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Fill `outline/tables_index.md` from `outline/table_schema.md` + evidence packs (NO PROSE in cells; citation-backed rows).

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Build a 2+ level taxonomy (`outline/taxonomy.yml`) from a core paper set and scope constraints, with short descriptions per node.

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Normalize terminology across a draft (canonical terms + synonym policy) without changing citations or meaning.

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为中文毕业论文补强并核验引用：找出必须有引文支撑的句子，扩展候选文献，检查引用与论断是否匹配，并回写参考文献与正文引用。

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对中文毕业论文进行编译、warning 分级、模板模式检查、数据与引用复查，并把问题回写成可继续迭代的 review checklist。

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在 Markdown 中间层统一毕业论文的主线、术语、符号、指标、图表口径与章节边界，让整篇论文先在中间层收敛成“一篇论文”。

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维护中文毕业论文的 `codex_md/question_list.md`：把本轮问题、边界、优先级、协作方案和验收口径结构化，作为整条 thesis pipeline 的控制面。

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将中文毕业论文已有材料映射到“毕业论文角色”：把论文、模板、Overleaf 源稿、PDF、图表和实验材料按章节角色、研究问题和证据用途重新归位。

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对中文毕业论文做最终润色与去 AI 味：重点处理章首导言、章末小结、贡献描述、总结与展望中的模板腔、宣传腔与 AI 口癖。

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初始化中文毕业论文工作区：检查学校模板与已有材料的放置位置，明确提示当前还缺什么，建立 `codex_md/` / `claude_md/` / `tmp_layout*/` 等中间层目录，并生成材料盘点与初始工作文件。

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Bind addressable evidence IDs from `papers/evidence_bank.jsonl` to each subsection (H3), producing `outline/evidence_bindings.jsonl`.

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Create per-subsection evidence packs (NO PROSE): claim candidates, concrete comparisons, evaluation protocol, limitations, plus citation-backed evidence snippets with provenance.

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Evidence self-loop for surveys: read evidence bindings + evidence packs, then write an actionable upstream TODO plan (which stage/skill to fix) before writing more prose.

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Use when a tutorial module plan exists but each module still needs a verifiable teaching loop.

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Use when `evidence-review` has screened includes and needs a schema-aligned extraction table.

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Write the survey's front matter files (Abstract, Introduction, Related Work, Discussion, Conclusion) in paper voice, with high citation density and a single evidence-policy paragraph.

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Generate a compact pool of discussion-worthy research directions from the signal table, writing `output/trace/IDEA_DIRECTION_POOL.md`.

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Screen the direction pool with a discussion-first scoring pass, writing `output/trace/IDEA_SCREENING_TABLE.md`.

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Expand and refine search keywords (synonyms, acronyms, exclusions) and update `queries.md`.

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Compile a LaTeX project and run basic QA (missing refs, bib errors, broken citations), producing `latex/main.pdf` and a build report.

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Scaffold a LaTeX project (`latex/main.tex`, optional bibliography wiring, structure) from an existing Markdown draft.

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Rewrite limitation passages so the paper keeps limitations without falling into count-based slot phrases (e.g., \"Two limitations…\") across many H3s.

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Multi-route literature expansion + metadata normalization for evidence-first surveys.

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Use when `paper-review` needs a canonical manuscript text artifact before claim extraction.

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