「net」の検索結果

Detect syntenic blocks and structural rearrangements between genomes using MCScanX (Wang 2012), JCVI/MCScan (Tang 2008 Python), GENESPACE (Lovell 2022) for orthology-anchored riparian visualization, SyRI for structural variation, AnchorWave for sequence-level synteny, i-ADHoRe 3.0 for highly diverged species, SynNet for synteny networks, and ntSynt for multi-genome macrosynteny. Use when identifying collinear gene blocks across species, distinguishing macrosynteny from microsynteny, detecting inversions/translocations/duplications, anchoring orthology in WGD lineages, producing publication riparian plots, computing synteny block age via Ks (cross-references whole-genome-duplication), or running synteny-aware ortholog inference in polyploids.

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Detect horizontal gene transfer (HGT / LGT) using compositional methods (GC%, codon usage, tetranucleotide z-scores via SIGI-HMM, AlienHunter, IslandViewer 4, IslandPath-DIMOB), phylogenetic-incongruence methods (AvP, HGTphyloDetect, ALE / GeneRax / AleRax reconciliation, RANGER-DTL), and BLAST-distribution methods (HGTector v2, DarkHorse, Alien Index). Use when screening prokaryote genomes for genomic islands and HGT events, distinguishing HGT from incomplete lineage sorting / differential gene loss / hybridization, mapping donor lineages via phylogenetic placement, separating eukaryotic HGT from contamination, ruling out gBGC as a false signal, or quantifying DTL rates with ALE/GeneRax on bacterial trees.

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Build whole-genome alignments using Progressive Cactus (Armstrong 2020 reference-free clade-level WGA), Minigraph-Cactus (Hickey 2024 pangenome-aware), LASTZ chain/net (UCSC pipeline), MUMmer4 (Marçais 2018 pairwise), minimap2 -x asm5/10/20 (Li 2018 fast pairwise), AnchorWave (Song 2022 WGD-aware), and Mauve / progressiveMauve (bacterial). Operates the HAL toolkit (Hickey 2013) for downstream extraction including halSynteny, halLiftover, halBranchMutations, and hal2maf. Use when constructing multi-species alignments for comparative-annotation projection (TOGA), synteny detection, conservation analyses (phyloP / PhastCons), or pangenome graph construction; selecting between reference-free (Cactus) and reference-anchored (LASTZ chains/nets) approaches; tuning sensitivity for closely vs distantly related genomes; or producing HAL files for genome-wide downstream tools.

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Estimate SNP heritability and partition it across functional annotations, cell types, and loci from GWAS summary statistics or individual-level genotypes. Implements LDSC, stratified LDSC with the baseline-LD model, Finucane 2018 cell-type prioritization, LDAK SumHer, HDL, HESS local heritability, BOLT-REML, GCTA-GREML, graphREML, and Popcorn cross-population genetic correlation. Use when computing total h2_SNP from summary stats, partitioning heritability across functional categories, prioritizing trait-relevant tissues or cell types from ENCODE/Roadmap chromatin marks, reconciling LDSC vs LDAK enrichment estimates, computing local heritability with HESS, estimating genetic correlation between traits, or producing publication-grade enrichment with calibrated sensitivity to model assumptions.

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Azure Service Bus SDK for .NET. Enterprise messaging with queues, topics, subscriptions, and sessions.

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Azure Resource Manager SDK for Durable Task Scheduler in .NET.

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Azure AI Search SDK for .NET (Azure.Search.Documents). Use for building search applications with full-text, vector, semantic, and hybrid search.

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Azure MySQL Flexible Server SDK for .NET. Database management for MySQL Flexible Server deployments.

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Azure Resource Manager SDK for Cosmos DB in .NET.

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Azure Resource Manager SDK for Azure SQL in .NET.

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Azure Identity SDK for .NET. Authentication library for Azure SDK clients using Microsoft Entra ID. Use for DefaultAzureCredential, managed identity, service principals, and developer credentials.

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Azure Resource Manager SDK for Bot Service in .NET. Management plane operations for creating and managing Azure Bot resources, channels (Teams, DirectLine, Slack), and connection settings.

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Azure Resource Manager SDK for Fabric in .NET.

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Azure Maps SDK for .NET. Location-based services including geocoding, routing, rendering, geolocation, and weather. Use for address search, directions, map tiles, IP geolocation, and weather data.

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Azure API Center SDK for .NET. Centralized API inventory management with governance, versioning, and discovery.

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Azure Resource Manager SDK for API Management in .NET.

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Azure Key Vault Keys SDK for .NET. Client library for managing cryptographic keys in Azure Key Vault and Managed HSM. Use for key creation, rotation, encryption, decryption, signing, and verification.

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Azure Weights & Biases SDK for .NET. ML experiment tracking and model management via Azure Marketplace. Use for creating W&B instances, managing SSO, marketplace integration, and ML observability.

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Azure Application Insights SDK for .NET. Application performance monitoring and observability resource management.

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Azure Resource Manager SDK for Redis in .NET.

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Azure Resource Manager SDK for Microsoft Playwright Testing in .NET.

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Azure PostgreSQL Flexible Server SDK for .NET. Database management for PostgreSQL Flexible Server deployments.

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Azure Resource Manager SDK for Arize AI Observability and Evaluation (.NET).

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Azure Event Hubs SDK for .NET.

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