「org」の検索結果

生物医学論文や規制当局の文書、臨床試験情報を検索し、複数資料から必要な情報を抽出して、根拠の行にリンクした引用付きで整理するスキル。

• テーマに合う生物医学論文の検索
• 複数論文の方法と結果の比較
• 規制文書や臨床試験を調べたいとき

病理の全スライド画像から組織領域を見つけ、学習用の小画像を切り出します。抽出位置の確認や染色の色調統一、患者単位でのデータ分割まで支援するスキル。

• 病理画像から学習用画像を抽出したいとき
• 組織マスクと抽出位置を確認したいとき
• H&E染色の色調を統一したいとき

がんモデルの遺伝子依存性や薬剤感受性をDepMapデータで調べ、バイオマーカー別の比較や遺伝子間の関連解析から、研究候補を絞り込むスキル。

• がんモデルの依存遺伝子を順位付けしたいとき
• バイオマーカー別に依存性を比較したいとき
• 依存性パターンが似た遺伝子の探索

モデルやプロンプトの改善を複数の実験で進め、仮説と結果をツリーに記録します。実験から得た知見を次の試行に引き継ぎ、探索用とは別の評価で改善候補を比較します。

• モデル学習の改善案を実験で比較したいとき
• エージェントの成功率を改善したいとき
• プロンプトの変更を定量評価したいとき

DNAnexus上のゲノム解析を構築・実行し、運用するためのスキルです。データ転送、解析アプリの設定検証、ワークフローの取り込み、実行監視や費用管理を支援します。

• ゲノム解析データの転送と整理
• アプリ設定の検証とapplet作成
• WDL・CWL・Nextflowの取り込み

タンパク質配列の空欄補完や特徴量の抽出、全原子構造の予測をBiohubのPython SDKで進めます。ローカル実行とホスト型APIの使い分け、出力の確認を支援します。

• タンパク質配列の伏せた位置を補完したいとき
• タンパク質配列から数値特徴量を抽出
• タンパク質の全原子構造を予測したいとき

公開の単一細胞・空間的な遺伝子発現データを組織や疾患で絞り込み、必要な発現値や細胞情報を取得して、集計やデータセット横断の比較分析につなげるスキル。

• 組織内の細胞種を調べたいとき
• マーカー遺伝子の発現値を取得したいとき
• 組織やデータセットを横断比較したいとき

単一細胞解析の測定値と細胞・遺伝子の情報をまとめ、h5adやZarr形式で読み書きします。データの抽出・結合や、大規模データの省メモリ処理も支援します。

• h5ad・Zarrの読み書き
• 実験データをラベル付きで結合
• 細胞や遺伝子を条件で抽出したいとき

科学論文をテーマやDOIで検索し、本文から抽出された主張と実験・統計・限界を確認します。出典をたどれる根拠表の作成や、要旨だけでは分からない詳細の調査を支援します。

• 研究テーマに合う論文を探したいとき
• 要旨にない実験条件を調べたいとき
• 出典付きの根拠表の作成

科学データを必要な分だけ取得し、大容量ファイルの履歴と保存先を管理します。分析コマンドと入出力の記録、再実行、データセットの公開までを支援します。

• 必要な研究データだけ取得したいとき
• データ未取得のファイルを調べたいとき
• 分析手順の記録と再実行

学術論文を複数のデータベースで探し、著者・掲載誌などの書誌情報を確認してBibTeX形式に整理します。参考文献の重複や記載漏れ、原稿との対応も点検できます。

• 複数の学術データベースで論文を探したいとき
• DOIをBibTeXに変換したいとき
• 参考文献の重複を整理したいとき

データ収集前に、研究の目的に合う実験方法や対象の割り付け、実施順序を設計し、条件の混同や反復の数え違いを避けるための配置表作成を支援するスキル。

• 被験者や試料の無作為割り付け
• 複数の実験要因を絞り込みたいとき
• バッチ・日・プレート位置を考慮した配置

Obsidianなどで使う.canvasファイルを作成・編集し、文章やファイル、リンクを線やグループで整理して、マインドマップやフローチャートにまとめます。

• アイデアをマインドマップにしたいとき
• 作業手順をフローチャートにしたいとき
• 調査メモとリンクの整理

社会科学や隣接する人文学の関心を研究課題へ絞り込み、文献整理から証拠の検討、新規性や実行可能性の点検、論文での主張の強さの調整まで支援します。

• 広い関心から研究質問を絞りたいとき
• 文献整理と未解決問題の把握
• 査読者の視点で新規性を点検したいとき

複数の情報源から学術文献を探し、引用情報の照合や参考文献ファイルの変換、PubMedの検索式づくり、自己引用を除いた被引用の調査まで支援します。

• 複数の情報源で文献を探したいとき
• 文書内の引用情報を検証したいとき
• MeSHを使ったPubMed検索式の設計

科学論文を1本ずつ読み込み、手法、主張と実験の根拠、限界、研究アイデアを16項目のカードに整理するスキル。出典を示し、資料不足で評価できない部分も明記します。

• 論文の手法と前提を分解したいとき
• 主張と実験の根拠を照合したいとき
• 論文の限界や根拠の不足の整理

科学論文や研究メモから、原論文の図と発表者ノートを備えた中国語の学術発表用PPTXを作成し、論文の種類に応じた構成づくりや既存スライドの修正も支援します。

• 研究室で論文を紹介したいとき
• 論文を基にした学会・学位審査の資料作成
• 既存の学術スライドを修正したいとき

著者が用意した研究の証拠を基に、英語論文の各章や初回投稿資料を起草します。主張と根拠のつながりを整理し、論文の種類や投稿先に合わせた構成の見直し、本文の圧縮も支援します。

• 研究メモから要旨や序論を起草したいとき
• 結果と考察の論証を組み直したいとき
• 本文を短くし補足説明を整理したいとき

研究計画書や研究費申請書を、根拠資料と論証の整理から作成・改稿・点検するスキル。主張と証拠の対応、実現可能性、引用や表記を確認し、修正点を示します。

• 着想から研究計画書を作りたいとき
• 研究費申請書の改稿
• 主張と根拠の対応を点検したいとき

論文のデータ・コード公開声明を作成・点検し、各データの入手先や利用条件、保存先、引用情報を整理します。データを見つけて再利用するためのメタデータも確認します。

• データ・コード公開声明の作成
• 研究データの保存先と入手経路の整理
• データ引用とメタデータの点検

実験中の写真・音声・メモを、管理用の項目を備えたMarkdownの実験ログに整理し、実験IDや試料のバッチID、元の添付資料もひも付けて保存します。

• 写真や音声から実験ログを作りたいとき
• 同じ試料の複数実験を追跡したいとき
• 実験記録と原資料をまとめて保管したいとき

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