「md」の検索結果

Analyzes differential transcript usage (DTU) and isoform switches with functional consequence prediction (NMD via 50nt rule, ORF disruption, protein domain loss/gain, signal peptide changes, IDR alterations, coding-potential shifts). Tools include IsoformSwitchAnalyzeR v2 (auto-selects satuRn for >5 reps else DEXSeq), the manual DRIMSeq -> DEXSeq/satuRn -> stageR DTU pipeline, and fishpond/swish for inferential-uncertainty-aware DTE. Distinguishes DTU from DGE and DTE; integrates external annotators (CPC2, Pfam, SignalP, IUPred2A or DeepTMHMM). Use when investigating how splicing differences alter protein function or trigger NMD-mediated degradation.

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Build daemon/background processes that start on boot, run continuously, and manage their own lifecycle. Covers macOS launchd (plist files, agents vs daemons), Linux systemd (unit files), Windows services, process supervision, logging, health checks, graceful shutdown, auto-restart, and AI-powered daemons that manage LLM API connections and rate limits. Activate on: "daemon", "background process", "launchd", "systemd", "service file", "plist", "launch agent", "launch daemon", "auto-start", "always running", "process supervisor", "pm2", "background service", "boot service", "AI daemon", "long-running process". NOT for: container orchestration (use devops-automator), cron jobs that run and exit (use task-scheduler), web server deployment (use backend-architect).

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Use when building content-heavy sites with Astro, deciding between SSG/SSR/hybrid, choosing client directives (idle/visible/load/media), structuring content collections with type-safe schemas, integrating React/Vue/Solid/Svelte components in the same project, or migrating from Next.js for marketing/docs. Triggers: client:idle vs client:load tradeoffs, content collections schema with zod, image optimization via @astrojs/image, view transitions, server islands, MDX layouts. NOT for SPA-style apps that need full interactivity (use Next/Remix), Astro internals/plugin authoring, or non-content sites where islands provide no benefit.

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Create an Agent SKILL.md fallback for an existing find-XXXX finder that relies on a fragile discovery foundation — above all LLM_DECOMPILE (patterns C/D/E), which matches the decompiled shape of a predecessor function against a stored reference and breaks when a symbol is inlined or de-inlined in a way the reference does not cover. The generated fallback coexists with the preprocessor and runs only when it returns failure, recovering every target robustly by decompiling the predecessor and following the inline/de-inline boundary with semantic anchors. Use when a finder broke on a game update, or you want to durably backstop one before it does. The recipe generalizes to any finder foundation. Triggers: create agent skill fallback, add SKILL.md fallback, robust fallback for finder, backstop LLM_DECOMPILE finder, final guarantee skill

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Convert an existing find-XXXX SKILL.md into a preprocessor Python script, updating configs/<GAMEVER>.yaml and removing the old SKILL.md. Covers xref-string-based and LLM_DECOMPILE-based discovery patterns.

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自分のClaude Codeログから3回以上繰り返している作業を洗い出し、実用できるエージェントスキルを生成する。「定期作業洗い出し」「ログから繰り返し作業」「スキル化候補出して」「この作業をスキル化して」と言われたら起動。2モード搭載 (keyword=高速30秒・無料 / semantic=並列サブエージェント・3-5分・$1〜$3)。出力は候補リスト、生成SKILL.md、実インストールはユーザー承認後

参照文書（README・SKILL.md・API 文書・Markdown 全般）を美の基準で走査し，最も美しい確定版へ仕上げる．「READMEを完璧にして」「ドキュメントを美しくして」など，文書の仕上げを求められたときに使う（単発の小修正には使わない）．

確立された文脈をもとに理論的方向性を議論して方針を深め，確定した方針を .claude/context.md に反映する．「方針はこれでいい？」「仮説を整理したい」「実験設計どう思う？」など，実装ではなく理論・方向性を議論したいときに使う．文脈の初期作成は /groundwork:survey を使う．

Claude Codeの拡張機能（スキル、サブエージェント、プロジェクト設定）をユーザーの自然言語指示から自動生成するスキル。「○○を作るスキルを作って」「○○エージェントを作って」「CLAUDE.mdを設定して」などのリクエスト時に使用。v2.1.1以降、スラッシュコマンドとスキルは統合されたため、すべてスキルとして作成。

