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概要と使いどころ
Read, write, and convert multiple sequence alignment files using Biopython Bio.AlignIO. Supports Clustal, PHYLIP, Stockholm, FASTA, Nexus, and other alignment formats for phylogenetics and conservation analysis. Use when reading, writing, or converting alignment file formats.
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Select, document, download, and checksum-verify the most appropriate NCBI reference genome on an HPC cluster. Use whenever an analysis needs a reference genome, genome FASTA, genome annotation, assembly accession, or genome index and no exact approved assembly is already available; when a user asks to fetch a species genome from NCBI; or when a pipeline must resolve and cache a reproducible reference assembly on a remote cluster.
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Installs 425 bioinformatics skills covering sequence analysis, RNA-seq, single-cell, variant calling, metagenomics, structural biology, and 56 more categories. Use when setting up bioinformatics capabilities or when a bioinformatics task requires specialized skills not yet installed.
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Verification loop for Spring Boot projects: build, static analysis, tests with coverage, security scans, and diff review before release or PR.
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Query and interpret security logs you are authorized to read. Build detections and investigations without leaking PII.
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Analyze suspicious artifacts in an isolated lab to contain and recover. For incident responders on owned estates. Never write, improve, or distribute malware.
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Run the PageSpeed performance audit — 80/20 analysis of Core Web Vitals using the PageSpeed Insights API.
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Inventory staged local EcoSIM data at project startup and validate input readiness for a selected site, simulation period, and preprocessing or analysis workflow. Use before data-dependent work or when relevant inputs change.
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Iteratively detects and auto-fixes technical debt in a codebase using three quality criteria from debt-analysis references: conditional branch simplification, encapsulation, and separation of concerns. Applies fixes directly to code, runs existing tests to verify no regressions, re-analyzes, and loops until all high-severity issues are resolved or max iterations (5) reached. Use this skill when you want to automatically improve code quality with real code changes, reduce technical debt systematically, or clean up code to meet quality standards. Trigger on phrases like "fix technical debt", "clean up code quality", "refactor and fix issues", "improve code quality automatically", "apply debt fixes", "fix code problems", "eliminate debt".
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テストカバレッジのギャップを体系的に分析し、実際に動くテストコードを提案するスキル。 以下のようなときに使う： - テストカバレッジを改善したい・不足テストを特定したい - 「テストが足りない」「カバレッジを上げたい」「どこをテストすべき」 - 「未テストの関数」「what tests am I missing」「improve test coverage」「coverage gap」 t-wada式TDDの原則に基づき、テストの抜け漏れを特定して優先度付きで補完する。 引数: 分析対象ファイル・ディレクトリ（省略時はプロジェクト全体）
Reflection-first problem solving methodology for Convex development. Use before implementing any solution to ensure proper root cause analysis, 98% code confidence, and minimal change scope.
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動画の全フレームをローカルで数値解析し、代表画像、未確認変化の補完、指定区間の画像列を取得してCodexで視覚分析する。動画レビューや内容確認で画像抽出が必要なときに使う。専用OCRや生成サービスを使わず、意味判断は画像を見て行う。
Create new skills, modify and improve existing skills, and measure skill performance. Use when users want to create a skill from scratch, edit, or optimize an existing skill, run evals to test a skill, benchmark skill performance with variance analysis, or optimize a skill's description for better triggering accuracy.
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X-ray any AI model's behavioral patterns — refusal boundaries, hallucination tendencies, reasoning style, formatting defaults. No API key needed.
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Comprehensive patterns and techniques for analyzing compiled binaries, understanding assembly code, and reconstructing program logic.
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Azure AI Text Analytics SDK for sentiment analysis, entity recognition, key phrases, language detection, PII, and healthcare NLP. Use for natural language processing on text.
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Build document analysis applications using the Azure AI Document Intelligence SDK for Java.
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Build anomaly detection applications with Azure AI Anomaly Detector SDK for Java. Use when implementing univariate/multivariate anomaly detection, time-series analysis, or AI-powered monitoring.
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Discover and track emerging trends across Google Trends, Instagram, Facebook, YouTube, and TikTok to inform content strategy.
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Architectural decision-making framework. Requirements analysis, trade-off evaluation, ADR documentation. Use when making architecture decisions or analyzing system design.
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Reconstruct workflow behind a past coding-agent artifact using local ax sessions/commits/skills/tool traces. Use when asked how X was built.
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Enables ultra-granular, line-by-line code analysis to build deep architectural context before vulnerability or bug finding.
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Expert security auditor for AI Skills and Bundles. Performs non-intrusive static analysis to identify malicious patterns, data leaks, system stability risks, and obfuscated payloads across Windows, macOS, Linux/Unix, and Mobile (Android/iOS).
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Astropy is the core Python package for astronomy, providing essential functionality for astronomical research and data analysis.
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