「panel」の検索結果

Detect somatic and germline copy number variants from targeted, exome, and whole-genome sequencing with CNVkit, a read-depth caller that combines on-target and off-target (antitarget) coverage. Covers panel-of-normals construction, flat-reference tumor-only calling, hybrid/amplicon/WGS modes, CBS vs HMM segmentation selection, purity-aware integer calling, and reconciliation against GATK and allele-specific callers. Use when calling CNVs from hybrid-capture panels or exomes, deciding whether CNVkit (depth-only) is the right tool versus an allele-specific caller, building a panel of normals, diagnosing flat-reference false positives, or interpreting log2 ratios into copy-number states.

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Calls microsatellite instability from WES/WGS/targeted-panel with MSIsensor, MSIsensor-pro, MSIsensor-ct (panel-aware), MSIngs, MANTIS, MSIPanel, MSIDetect, and ngsMSI for FDA pembrolizumab MSI-H pan-tumor / Lynch syndrome / dMMR ICI biomarker. Use when stratifying ICI eligibility (Le 2015), pairing MSI with TMB-H (Sha 2020 / Salem 2018), screening Lynch syndrome (universal IHC + MSI), or distinguishing MSI-H tumors from POLE-exo hypermutator with overlapping signatures.

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Trim PCR primers from aligned reads in amplicon-panel BAMs using samtools ampliconclip. Use when processing SARS-CoV-2 ARTIC, hereditary cancer panels, ctDNA hot-spot panels, or any amplicon assay where primer-derived bases would falsely confirm reference at primer footprints.

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Detect somatic and germline copy number variants from targeted, exome, and whole-genome sequencing with CNVkit, a read-depth caller that combines on-target and off-target (antitarget) coverage. Covers panel-of-normals construction, flat-reference tumor-only calling, hybrid/amplicon/WGS modes, CBS vs HMM segmentation selection, purity-aware integer calling, and reconciliation against GATK and allele-specific callers. Use when calling CNVs from hybrid-capture panels or exomes, deciding whether CNVkit (depth-only) is the right tool versus an allele-specific caller, building a panel of normals, diagnosing flat-reference false positives, or interpreting log2 ratios into copy-number states.

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Calls microsatellite instability from WES/WGS/targeted-panel with MSIsensor, MSIsensor-pro, MSIsensor-ct (panel-aware), MSIngs, MANTIS, MSIPanel, MSIDetect, and ngsMSI for FDA pembrolizumab MSI-H pan-tumor / Lynch syndrome / dMMR ICI biomarker. Use when stratifying ICI eligibility (Le 2015), pairing MSI with TMB-H (Sha 2020 / Salem 2018), screening Lynch syndrome (universal IHC + MSI), or distinguishing MSI-H tumors from POLE-exo hypermutator with overlapping signatures.

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Trim PCR primers from aligned reads in amplicon-panel BAMs using samtools ampliconclip. Use when processing SARS-CoV-2 ARTIC, hereditary cancer panels, ctDNA hot-spot panels, or any amplicon assay where primer-derived bases would falsely confirm reference at primer footprints.

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Verify every visual-evidence artifact (screenshot/GIF/recording) attached to a PR carries a provenance manifest binding it to real daemon-backed truth — daemon port, run id, transcript head hash, agent node id, commit, and an honest real/fixture/mock source label — and that operator-control-panel PRs cover the required set of proof states. Use when gating a PR's proof artifacts before merge, auditing whether a "LIVE" visual claim is backed by a real daemon run versus a reused or fixture-backed mock, or defining the required state-coverage set for a control-panel change. NOT for the capture technique itself — headless Playwright, `screencapture -x -l`, non-interruptive capture (use port-daddy-agent-skill's visual-evidence doctrine), designing the receipt body schema an artifact attaches to (use agent-work-receipt-designer), or the broader dogfood/Potemkin product-quality bar (use multi-agent-authoring-product-bar).

