「network」の検索結果

Infer gene regulatory networks from bulk or general expression data with mutual-information (ARACNe) and tree-ensemble (GENIE3, GRNBoost2) methods, and infer transcription-factor protein activity from regulons with VIPER and msVIPER. Covers the activity-not-edges paradigm, the undirected-association caveat, the DREAM5 wisdom-of-crowds and method-complementarity result, AUPRC-over-AUROC evaluation, and gold-standard incompleteness. Use when inferring a regulatory network from a bulk expression matrix, finding master regulators, or scoring TF activity from a signature. For single-cell motif-pruned regulons see scenic-regulons; for co-expression modules see coexpression-networks.

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Visualize biological networks (PPI, gene-regulatory, co-expression, pathway) with layout algorithm choice (ForceAtlas2, Fruchterman-Reingold, Kamada-Kawai, hive plots), edge bundling, community-based coloring, and reproducible seeds using NetworkX, PyVis, igraph, and Cytoscape automation. Use when rendering biological networks for static publication, interactive HTML exploration, or Cytoscape-format export.

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Infer gene regulatory networks from bulk or general expression data with mutual-information (ARACNe) and tree-ensemble (GENIE3, GRNBoost2) methods, and infer transcription-factor protein activity from regulons with VIPER and msVIPER. Covers the activity-not-edges paradigm, the undirected-association caveat, the DREAM5 wisdom-of-crowds and method-complementarity result, AUPRC-over-AUROC evaluation, and gold-standard incompleteness. Use when inferring a regulatory network from a bulk expression matrix, finding master regulators, or scoring TF activity from a signature. For single-cell motif-pruned regulons see scenic-regulons; for co-expression modules see coexpression-networks.

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Visualize biological networks (PPI, gene-regulatory, co-expression, pathway) with layout algorithm choice (ForceAtlas2, Fruchterman-Reingold, Kamada-Kawai, hive plots), edge bundling, community-based coloring, and reproducible seeds using NetworkX, PyVis, igraph, and Cytoscape automation. Use when rendering biological networks for static publication, interactive HTML exploration, or Cytoscape-format export.

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Reviews and approves blocked agent network requests in the TUI. Use when approving or denying sandbox egress requests, managing blocked network calls, or using the approval TUI. Trigger keywords - nemoclaw approve network requests, sandbox egress approval tui, customize nemoclaw network policy, sandbox egress policy configuration.

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Identifies lateral movement techniques in enterprise networks by analyzing authentication logs, network flows, SMB traffic, and RDP sessions using Zeek, Velociraptor, and SIEM correlation rules to detect attackers moving between systems.

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Deploys and configures Suricata IDS/IPS with Emerging Threats rulesets, EVE JSON logging, and custom rules for real-time network traffic inspection, threat detection, and integration with SIEM platforms for centralized security monitoring.

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Configures pfSense firewall rules, NAT policies, VPN tunnels, and traffic shaping to enforce network segmentation, control traffic flow, and protect internal network zones in enterprise and small-to-medium business environments.

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Execute an internal network penetration test simulating an insider threat or post-breach attacker to identify lateral movement paths, privilege escalation vectors, and sensitive data exposure within the corporate network.

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Craft, send, sniff, and dissect network packets using Scapy for protocol analysis, network reconnaissance, and traffic anomaly detection in authorized security testing

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Captures and analyzes network packet data using Wireshark and tshark to identify malicious traffic patterns, diagnose protocol issues, extract artifacts, and support incident response investigations on authorized network segments.

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Swiftのファイル操作や通信、外部APIを小さなプロトコルで分離し、テスト用の代替実装に差し替えて、正常系やエラー処理を検証するスキル。

• 実ファイルを使わずテストしたいとき
• エラー処理を再現して検証したいとき
• アプリとプレビューで処理を共用

XとLinkedInのつながりから、会いたい相手への紹介経路を評価するスキル。経路の近さや関係の強さを重み付けし、紹介を頼む候補と接点の不足を整理します。

• 対象者を紹介できる知人探し
• 共通の知人を紹介価値で順位付け
• 対象企業への紹介経路を調べたいとき

ネットワーク間で経路を交換するBGPの接続断や経路不足を、接続状態・到達性・経路の制御設定から調べ、設定を変えずに診断材料を集めるスキル。

• BGP接続断や不安定さの調査
• 期待する経路がない原因の調査
• 経路フィルターとAS pathの確認

ルーターやスイッチの設定を適用前に点検するスキル。危険なコマンド、IPアドレスの重複、サブネットの重なり、未定義の参照や管理用アクセスの問題を確認します。

• 保守作業前に設定をレビューしたいとき
• テンプレートで生成した設定の監査
• IP重複とネットワーク範囲の確認

PythonとNetmikoでネットワーク機器の情報収集を自動化し、接続数の制限、出力の解析、エラー処理、確認を伴う設定変更の実装やレビューを支援します。

• 複数機器のshow出力を集めたいとき
• 監査用に接続状態や経路を記録したいとき
• SSH処理のタイムアウトを整えたいとき

ルーターやスイッチ、Linuxの通信エラーや切断を調べ、両端の設定とエラー件数の増え方から、ケーブル不良や混雑などの原因を切り分けるスキル。

• 通信の途切れやパケット損失を調べたいとき
• スイッチのCRC増加を調べたいとき
• リンク両端の設定を比較したいとき

家庭内ネットワークにPi-holeを導入し、広告などのドメイン遮断、DNS通信の暗号化、機器の名前登録、接続不具合の調査を支援するスキル。

• 家庭内のドメイン遮断を導入したいとき
• 遮断リストの管理と誤遮断の修正
• 外部へのDNS通信を暗号化したいとき

DockerとDocker Composeで開発環境を構成し、通信・データ保存・権限を見直すほか、元のファイルを変更せずにCLIの導入手順を検証するスキル。

• アプリとDBの開発環境を構築
• コンテナの通信とデータ保存の確認
• Docker設定のセキュリティ見直し

DartとFlutterのコード作成・レビューで、状態管理、画面遷移、通信、例外処理、テストの実装パターンを参照し、アプリの構成を整えるスキル。

• 新機能の状態管理を選びたいとき
• null処理や非同期処理のレビュー
• ログイン状態で画面遷移したいとき

Agent skill for neural-network - invoke with $agent-neural-network

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Master network protocol reverse engineering including packet analysis, protocol dissection, and custom protocol documentation. Use when analyzing network traffic, understanding proprietary protocols, or debugging network communication.

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Configures Fail2ban with custom filters and actions to detect port scanning activity, SSH brute force attempts, and network reconnaissance, automatically banning offending IP addresses and alerting security teams to suspicious network probing.

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Detect network reconnaissance and port scanning using Suricata and Snort IDS signatures, threshold-based detection rules, and traffic anomaly analysis to identify Nmap, Masscan, and custom scanning activity.

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