Initialize an Adobe App Builder project end-to-end without Developer Console UI clicks. Creates the Console project and workspace, subscribes APIs (including those needing a product profile), maps user intent to the right template, runs non-interactive `aio app init`, and guides post-init customization. Use whenever the user mentions creating an App Builder app, scaffolding a project, `aio app init`, setting up an Experience Cloud extension, adding actions or web assets, creating a Console project or workspace, adding APIs, or bootstrapping App Builder — even if they don't say "App Builder". Also for SPA templates, AEM extensions, API Mesh, Asset Compute workers, and MCP server projects. Also handles debugging init failures — template not found, `aio app init` hangs or times out, Node version mismatches, npm install failures, post-init build errors, `aio login` issues, `aio app run` showing nothing, or `aio console project create` / `workspace create` / `workspace api add` errors.
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OCIOStateOfNebraska/stateofnebraska-aem☆ 32026年10月9日 更新
[BETA] Expert assistance for the Adobe I/O CLI plugin `@adobe/aio-cli-plugin-aem-rde` — the `aio aem rde` / `aio aem:rde` command tree used to deploy, inspect, log-tail, snapshot, and troubleshoot AEM Rapid Development Environments (RDEs). Activate ONLY when the user explicitly references RDE concepts: 'AEM RDE', 'Rapid Development Environment', `aio aem rde`, `aio aem:rde`, `aem-rde`, RDE snapshots, RDE deploy/install, `rde install`, `rde inspect`, `rde status`, `rde history`, `rde reset`, the `@adobe/aio-cli-plugin-aem-rde` package, or Cloud Manager program/environment configuration that is specifically for an RDE environment. Do NOT activate on generic AEMaaCS phrases like 'deploy to AEM Cloud', 'push my bundle', 'tail the publish log', 'cloud sandbox', or unqualified 'dispatcher-config / frontend / env-config deployments' — those belong to Cloud Manager pipelines, not RDE. This skill is in beta. Verify all outputs before applying them to production projects.
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OCIOStateOfNebraska/stateofnebraska-aem☆ 32026年10月9日 更新
[BETA] Expert assistance for the Adobe I/O CLI plugin `@adobe/aio-cli-plugin-aem-rde` — the `aio aem rde` / `aio aem:rde` command tree used to deploy, inspect, log-tail, snapshot, and troubleshoot AEM Rapid Development Environments (RDEs). Activate ONLY when the user explicitly references RDE concepts: 'AEM RDE', 'Rapid Development Environment', `aio aem rde`, `aio aem:rde`, `aem-rde`, RDE snapshots, RDE deploy/install, `rde install`, `rde inspect`, `rde status`, `rde history`, `rde reset`, the `@adobe/aio-cli-plugin-aem-rde` package, or Cloud Manager program/environment configuration that is specifically for an RDE environment. Do NOT activate on generic AEMaaCS phrases like 'deploy to AEM Cloud', 'push my bundle', 'tail the publish log', 'cloud sandbox', or unqualified 'dispatcher-config / frontend / env-config deployments' — those belong to Cloud Manager pipelines, not RDE. This skill is in beta. Verify all outputs before applying them to production projects.
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aemgdc/aemdev☆ 22026年10月13日 更新
Initialize an Adobe App Builder project end-to-end without Developer Console UI clicks. Creates the Console project and workspace, subscribes APIs (including those needing a product profile), maps user intent to the right template, runs non-interactive `aio app init`, and guides post-init customization. Use whenever the user mentions creating an App Builder app, scaffolding a project, `aio app init`, setting up an Experience Cloud extension, adding actions or web assets, creating a Console project or workspace, adding APIs, or bootstrapping App Builder — even if they don't say "App Builder". Also for SPA templates, AEM extensions, API Mesh, Asset Compute workers, and MCP server projects. Also handles debugging init failures — template not found, `aio app init` hangs or times out, Node version mismatches, npm install failures, post-init build errors, `aio login` issues, `aio app run` showing nothing, or `aio console project create` / `workspace create` / `workspace api add` errors.
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aemgdc/aemdev☆ 22026年10月13日 更新
Use when someone asks for an AIOS audit, asks to score their setup against the Four Cs, or says "is my AIOS working" / "audit my setup" / "find gaps in my AIOS". Produces a Four-Cs scoreboard with top-3 fixes ranked by leverage.
