「python」の検索結果

研究初期のアイデアを出し、前提や根拠、不確実性を分けて整理します。反対意見や評価理由も残しながら、次に検討する研究方向の優先順位づけを支援します。

• 新しい研究テーマの方向性を探る
• 研究会議の前に候補案を整理する
• 明示した評価基準で研究案を比較する

科学的な模式図やフローチャートの下書きを文章からPNGで生成し、AIの品質レビューで改善が求められた場合は再生成して、画像と評価ログを保存するスキル。

• ニューラルネットワーク構造図の下書き
• 生物学的経路を図解したいとき
• 研究手順のフローチャート作成

クライオ電子顕微鏡の単粒子解析で、粒子データの整合性確認からRELIONによる三次元構造の精密化、独立した半マップの検証・後処理までを進めるスキル。

• 粒子メタデータと画像の整合性確認
• 選別済み粒子を精密化したいとき
• 独立した半マップの一致度確認

科学論文や研究報告を根拠資料と結び付けて執筆・改稿し、数値や引用の整合性、報告指針の項目、著者情報や申告事項を点検するスキルです。

• 確認済みの根拠から論文を執筆したいとき
• 本文・図表・結果の整合性確認
• 参考文献と報告指針の記載状況点検

合金の組成・圧力・温度と熱力学データベースを指定し、平衡状態で存在する相の割合や組成を計算して、物質収支と計算条件への安定性を確認するスキル。

• 合金組成から平衡相の割合を求めたいとき
• 指定温度ごとの安定相の比較
• 物質収支とサンプリング安定性の確認

ベイズ統計モデルを組み立て、階層モデルの推定、予測の不確実性の評価、計算の診断、予測結果の点検、モデル比較までをPyMCで進めるスキル。

• 回帰の効果と不確実性を推定したいとき
• 患者や施設ごとの差をモデル化したいとき
• サンプリング診断と予測の点検

共通の由来を持つ塩基・タンパク質配列を整列し、系統樹の推定から枝の支持値の確認、図示まで進め、遺伝子やタンパク質群の進化的な関係を調べるスキル。

• 塩基配列から遺伝子系統樹を作りたいとき
• タンパク質群の進化的関係の比較
• 枝の支持値と解析ログの確認

薬物の濃度推移や効果のデータから、体内への曝露量の算出、モデルの当てはめ、投与間隔のシミュレーションを行い、研究用の解析結果と前提条件を整理します。

• 濃度データから曝露量と半減期を求めたいとき
• 薬物濃度の推移モデルを比較したいとき
• 研究用に投与間隔を検討したいとき

量子回路を作り、手元のシミュレーションからIBMの量子実機での実行まで支援します。実機の制約に合わせた回路変換や、測定結果・誤差の確認も扱うスキル。

• 量子回路を手元で作成・試行したいとき
• IBMの量子実機向けに回路を変換したいとき
• 測定結果や期待値を比較したいとき

保存済みのPrimeKGデータから、遺伝子・薬剤・疾患・症状の関係を調べます。直接の関連や中間要素を一つ挟む経路を、関係の種類とデータの出所を保って取得します。

• 遺伝子・薬剤・疾患の関連を調べたいとき
• 疾患に関連する遺伝子・薬剤・症状の整理
• 二つの要素を結ぶ短い経路の探索

実行中の処理が使えるCPU・メモリ・ディスクなどの資源と制限を調べ、識別情報を除いたJSONと、並列数やメモリ配分を検討するための目安を作るスキル。

• 大きなローカル処理の並列数を決めたいとき
• コンテナ内のCPU・メモリ制限を確認したいとき
• 変更前後の計算資源を比較したいとき

1000 Genomes Projectの3,202人を対象に、条件に合う遺伝的変異や保有者を検索し、変異の頻度、参加者間の血縁関係まで調べるスキル。

• 条件に合う変異の保有者を探したいとき
• 指定した参加者の変異を調べたいとき
• 参照配列と両コピーが一致する人の抽出

Neuropixelsの神経記録を読み込み、ノイズ処理や電極との位置ずれの補正、神経細胞ごとの信号分離、品質評価、確認用の図やデータの出力まで支援します。

• SpikeGLX・Open Ephys・NWBの確認と前処理
• 信号分離前の位置ずれを確認・補正したいとき
• 品質指標に基づいて解析対象を選びたいとき

PDFやOffice文書などを、見出しや表の構造を保ったMarkdownに変換します。一括処理や論文整理にも対応し、検索・テキスト分析・AIへの資料取り込みを支援します。

