「python」の検索結果

医用画像のDICOMファイルをローカルで読み書きし、メタデータや画像のフレーム、圧縮形式を確認します。画像プレビューの出力や仮名化した派生ファイルの監査も支援します。

• DICOMファイルの技術情報を集計
• 圧縮対応とフレーム容量の事前確認
• 診断用ではない画像プレビューの出力

創薬向け機械学習のデータ探索から評価までを支援します。PyTDCでデータセットを取得・分割し、予測結果の比較や指定した分子のスコア計算を進めます。

• 創薬向けの学習データを探したいとき
• タスクに合うデータ分割の計画・実行
• 指定指標で予測結果を比較したいとき

量子系の時間変化や定常状態をQuTiP 5でシミュレーションし、物理的な仮定、単位、状態の妥当性、計算結果の収束を確認するスキルです。

• 散逸を伴う量子系を計算したいとき
• 量子モデルのソルバー選定
• 計算の収束と状態の妥当性確認

二光子撮像のTIFF画像と時刻付き行動位置CSVを、神経科学の共通形式NWBへ変換し、メタデータ・時刻同期・変換前後の一致を検証するスキル。

• 二光子撮像TIFFをNWBに変換したいとき
• 撮像と行動位置をまとめたいとき
• 同期パルスで時計のずれを確認したいとき

流れを撮影した2枚の粒子画像から、各地点の速度と向きを求めます。OpenPIVで画像の前処理、誤ったベクトルの補正、渦度・ひずみ速度の計算、可視化まで扱います。

• 実験画像から速度分布を求めたいとき
• 不正な速度ベクトルの検出と補間
• 渦度とひずみ速度の計算

研究内容を学会向けの大判ポスターにまとめ、編集可能なLaTeXとPDFを作成します。段組みや図表、文字の配置を整え、印刷前の寸法・フォント・画像の確認まで扱います。

• 論文を学会ポスターにまとめたいとき
• 段組みで図表と本文を配置したいとき
• 所属機関のテンプレートで作りたいとき

統計、年表、比較、手順などを説明する図解画像を文章から生成し、用途別の品質レビューと再生成を支援します。提供データや任意の調査結果を材料にできます。

• 報告書の統計を図解したいとき
• プロジェクトの節目を年表にする
• 商品の特徴を視覚的に比較する

Neuropixelsの神経記録を読み込み、ノイズ処理や電極との位置ずれの補正、神経細胞ごとの信号分離、品質評価、確認用の図やデータの出力まで支援します。

• SpikeGLX・Open Ephys・NWBの確認と前処理
• 信号分離前の位置ずれを確認・補正したいとき
• 品質指標に基づいて解析対象を選びたいとき

薬剤・遺伝子・疾患の関係を、種類や探索範囲を指定してARAXで調べます。直接の関係や中間要素を一つ挟む経路を取得し、出典や関連文献も確認するスキル。

• 薬剤と遺伝子の関係を調べたいとき
• 薬剤と疾患を結ぶ経路の探索
• 関連文献と元データの出典確認

一次元NMRの生信号をスペクトルに変換し、位相・ベースライン補正からピーク候補の抽出、符号付き積分までを、処理条件の記録とともに進めるスキル。

• 一次元NMRの生信号を処理したいとき
• 基準信号とピーク位置を照合したいとき
• 位相とベースライン補正の点検

複数の学術データベースを使う文献検索から選別、研究結果の統合、引用確認までを支援します。検索条件や除外理由を記録し、MarkdownやPDFのレビューにまとめます。

• 論文や学位論文の先行研究の整理
• 再現できる文献検索を記録したいとき
• 文献の選別判断や除外理由の管理

PacBio HiFiの腫瘍・正常ペアの未整列BAMから、nf-core/pacsomaticの実行ファイルを作り、ローカル起動や計算クラスタへの投入を支援するスキル。