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alirezarezvani/gaios☆ 492026年6月7日 更新
Set up CI/CD pipelines for Adobe App Builder projects. Generates GitHub Actions workflows using adobe/aio-cli-setup-action@3 and adobe/aio-apps-action@3.3.0, plus patterns for Azure DevOps and GitLab CI. Handles OAuth S2S secrets injection, multi-workspace promotion (stage → prod), deploy gating with manifest validation. Use this skill whenever the user mentions CI/CD for App Builder, GitHub Actions for aio deploy, automated deployment pipelines, continuous integration, continuous delivery, deploy automation, multi-environment promotion, aio app add ci, or wants to automate their App Builder build and release process. Also trigger when users mention deploy workflows, release pipelines, or GitHub secrets for App Builder.
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OCIOStateOfNebraska/stateofnebraska-aem☆ 32026年10月9日 更新
Set up CI/CD pipelines for Adobe App Builder projects. Generates GitHub Actions workflows using adobe/aio-cli-setup-action@3 and adobe/aio-apps-action@3.3.0, plus patterns for Azure DevOps and GitLab CI. Handles OAuth S2S secrets injection, multi-workspace promotion (stage → prod), deploy gating with manifest validation. Use this skill whenever the user mentions CI/CD for App Builder, GitHub Actions for aio deploy, automated deployment pipelines, continuous integration, continuous delivery, deploy automation, multi-environment promotion, aio app add ci, or wants to automate their App Builder build and release process. Also trigger when users mention deploy workflows, release pipelines, or GitHub secrets for App Builder.
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aemgdc/aemdev☆ 22026年10月13日 更新
Use when bumping the AionUi version: query AionCore release, verify artifacts, update package.json, generate CHANGELOG, branch, commit, push, create PR, auto-merge, tag release.
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iOfficeAI/AionUi☆ 3.3万2026年9月9日 更新
Devin Akin 视角 — CWNP 联合创始人 / CWNE 流派奠基 / Wi-Fi Vitae 播客主持 / Divergent Dynamics 创办人. 加载后让 AI 用「RF 物理是地基, vendor 是装修」/「教育是 bottleneck 不是技术」/「AIOps 多数是营销层叠加」三大镜片审视企业 Wi-Fi 决策, 特别是 vendor 选型 / 培训路径 / 厂商话术辨别 / AIOps 评估场景. 反 marketing 倾向 + 25 年 instructor 视角 + vendor-neutral 立场. 触发词: 「Akin 怎么看」「这个 vendor 培训值不值」「vendor neutral 路径」「这个 AIOps 营销真的吗」「我团队该学什么」「先 CWNA 还是先 UEWA」「Mist Marvis 真的有用吗」「我们要不要上 AI WLAN」.
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swaylq/master-skill☆ 1552026年9月6日 更新
Use on Day 1 of an AIS-OS install, when someone says "set me up", "onboard me", "let's get started", "fill in my AIOS", or has just cloned the kit. Combined wizard — runs the 7-question intake AND scaffolds the Day-1 file set at the end. Idempotent — re-run any time after editing aios-intake.md.
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alirezarezvani/gaios☆ 492026年6月7日 更新
Use when building Python async HTTP services or clients with aiohttp - web server routing, middleware, WebSocket, SSE, streaming, client sessions, pytest-aiohttp testing, or troubleshooting SSL and timeout issues
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CodeAtCode/oss-ai-skills☆ 242026年10月9日 更新
/cs:caio-review <plan> — Eval-demanding Chief AI Officer interrogation of any plan that involves AI: model selection, risk classification, cost economics, or AI hiring. Use when shipping an AI feature without an eval set, choosing between API, fine-tune, and self-hosted, or classifying a use case under the EU AI Act.
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alirezarezvani/claude-skills☆ 2.8万2026年8月30日 更新
Azure Resource Manager SDK for Arize AI Observability and Evaluation (.NET). Use when managing Arize AI organizations on Azure via Azure Marketplace, creating/updating/deleting Arize resources, or integrating Arize ML observability into .NET applications. Triggers: "Arize AI", "ML observability", "ArizeAIObservabilityEval", "Arize organization".
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microsoft/skills☆ 3,1072026年10月13日 更新
Use when someone asks to link a project, file, folder, or important context into AGENTS.md or their AIOS routing, or says "link this into my AIOS" or "add this to my routing".
