「python」の検索結果

分析法が目的に適しているかを確かめるため、適用する規格や指針の選択から試験計画、真度・精度などの統計評価、移管時の比較、報告書作成まで支援するスキル。

• 分析法の試験計画と判定基準を作りたいとき
• 検量線・真度・精度を評価したいとき
• 検出限界と定量限界を推定・確認したいとき

学術論文を複数のデータベースで探し、著者・掲載誌などの書誌情報を確認してBibTeX形式に整理します。参考文献の重複や記載漏れ、原稿との対応も点検できます。

• 複数の学術データベースで論文を探したいとき
• DOIをBibTeXに変換したいとき
• 参考文献の重複を整理したいとき

MRIや脳波などの研究データを共通規格BIDSに沿って整理し、ファイル検索、規格への適合確認、DICOM変換、付随情報の作成を支援します。

• MRIや脳波データを規格に沿って整理
• 参加者・セッション・課題別の検索
• DICOM変換と付随情報の作成

ゲノム上の領域データを使う機械学習に向けて、BED形式や参照ゲノムの整合性を点検し、学習計画の作成、モデルとの互換性確認、共通領域集合の評価を支援するスキル。

• BEDの座標と参照ゲノムを点検したいとき
• Region2VecやscEmbedの学習計画
• モデルとトークナイザーの互換性確認

データ収集前に、研究の目的に合う実験方法や対象の割り付け、実施順序を設計し、条件の混同や反復の数え違いを避けるための配置表作成を支援するスキル。

• 被験者や試料の無作為割り付け
• 複数の実験要因を絞り込みたいとき
• バッチ・日・プレート位置を考慮した配置

単一細胞解析の測定値と細胞・遺伝子の情報をまとめ、h5adやZarr形式で読み書きします。データの抽出・結合や、大規模データの省メモリ処理も支援します。

• h5ad・Zarrの読み書き
• 実験データをラベル付きで結合
• 細胞や遺伝子を条件で抽出したいとき

DNA変異が遺伝子の働きに及ぼす影響を、計算済みデータとモデル予測で調べます。候補の順位付けから組織別の影響、スコアの根拠の確認まで支援します。

• VCFの候補変異を順位付けしたいとき
• 組織別の遺伝子発現への影響調査
• 変異前後のDNA予測を比較したいとき

バルク・単一細胞の遺伝子発現データから、発現を調節する遺伝子と標的遺伝子の関係候補を順位付けし、解析手法の比較や結果の安定性確認を支援します。

• 遺伝子の調節関係候補を絞りたいとき
• GRNBoost2とGENIE3の比較
• 推定ネットワークの安定性確認

分子構造から溶解度や毒性などを予測する機械学習を組み立てます。DeepChemでのデータ整備からモデル選択、学習、評価、予測までを支援します。

• 分子構造から溶解度を予測したいとき
• MoleculeNetでグラフモデルを比較
• データ分割の情報漏れを点検したいとき

流体シミュレーションの計画、設定点検、結果解析、再開条件の確認を支援します。FluidSimで計算資源の上限を整理し、数値的な妥当性を確かめます。

• 計算手法とパラメータを見直したいとき
• メモリ・ディスク・実行時間の見積もり
• スペクトルや保存量の収支を点検

確認済みの合成・匿名化・集計データを基に、症例報告や臨床試験報告の下書き構成と集計表を作り、出典との対応、項目の不足や内部整合性をローカルで点検します。

• 症例報告の下書き構成を整えたいとき
• 臨床試験報告の項目漏れを点検したいとき
• 集計済み有害事象データの表作成

作成済みの系統樹や階層ツリーを読み込み、枝の編集、注釈、構造の比較を行います。ETE 4を使い、大きな木の対話的な探索や論文用の図の出力にも対応します。

• 指定した種の抽出や根の変更をしたいとき
• 2つの系統樹の構造を比較したいとき
