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概要と使いどころ
Fetch compact TPMI PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise TPMI association results for one variant
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Submit compact Clinical Tables NCBI Gene requests for human gene lookup, pagination, and field selection. Use when a user wants concise autocomplete-style human gene search results
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Fetch compact UKB-TOPMed PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise UKB-TOPMed association results for one variant
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Submit compact Open Targets Platform GraphQL requests for target, disease, drug, variant, study, and search data, including associated-disease datasource heatmap matrices. Use when a user wants concise Open Targets summaries or per-datasource evidence context
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Submit compact UniProt REST API requests for UniProtKB, UniRef, UniParc, and FASTA stream endpoints. Use when a user wants concise UniProt summaries; save raw JSON or FASTA only on request.
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Submit compact NCBI Datasets v2 requests for assembly, genome, taxonomy, and related metadata endpoints. Use when a user wants concise NCBI Datasets summaries; save raw JSON or text only on request.
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Submit compact PharmGKB API requests for genes, variants, clinical annotations, dosing guidelines, and search. Use when a user wants concise PharmGKB summaries
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Submit compact Rhea reaction search requests for biochemical reactions and reaction IDs. Use when a user wants concise Rhea summaries
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Route broad or ambiguous life-sciences research requests to the right skills, normalize core entities, optionally parallelize independent evidence gathering with subagents when available, and synthesize a concise evidence-backed answer. Use when a user asks a general life-sciences question that could span multiple sources or analysis types.
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Submit compact RNAcentral API requests for RNA entry browsing, single-entry lookup, and cross-reference retrieval. Use when a user wants concise RNAcentral summaries
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Submit compact PubChem PUG REST requests for compound properties, descriptions, assay summaries, and substance metadata. Use when a user wants concise PubChem summaries
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Submit compact NCBI PMC Open Access requests for article/file availability metadata. Use when a user wants concise PMC Open Access summaries; save raw XML only on request.
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Submit compact RCSB PDB requests for core metadata, Search API queries, and FASTA downloads. Use when a user wants concise RCSB summaries; save raw JSON or FASTA only on request.
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Submit compact QuickGO requests for GO terms, annotations, and ontology traversal. Use when a user wants concise QuickGO summaries
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Submit compact NCBI Entrez E-Utilities requests for PubMed, Gene, Protein, Nucleotide, PMC metadata, and GEO metadata workflows. Use when a user wants concise Entrez search, fetch, summary, or link results; save raw JSON or XML only on request.
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Submit compact Reactome ContentService requests for pathway, event, participant, search, and diagram-related data. Use when a user wants concise Reactome summaries
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Submit compact IPD REST requests for HLA allele and cell-level metadata using the public IPD query API. Use when a user wants concise IPD summaries; save raw JSON or text only on request.
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Submit compact ChEMBL API requests for activity, molecule, target, mechanism, and text-search endpoints. Use when a user wants concise ChEMBL summaries
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Submit compact Genebass gene burden requests for one Ensembl gene ID and one burden set. Use when a user wants concise Genebass PheWAS summaries
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Submit compact bioRxiv and medRxiv API requests for details, publication-linkage, and DOI lookups. Use when a user wants concise preprint metadata summaries
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Submit compact EpiGraphDB API requests for ontology, literature, MR, gene-drug, and support-path evidence. Use when a user wants concise EpiGraphDB summaries
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Submit compact CELLxGENE Discover API requests for public collection and dataset metadata. Use when a user wants concise single-cell collection summaries
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Submit compact ChEBI 2.0 API requests for chemical search, compound lookup, ontology traversal, and structure metadata. Use when a user wants concise ChEBI summaries
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Submit compact eQTL Catalogue API requests for association retrieval and documented metadata endpoints. Use when a user wants concise public eQTL Catalogue summaries
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