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nateherkai/AIS-OS☆ 1,6132026年9月7日 更新
Use on Day 1 of an AIS-OS install, when someone says "set me up", "onboard me", "let's get started", "fill in my AIOS", or has just cloned the kit. Combined wizard — runs the 7-question intake AND scaffolds the Day-1 file set at the end. Idempotent — re-run any time after editing aios-intake.md.
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nateherkai/AIS-OS☆ 1,6132026年9月7日 更新
医疗美容 (医疗美容 / 注射美容 (Medical Aesthetics & Injectables) — 以「医疗本质 + 消费属性双高」为特征的中国医美认知操作系统：从「求美者咨询与面诊（需求/解剖/审美/预算/禁忌）→ 方案设计（注射 vs 手术、单项 vs 联合、分次 vs 一次）→ 产品与术式选型（玻尿酸/肉毒/再生类/光电/手术）→ 知情同意与风险告知 → 操作执行（无菌/层次/剂量/解剖避险）→ 术后管理与随访 → 并发症识别与处理/修复 → 机构合规运营与获客」的完整临床-审美-合规-经营决策链。覆盖 (a) 第一性张力 — **医疗本质/安全/循证/解剖（这是外科与皮肤科的医疗行为，血管栓塞致盲/肉毒中毒/感染可致残致死）⇄ 消费/营销/颜值经济/获客（机构靠流量与转化生存，价格战/直播带货/导流）**；**注射派/微整/午餐美容（玻尿酸 filler、肉毒 botox、水光、再生材料童颜针/少女针、线雕、无创/微创、恢复快）⇄ 手术派/整形外科（隆鼻/眼综合/隆胸/吸脂抽脂/面部提升拉皮/正颌、创伤大恢复久效果持久）**；**正规医疗（持《医疗机构执业许可证》+ 执业医师/主诊医师备案 + 三类医疗器械注册证 + 正品药械）⇄ 黑医美/三非（非法机构、非法药械/水货假货、非法行医/工作室/美容院越界、生活美容冒充医疗美容）**；**产品/厂商营销（进口 vs 国产、艾尔建/高德美/乔雅登 vs 爱美客/华熙/昊海、'认准正品'、网红爆品）⇄ 医生技术与审美（同样的针剂效果取决于医生的解剖功底/审美/手法，'产品是地板技术是天花板'）**；**循证/适应证/风险告知/拒绝过度治疗（医生伦理：该劝退就劝退、不做无适应证项目）⇄ 求美者预期管理/容貌焦虑/成瘾性消费（过度医美/医美贷/容貌焦虑被制造、'变美才能…'）**；**强监管合规（医疗广告法、医师法、医疗机构管理条例、器械分类管理、卫健委/药监局监管、医美专项整治）⇄ 灰色地带（医美贷、医托/渠道医院返佣、跨境就医、水货走私、超范围执业、虚假宣传/对比图造假）**。(b) 核心工作流 / pipeline（最标准、最易蒸高质量 + CLI 化）— 通用临床链：求美者面诊与需求挖掘（主诉/动机筛查/排查容貌焦虑与 BDD 体象障碍/解剖评估/Fitzpatrick 皮肤分型/既往史与禁忌）→ 审美设计与方案（面部分区/比例/动态/老化机制评估，注射 vs 手术 vs 联合，分次规划）→ 产品/术式选型与知情同意（材料选择/剂量/层次/风险并发症逐项告知/签署知情同意/留存术前照）→ 操作执行（无菌、解剖层次、剂量分配、危险三角/血管走行避险、回抽/缓慢推注/钝针、肉毒注射点位与剂量）→ 术后医嘱与随访（冷敷/护理/复查/补打）→ 并发症识别与急救（血管栓塞即刻处理/玻尿酸溶解酶透明质酸酶、肉毒扩散、感染、结节肉芽肿、丁达尔、栓塞致盲急救流程）→ 修复与转诊。机构经营链：选址定位→科室与人才（医生/护士/咨询师/运营）→获客（线上新氧/美团/抖音、私域、转介绍）→咨询转化→履约与复购→口碑与投诉处理→合规风控（资质/广告/价格/票据/病历）。(c) 工具栈 — 注射药械（玻尿酸：乔雅登/瑞蓝/海薇/润百颜/嗨体；肉毒：保妥适 Botox/吉适 Dysport/衡力/乐提葆/西马；再生类：童颜针 Sculptra-PLLA/少女针 Ellansé-PCL/濡白天使/艾维岚/嗨体熊猫针；线材：PPDO/PCL 线雕）、光电设备（热玛吉 Thermage/超声炮/Fotona 4D/皮秒/调Q/光子嫩肤 IPL/CO2 点阵激光/黄金微针）、术前评估与影像（VISIA 皮肤检测/面部 3D 模拟/AI 测脸/超声定位血管）、机构管理与获客（新氧 SoYoung、更美、美团医美、抖音/小红书种草、私域 SCRM、CRM 客户管理、电子病历 HIS、知情同意与病历系统）、合规与查验（NMPA 国家药监局器械/化妆品查询、卫健委医疗机构与医师执业查询、械字号查真伪、海关正品溯源）。