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学術論文を投稿先との適合性、研究方法、専門分野、異分野、反論の5つの観点から模擬査読します。個別の査読報告を統合し、編集判断と改訂項目にまとめます。

• 投稿前に模擬査読を受けたいとき
• 研究方法と統計の妥当性を確認したいとき
• 中心的な主張への反論を検討したいとき

研究テーマの検討から論文の執筆、引用・データの確認、査読と改稿、最終形式への整備までを段階的に進めます。関連スキルを連携させ、進捗と成果物を記録します。

• 研究テーマから論文を完成させたいとき
• 初稿や査読コメントから再開したいとき
• 検証・改稿・作成過程の記録

待ち行列や生産・物流の流れをSimPyでモデル化し、待ち時間や資源の利用状況を調べます。実行上限の設定から監視、テスト、反復実験の分析まで支援します。

• 窓口の人数別に待ち時間を比べたいとき
• 生産・物流で設備の取り合いを調べたいとき
• 優先処理や作業中断をテストしたいとき

単一細胞の遺伝子発現などの測定データに確率モデルを当てはめ、実験間の差を調整した統合、細胞種の推定、複数種類のデータ解析を進めるスキルです。

• 単一細胞RNAのバッチ間統合
• 部分ラベルや参照による細胞種推定
• RNAとタンパク質・ATACの解析

多数の特徴を持つデータをUMAPで少ない次元にまとめ、2D・3Dの可視化やグループ分けの前処理を支援します。設定の比較、新しいデータの変換、結果の安定性確認も扱います。

• 多くの特徴を持つデータを図示したいとき
• HDBSCAN用の特徴を準備したいとき
• 一部のラベルを次元削減に使いたいとき

タンパク質の構造予測や分子設計をクラウドで実行するため、ツール選択から設定検証、ジョブ投入、結果取得まで支援します。手元のGPUは不要です。

• クラウドでタンパク質構造を予測したいとき
• 結合タンパク質や抗体を設計したいとき
• 複数配列をまとめて解析したいとき

ターミナルで動くコーディング用エージェント基盤のPiを導入・設定し、独自の拡張や画面の作成、別アプリへの組み込み、外部ツールとの連携を支援します。

• Piの導入とモデル設定
• 独自ツールや操作画面の作成
• 別アプリへのPiの組み込み

分子の性質予測や立体構造の探索、タンパク質との結合姿勢の推定をクラウドで進めます。Python APIで多数の化合物をまとめて処理し、複数の計算をつなげます。

• 化合物ライブラリの性質を予測したいとき
• 分子の立体配座や互変異性体の探索
• タンパク質との結合姿勢を調べたいとき

分子構造データの読み書きから、分子量などの特性計算、類似分子・部分構造の検索、反応処理、2D・3D構造の生成まで、Pythonで細かく制御するスキル。

• 分子データの特性を一括計算したいとき
• 構造が似た分子を探したいとき
• 特定の部分構造で分子を絞り込む作業

DNA・RNA・タンパク質の配列処理から系統樹、多様性指標、群間差の検定まで、生物データや微生物群集の解析とファイル変換をPythonで進めるスキル。

• 微生物群集の多様性を比較したいとき
• DNA・RNA・タンパク質の配列照合
• 系統樹の構築と比較

実験器具に合わせたホルダーや治具、流路チップなどを寸法変更できるCADモデルで設計します。規格寸法と形状を確認し、製作用のSTEP・STL・DXFを出力します。

• プレート・キュベット・チューブの保持具設計
• 光学定盤用のマウントやアダプター製作
• 流路チップや型のモデリング

病理の全スライド画像から組織領域を見つけ、学習用の小画像を切り出します。抽出位置の確認や染色の色調統一、患者単位でのデータ分割まで支援するスキル。

• 病理画像から学習用画像を抽出したいとき
• 組織マスクと抽出位置を確認したいとき
• H&E染色の色調を統一したいとき

タンデム質量分析（MS/MS）の測定データを整え、ピークの選別や類似度計算、参照ライブラリとの照合を通じて化合物候補を調べるPython向けスキル。

• MS/MSデータの前処理と測定情報の統一
• 参照ライブラリから化合物候補を探したいとき
• 類似度と一致ピーク数による比較

統計、年表、比較、手順などを説明する図解画像を文章から生成し、用途別の品質レビューと再生成を支援します。提供データや任意の調査結果を材料にできます。

• 報告書の統計を図解したいとき
• プロジェクトの節目を年表にする
• 商品の特徴を視覚的に比較する

ゲノム上の領域データを検証し、重なりの件数や共通部分、被覆率を調べます。Gtarsを使う解析に向けて、座標や参照配列の整合性、実行条件も整理します。

• BED座標と参照ゲノムを検証したいとき
• ゲノム領域の重なりと集合比較
• ゲノム領域をトークン化したいとき

20以上の生命科学データベースを横断し、遺伝子情報や配列、タンパク質構造、発現・疾患との関連をCLIやPythonから手早く調べるスキル。

• 遺伝子の詳細と配列を調べたいとき
• タンパク質の構造や残基注釈の確認
• 組織での発現や疾患との関連の比較

医療機器や試験・医療検査室のISO関連資料を整理し、証拠記録の構造を確認します。文書・リスク管理・是正処置の不足を、人によるレビュー用にまとめます。

• 管理文書と実施記録を整理したいとき
• 医療機器のリスク・設計記録の照合
• 是正処置と供給者管理の証拠確認

CADファイルからカスタム部品を製造するため、Fictivのブラウザ画面で加工方法や材質を設定し、見積もり比較、製造上の警告確認、発注・追跡を進めるスキル。

• CAD部品の製造見積もりを取りたいとき
• 材質・数量・納期ごとの価格比較
• 製造上の警告やアップロード不具合の確認

次世代シーケンスの解析データを整え、試料間の比較や品質確認、ヒートマップ作成を進めます。BAMからbigWigへの変換と、実験に応じた正規化も扱います。

• BAMを正規化してbigWigに変換
• シーケンス品質や反復試料の一致確認
• 転写開始点周辺のヒートマップ作成

bulk RNA-seqの生データや定量結果を、遺伝子ごとの発現量を比較するためのカウント表に整えます。品質確認やサンプル情報の検証、PyDESeq2への引き渡しを支援します。

• FASTQから遺伝子カウント表を作りたいとき
• nf-core/rnaseqを設定したいとき
• Salmonなどの定量結果を統合したいとき

MRIや脳波などの研究データを共通規格BIDSに沿って整理し、ファイル検索、規格への適合確認、DICOM変換、付随情報の作成を支援します。

• MRIや脳波データを規格に沿って整理
• 参加者・セッション・課題別の検索
• DICOM変換と付随情報の作成

時間に沿って変化するデータをaeonで分析し、分類・回帰・クラスタリングから将来予測、異常検知、似た波形の検索まで、手法の選択と実装を支援するスキル。

• 時系列の分類や連続値の推定
• 似た時系列をまとめたいとき
• 将来の値を予測したいとき

エージェントの使用モデルや処理上限、ツール設定を調べ、機能が使えない原因の確認や許可された設定の変更、セッション中の一時メモの保存を行います。

• 機能が使えない原因を調べたいとき
• 大きな作業の前に処理容量を確認
• 許可されたモデル設定や処理上限の調整

実務経験を持つ専門家や経営幹部を探し、質問への文章・音声回答や短時間の通話を依頼します。顧客調査や経験者への相談に使え、無料テストで流れを試せます。

• 実務経験者の知見を集めたいとき
• 見込み顧客へのインタビュー
• 指名した専門家との短時間の通話