• 腫瘍・正常ペアの試料一覧を作りたいとき
• ドライランで実行ファイルを確認したいとき
• 計算クラスタに起動ジョブを投入したいとき

観察や予備的な結果から、検証できる研究仮説と対立する説明を整理します。予測・測定方法・分析計画を具体化し、根拠の範囲を明示した研究計画づくりを支援します。

• 観察から検証可能な仮説を立てたいとき
• 対立する説明と予測を比較したいとき
• 測定方法と分析計画を整理したいとき

創薬候補の化合物を、医薬品らしさの経験則、注意が必要な分子構造、複雑さの指標で評価し、複数条件による候補の絞り込みと判定理由の記録を支援するスキル。

• 医薬品らしさの基準で化合物を選別
• PAINSなどの注意構造を確認したいとき
• 物性・構造・複雑さの条件を組み合わせる

PDF・Office文書・画像から、文字とページ内の位置情報をローカルで抽出します。スキャンの文字認識、JSON・Markdown出力、ページ画像化、一括処理に対応します。

• スキャンPDFや画像の文字を抽出したいとき
• RAG用に文書と位置情報を整えたいとき
• 論文フォルダの一括取り込み

PDFやウェブ、音声などの研究資料をノートにまとめ、出典付きの対話や検索、要約などの変換、複数話者のポッドキャスト生成を支援するスキルです。

• PDFやウェブ資料をまとめたいとき
• 資料に出典付きで質問したいとき
• 独自の要約や文章変換

LabArchivesの電子実験ノートと研究室の在庫管理をAPIで連携するために、接続先の選択、認証用の署名作成、送信前の計画やローカルファイル検査を支援します。

• 電子実験ノートのAPI連携を設計したいとき
• 研究室の在庫管理APIの認証確認
• LA containerのローカル検査

組織名・細胞種・疾患名などの自由記述を標準用語のID候補に対応づけ、既存IDの名称や廃止状況を検証します。研究データの提出準備やメタデータ表の点検に使えます。

• 組織・細胞種・疾患に標準IDを付けたいとき
• メタデータ表のIDと名称を点検したいとき
• 廃止された用語と置換先を確認したいとき

科学分野のデータセットやAIモデル、手法解説、デモをカタログから探し、研究目的に合う候補を比較します。ライセンスや入力形式、実際に使うための実行環境も確認します。

• タンパク質やゲノム解析モデルの探索
• 科学系機械学習のデータを選びたいとき
• ライセンスや実行環境を比較したいとき

海水の独立した２種類の測定値から、pHや炭酸イオン、鉱物の飽和度を計算します。実験室から現場条件への換算や、測定誤差が結果に及ぼす影響も扱います。

• 海水の測定値から炭酸系を計算したいとき
• アラゴナイトやカルサイトの飽和度評価
• 実験室の値を海中条件へ換算したいとき

1000 Genomes Projectの3,202人を対象に、条件に合う遺伝的変異や保有者を検索し、変異の頻度、参加者間の血縁関係まで調べるスキル。

• 条件に合う変異の保有者を探したいとき
• 指定した参加者の変異を調べたいとき
• 参照配列と両コピーが一致する人の抽出

生物医学論文や規制当局の文書、臨床試験情報を検索し、複数資料から必要な情報を抽出して、根拠の行にリンクした引用付きで整理するスキル。

• テーマに合う生物医学論文の検索
• 複数論文の方法と結果の比較
• 規制文書や臨床試験を調べたいとき

心電図・呼吸・皮膚電気活動などの生体信号をNeuroKit2で研究分析するために、前処理、時刻合わせ、心拍変動や刺激前後の解析手順の構築・点検を支援します。

• 前処理前に生体信号の品質を点検
• 研究用の心電図・心拍変動解析
• イベント区間と基準補正の設計

医療機器や試験・医療検査室のISO関連資料を整理し、証拠記録の構造を確認します。文書・リスク管理・是正処置の不足を、人によるレビュー用にまとめます。

• 管理文書と実施記録を整理したいとき
• 医療機器のリスク・設計記録の照合
• 是正処置と供給者管理の証拠確認