(d) 知识正典 — 医美 canon 横跨医学专业与行业实务：临床专业（整形外科学/皮肤科学教材、注射解剖图谱如《面部危险区与注射解剖》、肉毒与填充剂临床指南/专家共识如中国面部注射美容专家共识/中华医学会医学美容分会指南、并发症处理共识、MD Codes 注射方法学 Mauricio de Maio）、循证与期刊（中华医学美学美容杂志、中国美容整形外科杂志、Aesthetic Surgery Journal、Plastic and Reconstructive Surgery、JAMA Dermatology、Dermatologic Surgery）、监管法规（医疗美容服务管理办法、医疗机构管理条例、医师法、医疗广告管理办法、医疗器械监督管理条例、医美专项整治文件、消费者权益保护）、行业研究与白皮书（艾瑞/德勤/弗若斯特沙利文医美行业报告、新氧医美白皮书、上市公司爱美客/华熙生物/昊海/朗姿招股书与年报）。(e) figures/流派 — 临床专家与学术（整形外科与皮肤科主任医师、注射美容专家共识执笔人、医学美容分会与整形美容协会专家、知名公立三甲整形科/八大处/上海九院/华西/中国医学科学院整形外科医院专家、注射解剖与并发症权威）、产业与企业（爱美客/华熙生物/昊海/朗姿/华韩等上市公司创始人与高管、新氧/更美创始人、连锁医美机构创始人）、医生 KOL 与科普（做科普打假的皮肤科/整形科医生、揭黑医美与营销套路的从业者）、海外术式 originator（MD Codes 的 Mauricio de Maio、各注射技法/线雕/光电术式发明人）。流派分歧：注射派 vs 手术派、医疗循证派 vs 消费营销派、'产品论'（认准大牌正品）vs '医生论'（技术审美决定效果）、保守自然派 vs 网红改造派（过度医美/科技脸/欧式大平行）、公立学院派 vs 民营连锁派、'劝退伦理'派 vs '满足需求'派。(f) 行业话术/黑话 — 面诊 / 主诉 / 求美者 / 适应证 / 禁忌证 / 知情同意 / 注射层次（皮内/真皮/皮下/骨膜上/SMAS）/ 剂量 / 单位（U）/ 支（玻尿酸 1ml）/ 回抽 / 钝针 vs 锐针 / 危险三角 / 血管栓塞 / 栓塞致盲 / 溶解酶（透明质酸酶）/ 丁达尔现象 / 结节 / 肉芽肿 / 移位 / 肉毒 / 除皱 / 瘦脸针 / 瘦肩针 / 玻尿酸 / 填充 / 水光 / 童颜针 / 少女针 / 再生材料 / 胶原再生 / 线雕 / 提升 / 热玛吉 / 超声炮 / 光子嫩肤 / 皮秒 / 抗衰 / 微整 / 轻医美 / 重医美 / 联合治疗 / 全脸设计 / MD Codes / 三庭五眼 / 黄金比例 / 苹果肌 / 卧蚕 / 泪沟 / 法令纹 / 木偶纹 / 颞部 / 面部老化 / 容积缺失 / 三非 / 黑医美 / 水货 / 假货 / 械字号 / 妆字号 / 国械注准 / 正品溯源 / 渠道医院 / 医托 / 导流 / 医美贷 / 面诊转化 / 升单 / 复购 / 拓客 / 体验价 / 钓鱼 / 莆田系 / 修复 / 翻车 / 容貌焦虑 / BDD（体象障碍）/ 过度医美 / 科技脸 / 自然派 / 五分钟变美 / 午餐美容。(g) 争议/批判 — 「医疗本质 vs 消费营销」（医美被当快消品营销、价格战与品质安全冲突）、「黑医美与三非泛滥」（非法机构/水货假货/非法行医致毁容致死案例、生活美容越界打针）、「容貌焦虑与过度医美」（贩卖容貌焦虑、医美成瘾、未成年医美、医美贷套路贷、整容低龄化）、「虚假宣传与对比图造假」（夸大效果、伪科普、网红医生带货、'一针逆龄'）、「产品论 vs 医生论」（认正品 vs 重技术，水货与正品之争、同质化价格战）、「渠道返佣与医托」（渠道医院高返佣推高价格、医托拉客）、「并发症与维权难」（栓塞致盲/感染/毁容、举证难维权难、修复市场乱）、「监管与灰色地带」（超范围执业、医师资质挂靠、跨境医美、医美贷金融风险）。(h) 大量隐性临床手艺 + 审美 + 沟通 + 经营软技能（注射的解剖空间感与层次手感、危险区避险与回抽习惯、剂量与审美的平衡、全脸动态设计、并发症的快速识别与急救决断、面诊的需求挖掘与预期管理与劝退、容貌焦虑/BDD 的筛查、知情同意的真实告知、机构的合规风控与口碑经营）是高 tacit、靠规范化培训 + 大量临床实操 + 并发症处理经验 + 审美修养积累的核心，且医疗安全红线不可让渡。水分极高（大量营销号/伪科普/带货软文/'某院某专家'刷屏/对比图造假/培训速成班割韭菜（'7天速成注射师'是非法行医温床）/黑医美洗白），须强 source 过滤：优先 临床专家共识/指南 + 监管法规原文（NMPA/卫健委）+ 厂商械字号官方信息 + 专业期刊 + 整形外科/皮肤科专家本人科普 + 上市公司披露 > 行业研究报告 > 二手转述 > 营销号/带货软文（严防当知识来源）。严防把'变美话术/带货推荐/速成培训'当医疗知识，严防软化并发症风险与黑医美批判。不含: 生活美容/美容院护理（皮肤管理/美甲美睫，非医疗）、口腔正畸种植牙（另立专科）、毛发移植植发（可少量提及不深覆盖）、减肥代谢类药物（司美格鲁肽等另属内分泌）、纯护肤品/化妆品配方（妆字号护肤是另一行）、心理整形咨询的纯心理治疗部分（借用 BDD 筛查但不深入精神科）。) Master OS — automated mastery of 医疗美容 / 注射美容 (Medical
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swaylq/master-skill☆ 1552026年9月6日 更新
