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概要と使いどころ
Performs epidemiological analyses including disease modeling (SIR/SEIR), outbreak investigation, risk factor identification, incidence/prevalence estimation, and causal inference from observational data; trigger when users discuss disease spread, public health data, or populat...
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Generates Mermaid flowchart code and visual diagrams for pathophysiological.
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Use when refactoring research code for publication, adding documentation to existing analysis scripts, creating reproducible computational workflows, or preparing code for sharing with collaborators. Transforms research code into publication-ready, reproducible workflows. Adds documentation, implements error handling, creates environment specifications, and ensures computational reproducibility for scientific publications.
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Process CRISPR screening data to identify essential genes and hit candidates. Performs quality control, statistical analysis (RRA), and hit calling for pooled CRISPR screens including viability screens and drug resistance/sensitivity studies.
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Analyze data with `forest-plot-styler` using a reproducible workflow, explicit validation, and structured outputs for review-ready interpretation.
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Use when cleaning clinical trial data, preparing data for FDA/EMA submission, standardizing SDTM datasets, handling missing values in clinical studies, detecting outliers in lab results, or converting raw CRF data to CDISC format. Cleans and standardizes clinical trial data fo...
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Use poster layout planner for other workflows that need structured execution, explicit assumptions, and clear output boundaries.
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Mock interview preparation tool for residency Match interviews. Generates.
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Analyzes forest plots for meta-analysis, generating detailed descriptions and formatting figure legends in Chinese or English. Use when the user wants to interpret a forest plot image, describe its statistical significance (heterogeneity, p-value), and format the output with s...
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Generates the "Risk of Bias" results section for a meta-analysis based on assessment tables and statistics. Use when the user wants to draft the risk of bias analysis text from provided data tables.
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Rewrite drafts according to target writing style or target journal format. Triggers when user says "rewrite in XX style", "match this tone", "format for XX journal", "rewrite following this format". Input can be .docx / .md / .txt or conversation text.
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Use Bio.PDB to parse and analyze protein structures (PDB/mmCIF) for structural bioinformatics tasks; use when you need structure parsing, geometry calculations, or structural comparison/superposition.
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Use Biopython to read/write/convert biological sequence files (FASTA/GenBank/FASTQ, etc.) and perform basic sequence operations; use when you need reliable sequence I/O, lightweight sequence manipulation, or scalable processing of large sequence datasets.
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Use when creating radiology educational quizzes, preparing board exam questions, or studying medical imaging cases. Generates interactive quizzes with X-ray, CT, MRI, and ultrasound images for medical education.
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A comprehensive toolbox for computational molecular biology; use it when you need programmatic sequence/structure parsing, batch bioinformatics pipelines, or automated NCBI/BLAST workflows.
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Predict challenging questions for presentations and prepare structured responses.
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Generate medical referral letters with patient summary, reason for referral, key findings, and requested next steps; use when transferring care or communicating with another clinician or department.
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Sequence alignment and alignment file processing with Biopython (Bio.Align/Bio.AlignIO), triggered when you need global/local pairwise alignment, MSA read/write/format conversion, or alignment statistics/filtering.
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Prepare FDA/EMA regulatory submissions (IND/NDA/BLA/510(k)/PMA/MAA) in CTD format. Generate module outlines (Modules 1-5), run ICH compliance checks (ALCOA+, E6 GCP, Q1-Q12), verify data integrity, and produce submission-ready dossiers with cover letters and checklists.
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Helps faculty and mentors draft standardized recommendation letters for.
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Polish reviewer-response letters by softening defensive language, preserving factual meaning, and keeping responses professional, concise, and publication-appropriate.
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Generate ethical, compliant, and patient-friendly recruitment advertisements for clinical trials.
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Advanced Biopython modules for motifs, population genetics, sequence utilities, restriction analysis, clustering, and GenomeDiagram visualization; use when you need extended bioinformatics analysis beyond basic sequence I/O and alignment.
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One-click synchronization and standardization of reference formats in literature management tools, intelligently fixing metadata errors.
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