「otp」の検索結果

Visualizes ChIP-seq data using deepTools (computeMatrix, plotHeatmap, plotProfile, bamCoverage, bamCompare), pyGenomeTracks (modern INI-driven track plots), Gviz (R browser-style), EnrichedHeatmap (ComplexHeatmap-based), ChIPseeker tag heatmaps, and IGV batch screenshots. Handles bigWig normalization choices (CPM, BPM, RPGC, spike-in scaled), bamCompare operations (log2 ratio, subtract) with SES scaling, k-means clustering of heatmaps for biological subgrouping, and spike-in-scaled tracks for global-shift experiments. Use when generating publication-quality ChIP-seq signal heatmaps, profile plots, genome-browser tracks, or comparing samples visually.

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Trim PCR primers from aligned reads in amplicon-panel BAMs using samtools ampliconclip. Use when processing SARS-CoV-2 ARTIC, hereditary cancer panels, ctDNA hot-spot panels, or any amplicon assay where primer-derived bases would falsely confirm reference at primer footprints.

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Analyze TF motif accessibility variability across samples or single cells using chromVAR. Use when identifying TF motifs whose accessibility correlates with conditions, computing per-sample motif z-scores after matched background correction, comparing to ArchR / Signac equivalents, or distinguishing motif-accessibility signal from per-site footprinting.

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Workflow skill for KiCAD PCB layout and routing via MCP tools. Triggers on: "layout the board", "route traces", "PCB", "place footprints", "copper pour", "board outline", "differential pair", "board setup", "track width", "via", "zone", "design rules", "stackup", "silkscreen".

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Research, drafting, and analysis involving the International Criminal Court (Rome Statute system). Enforces a verification-first methodology — every case-law, decision, filing, warrant, and statement citation is verified against an authoritative primary source (icc-cpi.int, legal-tools.org) in the current conversation before it appears in an output. Foundational texts (Rome Statute, Elements of Crimes, RPE, Regulations of the Court) may be cited from project knowledge when present. Use whenever the user is working with ICC case law, OTP statements, ASP documents, or ICC procedure.

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Use when writing or editing a SKILL.md, a skill's references/*.md, or an agent definition in this repo — required frontmatter, section ordering, the GDScript-then-C# example convention, and C# parity exemptions.

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Use when implementing shaders — Godot shader language, visual shaders, common visual recipes, and post-processing effects

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Use when designing scene tree structure — composition vs inheritance, when to split scenes, node hierarchy patterns

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Use when implementing state machines in Godot — enum-based, node-based, and resource-based FSM patterns with trade-offs

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Use when implementing tweens — property animation, method tweening, chaining, parallel sequences, easing, and common UI/gameplay motion recipes

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Use when building VR/AR/XR applications — OpenXR setup, XROrigin3D, hand tracking, controllers, passthrough, and Meta Quest deployment in Godot 4.3+

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Use when debugging Godot projects — remote debugger, print techniques, signal tracing, common error patterns and fixes

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Use when working with 3D-specific systems — materials, lighting, shadows, environment, global illumination, fog, LOD, occlusion culling, and decals in Godot 4.3+

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Use when handling multiple resolutions — stretch modes, aspect ratios, DPI scaling, and mobile/desktop adaptation

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Use when implementing procedural generation — noise-based terrain, BSP dungeons, cellular automata caves, wave function collapse, and seeded randomness in Godot 4.3+

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Use when working with physics bodies, collision shapes, raycasting, areas, rigid bodies, ragdolls, soft bodies, Jolt physics, and physics interpolation in Godot 4.3+

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Use when using the Phantom Camera addon — PhantomCamera2D/3D with priority-based switching, follow and look-at modes, and tween transitions

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Use when working with 2D-specific systems — TileMaps, parallax scrolling, 2D lights and shadows, canvas layers, particles 2D, custom drawing, and 2D meshes in Godot 4.3+

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Use when synchronizing multiplayer state — MultiplayerSynchronizer, interpolation, prediction, and lag compensation

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Use when running work off the main thread — WorkerThreadPool, Thread/Mutex/Semaphore, call_deferred, thread-safe scene access, and threaded resource loading

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Use when implementing save/load systems — ConfigFile, JSON, Resource serialization, save game architecture

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Use when implementing localization (i18n/l10n) — TranslationServer, CSV/PO translation files, locale switching, RTL support, and pluralization in Godot 4.3+

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Use when creating a new Godot 4.x project — scaffolds recommended directory structure, project settings, autoloads, and .gitignore

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Use when reviewing GDScript or C# Godot code — checklist of best practices, common anti-patterns, and Godot-specific pitfalls. Triggers on "review this script", "check my code", "any issues with this", "what's wrong with this code", including a short pasted snippet.

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