Use when writing asyncio Python code — async/await coroutines, concurrent I/O with asyncio.gather, task creation and cancellation, semaphore rate limiting, producer-consumer queues, async context managers, async generators, WebSocket servers, aiohttp web scraping, async database operations, run_in_executor for blocking calls, or testing async code with pytest-asyncio. Covers FastAPI and aiohttp patterns, synchronization primitives, timeout handling, and common pitfalls like event loop blocking and missing await.
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Jamie-BitFlight/claude_skills☆ 672026年10月12日 更新
Use when the user brings any fuzzy, half-formed, or interrupt-driven input — an order from a boss, a forwarded email thread, a ticket, a chat message, a "can you look into X", a raw idea — and it needs framing before work starts. Turns the input into a structured brief (Context · Desired outcome · Goal · Owner · Next step · Decision needed). This is the AIOS's front door; run most things through it first. Trigger on "/structure", "frame this", "what's the actual ask here", "structure this", or any vague task that lacks a defined outcome.
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alirezarezvani/gaios☆ 492026年6月7日 更新
First-run guided setup for a fresh gAIOS clone. Interviews the user (identity, role, priorities, voice, connections, team, pain, guardrails) and fills the templates — CLAUDE.md, context/, references/voice.md, connections.md — then introduces the WAT / wiki / workflows / experiments features. Trigger on "/setup", "set me up", "get started", "onboard me", or a fresh clone where CLAUDE.md still has {{placeholders}}.
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alirezarezvani/gaios☆ 492026年6月7日 更新
Implement AI-powered anomaly detection for operational metrics using time series analysis (Isolation Forest, Prophet, LSTM), alert correlation, and root cause analysis. Reduce alert fatigue by intelligently identifying true anomalies in system metrics, logs, and traces. Use when operations teams are overwhelmed by alert volume, when detecting complex multi-metric anomalies beyond static thresholds, when seasonal patterns make thresholds ineffective, or when needing to predict issues proactively before they impact users.
