropy, compositional world modeling, or applying Scholze-Clausen condensed mathematics to AI.

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Aptos GF(3) Society Skill

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