AGENTS.mdや既存スキルをGPT-6 Astra向けに監査・整理するときに使う。契約と意図的な他モデル委譲を保ち、重複、過剰な手順、曖昧な停止条件を修正する。

動画ファイルからアプリの画面遷移リファレンスドキュメントを生成する。video-analyzerスキルのキーフレーム抽出スクリプトでフレームを抽出し、Haikuサブエージェントで並列分析、遷移シーン画像と構造化マークダウン（README.md）を指定ディレクトリに出力する。使用タイミング：動画からアプリのUIフロー・ユーザーストーリーをステップごとにまとめたリファレンスを作成したい場合。

フィーチャー全体の設計・ストーリー分割を行い、PLAN.md と plan.json を生成。 ストーリー駆動開発フローと統合し、dev:story の上位レイヤーとして機能する。 各ストーリーに executionType とフェーズを付与し、実行計画を構造化する。 Trigger: フィーチャー計画, エピック作成, 全体設計, /dev:epic

仕様書（docs/PLAN/{YYMMDD}_{slug}/）の実行プロトコル。Gate 単位で契約（Goal/Constraints/AC）を実装エージェントに渡し、AC ベースで完了を判定する。Trigger: 仕様書を実行, /dev:spec-run, 計画書の実行

実装完了後、学んだことをDESIGN.mdに蓄積。スキル/ルールの自己改善を提案。 ストーリー駆動開発の終点。 「フィードバック」「/dev:feedback」で起動。 Trigger: フィードバック, 学習事項蓄積, /dev:feedback, feedback, design update

docs/PLAN/{YYMMDD}_{slug}/ の schema v3 仕様書を Codex で Gate 単位に実行する。 tasks.json を正とし、Gate 契約 (Goal/Constraints/AC) に基づいて実装・検証・レビューを行う。 Trigger: spec-codex-run, spec-run

チーム実装計画を作成。ストーリー分析→タスク分解→レビュー（opencode）。 計画は docs/FEATURES/team/{YYMMDD}_{slug}/ に永続化され、複数保持可能。 Trigger: dev:team-plan, /dev:team-plan, チーム計画, team plan

Codex Plan Mode 専用。docs/PLAN/{YYMMDD}_{slug}/ に schema v3 仕様書を作成する。 Gate 契約 (Goal / Constraints / Acceptance Criteria)、Mermaid 図、Cursor Agent 委任ヒントを含む。 Trigger: spec-codex

AgentShieldを使用してClaude Codeの設定（.claude/ディレクトリ）のセキュリティ脆弱性、設定ミス、インジェクションリスクをスキャン。CLAUDE.md、settings.json、MCPサーバー、フック、エージェント定義をチェック。

未知のコードベースを分析し、アーキテクチャマップ、主要エントリポイント、規約、スターター CLAUDE.md を含む構造化されたオンボーディングガイドを生成する。新しいプロジェクトに参加する際や、リポジトリで初めて Claude Code をセットアップする際に使用。

Keeps brand definitions, several side by side, and turns one into a Claude Design System, DESIGN.md, VOICE.md or guide. Trigger to define a brand, palette, type or voice; turn a style guide or site into tokens; make, connect or sync a design system; audit for brand drift (off-palette colours, old names); pass or fail a page against a brand, or apply one to a README or generated output; critique or check a built UI (hierarchy, spacing, states, generic look); or say brandscribe (setup, build, export, sync, audit, gate, ui). Microcopy and messages are commscribe's; React libraries design-sync's; charts dataviz's; canon lorescribe's; a pre-build brief, fit across widths and themes, and game UI uismith's; no logos.

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repo の root に issues/ を作り、dotfiles の issues/README.md を持ち込んで issue 運用を始める。commit するかはユーザーに聞く。「issue運用を始めて」「issuesディレクトリを作って」「start-issues-ops」で発火。

このセッションで関わった issues/ の .md に更新漏れが無いかを点検し、あれば本文へ書き戻す。「issue の更新漏れない?」「issue 更新した?」「書き戻し漏れ」「/issue-writeback」で発火。完了検出と done/ への移動は issue-sync の担当で、この skill はファイルを動かさない。

開発作業の設計書（design.md）を生成します。このスキルは単独で使用することも、generate-working-docsから呼び出されることもあります。

開発作業の設計書（design.md）を単体で生成・再生成します。全ドキュメントの一括生成には generate-working-docs（新規機能開発）または generate-performance-docs（パフォーマンス改善）を使用してください。