• PDFやOffice文書のMarkdown化
• 資料フォルダを一括変換したいとき
• 論文を出典情報付きで整理したいとき

ラベル付き文章データから仮説候補を作るLLM処理の計画と監査を支援します。設定やデータ分割の確認、費用見積もり、保存済み予測の評価まで扱います。

• 実行前にタスク設定を点検したいとき
• 学習・テスト間の重複を調べたいとき
• モデル呼び出し前に費用を見積もりたいとき

病理の全スライド画像から組織領域を見つけ、学習用の小画像を切り出します。抽出位置の確認や染色の色調統一、患者単位でのデータ分割まで支援するスキル。

• 病理画像から学習用画像を抽出したいとき
• 組織マスクと抽出位置を確認したいとき
• H&E染色の色調を統一したいとき

心電図・呼吸・皮膚電気活動などの生体信号をNeuroKit2で研究分析するために、前処理、時刻合わせ、心拍変動や刺激前後の解析手順の構築・点検を支援します。

• 前処理前に生体信号の品質を点検
• 研究用の心電図・心拍変動解析
• イベント区間と基準補正の設計

PubMedやarXivなど18の学術APIを目的に応じて選び、論文・プレプリント・引用関係・公開全文を探して、検索条件や取得元を再確認できる形で結果をまとめます。

• 研究テーマの論文・プレプリント検索
• DOI・PMID・arXiv IDで論文を照会
• 公開されている全文やPDFを探したいとき

薬剤・遺伝子・疾患の関係を、種類や探索範囲を指定してARAXで調べます。直接の関係や中間要素を一つ挟む経路を取得し、出典や関連文献も確認するスキル。

• 薬剤と遺伝子の関係を調べたいとき
• 薬剤と疾患を結ぶ経路の探索
• 関連文献と元データの出典確認

流れを撮影した2枚の粒子画像から、各地点の速度と向きを求めます。OpenPIVで画像の前処理、誤ったベクトルの補正、渦度・ひずみ速度の計算、可視化まで扱います。

• 実験画像から速度分布を求めたいとき
• 不正な速度ベクトルの検出と補間
• 渦度とひずみ速度の計算

プール型CRISPRスクリーニングの配列データやカウント表を解析します。ガイドライブラリと反復実験の品質を確認し、増加・減少した遺伝子を効果量と統計指標付きで順位付けします。

• FASTQからガイド別リードを集計したいとき
• ライブラリと反復実験の品質確認
• 処理群と対照群のスクリーニング比較

医療機器や試験・医療検査室のISO関連資料を整理し、証拠記録の構造を確認します。文書・リスク管理・是正処置の不足を、人によるレビュー用にまとめます。

• 管理文書と実施記録を整理したいとき
• 医療機器のリスク・設計記録の照合
• 是正処置と供給者管理の証拠確認

一次元NMRの生信号をスペクトルに変換し、位相・ベースライン補正からピーク候補の抽出、符号付き積分までを、処理条件の記録とともに進めるスキル。

• 一次元NMRの生信号を処理したいとき
• 基準信号とピーク位置を照合したいとき
• 位相とベースライン補正の点検

OMERO.serverの顕微鏡画像データを対象範囲を指定して一覧化し、注釈や関心領域の情報出力、画像の入出力計画、変更内容の事前確認を支援します。

• 対象を絞ったOMEROデータの一覧化
• 注釈・関心領域をJSONに出力したいとき
• 顕微鏡画像の入出力計画