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pjt222/agent-almanac☆ 372026年10月12日 更新
Email tem o maior ROI de qualquer canal de marketing. R$ 36 para cada R$ 1 gasto. Mas a maioria das startups trata como secundário - envios em massa, sem personalização, caindo em spam. Esta skill cobre email transacional que funciona, automação de marketing que converte, entregabilidade que atinge caixas de entrada, e decisões de infraestrutura que escalam. Use quando: keywords, file_patterns, code_patterns.
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artubss/SKILLS-CLAUDE-CODE☆ 112026年5月17日 更新
Infers person-to-person transmission from pathogen genomes using outbreaker2 (Campbell 2018), TransPhylo (Didelot 2017), phybreak (Klinkenberg 2017), BadTrIP (De Maio 2018), SCOTTI (De Maio 2016), BEASTLIER (Hall 2015), and SNP-distance / cluster-picker approaches (HIV-TRACE for HIV; transcluster). Defines outbreak clusters using pathogen-specific SNP thresholds (NOT a universal cutoff -- TB <=12 SNPs / Walker 2013; MRSA <=15 / Coll 2017; C. difficile <=2 / Eyre 2013; Klebsiella <=21 / Snitkin 2012), models within-host diversity and transmission bottlenecks (Worby-Lipsitch-Hanage 2014; McCrone 2018; Sobel Leonard 2017; Lythgoe 2021 SARS-CoV-2), integrates contact-tracing data, distinguishes generation interval from serial interval (Britton & Scalia Tomba 2019; Ali 2020), attributes source via Bayesian source attribution (Mather 2013 DT104; islandR), and reconciles transmission-network reconstruction with epi metadata. Use when investigating outbreaks for who-infected-whom, defining SNP-cluster outbreak definitions, accounting for unsampled intermediates, choosing between outbreaker2 (rich epi data) and TransPhylo (genomic-only after dated phylogeny), running source attribution between host populations, calling HIV-TRACE thresholds appropriate to the local subtype, or distinguishing recent transmission from reactivation in TB / chronic HIV.
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peacezha/TRACE☆ 32026年10月11日 更新
Generate and run tests for Adobe App Builder actions and UI components. Scaffolds Jest unit tests, integration tests against deployed actions, contract tests for Adobe API interactions, and React component tests using Testing Library. Provides mock helpers for State, Files, Events SDKs, @adobe/aio-lib-* clients, ExC Shell context (@adobe/exc-app), and UIX Guest SDK (@adobe/uix-guest). Use this skill whenever the user mentions testing App Builder actions, writing unit tests for Runtime actions, creating integration tests, mocking Adobe SDKs, setting up test fixtures, running aio app test, or wants to verify action behavior before deployment. Also trigger when users mention Jest configuration for App Builder, test coverage, CI test setup, React component test, Testing Library, UI test, Provider wrapper, test my page, test my form, test my table, test my component, mock shell context, mock extension context, debug test failures, or fix Jest errors.
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OCIOStateOfNebraska/stateofnebraska-aem☆ 32026年10月9日 更新
Infers person-to-person transmission from pathogen genomes using outbreaker2 (Campbell 2018), TransPhylo (Didelot 2017), phybreak (Klinkenberg 2017), BadTrIP (De Maio 2018), SCOTTI (De Maio 2016), BEASTLIER (Hall 2015), and SNP-distance / cluster-picker approaches (HIV-TRACE for HIV; transcluster). Defines outbreak clusters using pathogen-specific SNP thresholds (NOT a universal cutoff -- TB <=12 SNPs / Walker 2013; MRSA <=15 / Coll 2017; C. difficile <=2 / Eyre 2013; Klebsiella <=21 / Snitkin 2012), models within-host diversity and transmission bottlenecks (Worby-Lipsitch-Hanage 2014; McCrone 2018; Sobel Leonard 2017; Lythgoe 2021 SARS-CoV-2), integrates contact-tracing data, distinguishes generation interval from serial interval (Britton & Scalia Tomba 2019; Ali 2020), attributes source via Bayesian source attribution (Mather 2013 DT104; islandR), and reconciles transmission-network reconstruction with epi metadata. Use when investigating outbreaks for who-infected-whom, defining SNP-cluster outbreak definitions, accounting for unsampled intermediates, choosing between outbreaker2 (rich epi data) and TransPhylo (genomic-only after dated phylogeny), running source attribution between host populations, calling HIV-TRACE thresholds appropriate to the local subtype, or distinguishing recent transmission from reactivation in TB / chronic HIV.
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peacezha/HPClaw☆ 32026年10月11日 更新