abinit
免费Generate and manage ABINIT DFT calculations. Use when the user requests ABINIT, or needs DFPT phonons, GW calculations, or BSE optical spectra.
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Hello-QM/catgo-LRG2082026年10月23日 更新
免费在 GitHub 公开
molecular-router
Route molecular modeling tool requests. Covers RDKit (conformers, representations, fingerprints) and AmberTools antechamber (force field parameterization).
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Hello-QM/catgo-LRG星标 208(GitHub 208 + cccskills 0)
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查看安装方法包含的文件（3）
- SKILL.md970 B
- antechamber/SKILL.md4.5 KB
- rdkit/SKILL.md4.5 KB
SKILL.md（原文）
安装前可以查看交给 AI 代理的指令内容。
Molecular Tools Router
Route molecular-level tool requests to the correct sub-skill.
Routing Table
| User intent | Route to |
|---|---|
| Conformer generation, SMILES/InChI parsing, molecular fingerprints | rdkit/SKILL.md |
| GAFF/AMBER force field parameterization, RESP charges | antechamber/SKILL.md |
Quick Decision Guide
- "Generate conformers" / "SMILES to 3D" / "molecular fingerprint" →
rdkit/SKILL.md - "Parameterize molecule" / "GAFF" / "RESP charges" / "AMBER prep" →
antechamber/SKILL.md - "Convert mol2 to pdb" / "add hydrogens" → use
data/openbabel/SKILL.mdinstead - "Pack molecules into box" → use
data/packmol/SKILL.mdinstead
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Use when the user asks to place an adsorbate molecule on a surface, find adsorption sites, or set up a surface+adsorbate model for DFT.
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Use when the user asks for adsorption energy, binding energy, or wants to compare how strongly a molecule binds to a surface.
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Hello-QM/catgo-LRG2082026年10月23日 更新
Use when the user asks to analyze computational results: Gibbs free energy, OER/HER/CO2RR overpotentials, adsorption energy, convergence tests, DOS/d-band analysis, or Bader charge analysis.
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Hello-QM/catgo-LRG2082026年10月23日 更新
Use AmberTools antechamber for molecular force field parameterization. Generates GAFF/GAFF2 parameters and AM1-BCC or RESP charges for use in AMBER or LAMMPS classical MD simulations.
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atom-ops
免费One-shot recipes for adding, deleting, moving, and replacing individual atoms in the active CatGo viewer structure. Use whenever the user asks to "add an atom", "delete atoms", "remove this atom", "move atom N", "replace H with Li", or any single-atom edit — including "add a hydrogen on top of atom 12" / "delete atoms 5–9" / "swap the oxygen at site 3 for fluorine". Skips the discovery loop (no need to list structure tools or check adsorption sites first); goes straight to the matching `catgo_structure` action. Triggers in Chinese on 加原子, 删原子, 减原子, 移动原子, 替换原子, 增加氢, 删除氧, 把 ... 换成 ....
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