• NCBIやGTDBの分類情報を付けたいとき

科学・技術分野の情報をExaで検索し、学術資料を優先した候補探しや、複数URLのページ・PDF本文の一括抽出を進めるリサーチ用スキル。

• 研究テーマの論文や一次資料探し
• 学術・研究機関サイトに絞った検索
• 複数URLの記事やPDF本文の抽出

臨床意思決定支援の研究に使う評価資料や分析計画を作成・点検します。集計・合成データを対象に、根拠や確認状況を整理し、診療には使わない文書作成を支えます。

• 研究用モデルの評価資料を整えたいとき
• エビデンス資料と出典の対応確認
• 生存時間解析の計画を点検したいとき

モデルやプロンプトの改善を複数の実験で進め、仮説と結果をツリーに記録します。実験から得た知見を次の試行に引き継ぎ、探索用とは別の評価で改善候補を比較します。

• モデル学習の改善案を実験で比較したいとき
• エージェントの成功率を改善したいとき
• プロンプトの変更を定量評価したいとき

がんモデルの遺伝子依存性や薬剤感受性をDepMapデータで調べ、バイオマーカー別の比較や遺伝子間の関連解析から、研究候補を絞り込むスキル。

• がんモデルの依存遺伝子を順位付けしたいとき
• バイオマーカー別に依存性を比較したいとき
• 依存性パターンが似た遺伝子の探索

ゲノム上の位置をファイル形式ごとの座標規則に合わせて変換し、変異表現の統一や参照ゲノム・染色体名の不一致を点検するスキルです。

• BEDとGFF/GTF間の座標変換
• 挿入・欠失の表現統一と比較
• 参照ゲノムや染色体名の不一致確認

CADファイルからカスタム部品を製造するため、Fictivのブラウザ画面で加工方法や材質を設定し、見積もり比較、製造上の警告確認、発注・追跡を進めるスキル。

• CAD部品の製造見積もりを取りたいとき
• 材質・数量・納期ごとの価格比較
• 製造上の警告やアップロード不具合の確認

代謝ネットワークのモデルを使い、反応を流れる物質量や遺伝子欠損の影響、培地条件、生産量の範囲をCOBRApyで計算し、実験に向けた仮説を検討するスキル。

• 代謝反応の流れと変動範囲の計算
• 遺伝子欠損の影響を比較したいとき
• 最小培地や生産量の範囲の検討

AIエージェントの記憶システムHindsightについて、仕組みやAPI、設定、導入方法を付属資料で調べ、連携開発や問題の調査に使うスキルです。

• 記憶の保存と検索の仕組みを学びたいとき
• APIの接続先や引数を確認したいとき
• サーバー導入とSDK連携の検討

科学論文や研究メモから、原論文の図と発表者ノートを備えた中国語の学術発表用PPTXを作成し、論文の種類に応じた構成づくりや既存スライドの修正も支援します。

• 研究室で論文を紹介したいとき
• 論文を基にした学会・学位審査の資料作成
• 既存の学術スライドを修正したいとき

科学論文を1本ずつ読み込み、手法、主張と実験の根拠、限界、研究アイデアを16項目のカードに整理するスキル。出典を示し、資料不足で評価できない部分も明記します。

• 論文の手法と前提を分解したいとき
• 主張と実験の根拠を照合したいとき
• 論文の限界や根拠の不足の整理

英語論文PDFの指定ページや全文を簡体字中国語に訳し、画像形式のPDFにまとめるスキル。段組みや図表、数式など、元の誌面構成をできるだけ保ちます。

• 英語論文を簡体字中国語で読みたいとき
• 論文の指定ページだけの翻訳
• 図表や数式の配置を保った翻訳

研究論文や発明者の資料から、根拠を追跡できる中国語の発明特許草案や技術説明書を作成します。請求項と明細書、図、数式の整合性を確認し、DOCX文書にまとめます。

• 論文から中国語の特許草案を作成
• 中国語の技術説明書の作成・改訂
• 請求項の根拠を追跡したいとき