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概要と使いどころ
Fetch compact FinnGen PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise FinnGen association results for one variant
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Submit compact bioRxiv and medRxiv API requests for details, publication-linkage, and DOI lookups. Use when a user wants concise preprint metadata summaries
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Submit compact MGnify API requests for microbiome studies, samples, and biome metadata. Use when a user wants concise MGnify summaries
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Submit compact ChEBI 2.0 API requests for chemical search, compound lookup, ontology traversal, and structure metadata. Use when a user wants concise ChEBI summaries
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Fetch compact BioBank Japan PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh38, or GRCh37 input and resolving to the required GRCh37 query. Use when a user wants concise BBJ association results for one variant
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Submit compact GWAS Catalog REST API v2 requests for studies, associations, SNPs, EFO traits, genes, publications, loci, and metadata. Use when a user wants concise GWAS Catalog summaries
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Submit compact BindingDB REST API requests for ligand-target binding lookups by PDB, UniProt, or similarity search. Use when a user wants concise BindingDB summaries; save raw payloads only on request.
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Submit compact IPD REST requests for HLA allele and cell-level metadata using the public IPD query API. Use when a user wants concise IPD summaries; save raw JSON or text only on request.
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Submit compact gnomAD GraphQL requests for frequency, gene constraint, and variant context queries. Use when a user wants concise gnomAD summaries
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Submit compact ENCODE REST API requests for object lookups, portal-style search, and metadata retrieval. Use when a user wants concise ENCODE summaries
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Submit compact AlphaFold Protein Structure Database API requests for prediction, UniProt summary, sequence summary, and annotation lookups. Use when a user wants AlphaFold metadata or concise structure summaries
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Submit compact ChEMBL API requests for activity, molecule, target, mechanism, and text-search endpoints. Use when a user wants concise ChEMBL summaries
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Submit compact Bgee SPARQL requests for healthy wild-type expression metadata and ontology-aware lookup patterns. Use when a user wants concise Bgee summaries; save raw results only on request.
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Submit compact EFO OLS4 requests for search, term lookup, children, and descendants. Use when a user wants concise EFO resolution or ontology-expansion summaries
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Submit compact HMDB search requests for metabolites, proteins, diseases, and pathways. Use when a user wants concise HMDB summaries
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Submit compact Ensembl REST API requests for lookup, overlap, cross-reference, and variation endpoints. Use when a user wants concise Ensembl summaries
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Submit compact Genebass gene burden requests for one Ensembl gene ID and one burden set. Use when a user wants concise Genebass PheWAS summaries
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Submit compact EVA REST requests for species metadata and archived variant lookups. Use when a user wants concise European Variation Archive summaries
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Submit compact CIViC GraphQL requests for cancer variant interpretation schema inspection and targeted evidence retrieval. Use when a user wants concise CIViC summaries
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Submit compact eQTL Catalogue API requests for association retrieval and documented metadata endpoints. Use when a user wants concise public eQTL Catalogue summaries
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Submit compact MetaboLights requests for study discovery and study-level metabolomics metadata. Use when a user wants concise MetaboLights summaries
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Submit compact CELLxGENE Discover API requests for public collection and dataset metadata. Use when a user wants concise single-cell collection summaries
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Submit compact Human Protein Atlas requests for gene JSON, search downloads, and page-level tissue or cell-line lookups. Use when a user wants concise Human Protein Atlas summaries; save raw JSON or HTML only on request.
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Submit compact cBioPortal API requests for studies, molecular profiles, mutations, clinical data, and samples. Use when a user wants concise cBioPortal summaries
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