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No-trace removal recipe for a window panel or overlay. Use when deleting, killing, or retiring a window/overlay, or consolidating X into Y and deleting X ('kill this panel', 'remove the X window'). NOT for adding or opening an overlay (use overlay-system).

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Use when the user asks to "optimize entity presence", "build knowledge graph", "improve knowledge panel", "entity audit", "establish brand entity", "Google does not know my brand", "no knowledge panel", or "establish my brand as an entity". Works standalone with public search and AI query testing; supercharged when you connect ~~knowledge graph + ~~SEO tool + ~~AI monitor for automated entity analysis. For structured data implementation, see schema-markup-generator. For content-level AI optimization, see geo-content-optimizer.

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Crabboxの一時環境でネイティブアプリやWebアプリを起動し、チャットのサイドパネルに表示します。動作確認や画面操作、終了時の環境整理も扱います。

• ネイティブアプリを起動して見たいとき
• Webアプリのプレビュー
• 画面操作によるアプリのテスト

SNS向けの正方形カード3枚を、見出しがつながるシリーズとして作成します。ブランド表記や連番をそろえ、映画のような色調を持つHTMLにまとめます。

• Instagramの3枚投稿を作りたいとき
• LinkedInの連続投稿用デザイン
• Xのスレッド用カード制作

既存のHTMLに調整パネルを付け、配色・文字サイズ・余白・テーマ・動きを画面上で変更するスキル。設定を保存し、エージェントへの再依頼なしに見た目を試せます。

• LPの配色や余白を詰めたいとき
• ブランドやデザインの違いを実演
• 見た目を調整できる単体デモの制作

デスクトップ向けランディングページの構成を灰色のボックスで描き、番号付きの注釈と仕様パネルで、配置や実装時の要点を共有するワイヤーフレームを作ります。

• デスクトップ向けLPの構成検討
• 開発担当への仕様メモ共有
• ナビや訴求エリアの配置確認

シニアデザイナーの面接に向け、3つの制作事例と判断の根拠を採用担当者に伝えるHTML資料を作るスキル。黄のアクセントと高密度な誌面風レイアウトで構成します。

• シニアデザイナー面接の作品集発表
• 3つの制作事例を整理したいとき
• デザイン判断の理由を伝えたいとき

管理・分析画面の試作を、単一のHTMLファイルで作るスキル。既存のデザインに沿って、主要指標のカードやグラフ、表を備えた画面を組み立てます。

• 売上ダッシュボードの試作
• アクセス・利用状況の分析画面の検討
• 運用状況を確認する管理画面の設計

企業やブランドのトップページにある組織情報の構造化データを点検・追加し、名称やロゴ、公式SNS、連絡先をGoogleに伝える記述を整えるスキル。

• 企業トップページの組織情報を点検
• ブランド名やロゴ、連絡先のJSON-LD追加
• 公式SNSへのリンクを確認したいとき

Analytics de produto — PostHog, Mixpanel, eventos, funnels, cohorts, retencao, north star metric, OKRs e dashboards de produto.

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Create visually rich, robust TypeScript UI components with panel architecture, combining enhanced features like retry logic, state persistence, and dynamic styling with a systematic workflow for visual enhancements.

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Enhanced dashboard panel component with robust error handling, retry logic, and localStorage persistence for state management.

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Create a dashboard panel component with advanced dynamic content updates and robust error handling, including retry logic and state management, using vanilla TypeScript DOM API.

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CSS grid layout system for a responsive panel dashboard with dark theme. Uses CSS custom properties, auto-fill grid, and monospace font aesthetic inspired by worldmonitor.

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Multi-layer workflow for creating complete panel features by analyzing existing patterns and generating coordinated server routes, services, UI components, registration, styling files, AND explicitly wiring new handlers into the server's dispatch table (supports both Express middleware and manual http.createServer switch/case patterns).

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Unified dashboard panel pattern combining circuit breaker resilience with enhanced UI features like retry logic, state persistence, and detailed error handling.

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Unified dashboard panel component with robust error handling, retry logic, state persistence, and vanilla TypeScript implementation.

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