データ・AIのスキル

実験や探索的な分析、学習用のJupyterノートブックを作成・整理します。テンプレートを使い、コードと説明を小さな手順に分けて、再実行しやすい構成に整えます。

• 実験用ノートブックを作りたいとき
• スクリプトやメモのノートブック化
• 手順付きの学習教材を作りたいとき

LLMの知識・推論・コード生成などを60以上の共通評価課題で検証し、モデル間の性能比較や学習途中の変化の追跡、研究向けの結果整理を支援します。

• 知識・推論の共通課題でモデルを比較
• 学習途中のモデル性能を追跡したいとき
• 研究報告用に評価結果を整理したいとき

200種類以上の科学データ形式を対象に、構造や欠損、統計量などを調べ、品質の評価と次の分析に向けた提案をMarkdownレポートにまとめます。

• 未知の科学データの中身を確認したいとき
• 欠損やデータ品質を点検したいとき
• 配列・顕微鏡データの分析前確認

文章の意味を数値で表す埋め込みモデルを選び、文書の分割や前処理、検索結果の評価を支援するスキル。意味に基づく検索や、検索資料を使うAI応答の設計に使えます。

• 文書検索用のモデルを選びたいとき
• 文書の分割サイズや重なりの調整
• 複数言語を対象とする検索の設計

NCBI GEOの遺伝子発現データを条件や遺伝子名で検索し、実験情報や発現行列を取得します。公開データの収集から品質確認、群間比較までを支援するスキルです。

• 疾患や生物種で発現データを探したいとき
• 発現行列と試料情報の取得
• 対照群と処理群を比較したいとき

機械学習のモデル選びや精度改善を、単純な予測との比較を通じて検討します。データの偏りや過学習、評価方法を問い直し、少なくとも3回の議論で案を練り直すスキルです。

• 単純な予測とモデルを比較したいとき
• 学習時と評価時の精度差の原因調査
• 特徴量とデータ漏洩の点検

ゲノム上の領域データを使い、重なりの検出や読み取り密度の集計、機械学習向けの変換を支援します。BEDファイルの比較や単一細胞の断片データの分割にも使えます。

• ピークとプロモーター領域の重なりの検出
• 断片データからBigWigを生成したいとき
• ゲノム領域を機械学習用に変換したいとき

病理の全スライド画像から組織領域を見つけ、小さな画像へ切り出して解析用データを準備するスキル。ランダム・格子状・スコア順の抽出や前処理を支援します。

• 組織の一部を抽出して確認したいとき
• 組織全体を格子状に切り出したいとき
• 核密度のスコアでタイルを選びたいとき

学習済みの機械学習モデルについて、目的に合う評価指標を選び、候補同士を比較します。判定しきい値や予測確率の妥当性、検証方法の弱点も整理するスキルです。

• 同じ評価指標で候補モデルを比較したいとき
• 判定しきい値の得失を確認したいとき
• 予測確率の妥当性を確認したいとき

公開がん画像を、がん種や撮影方法などの条件で検索・取得します。CT・MR・PETや病理画像の研究・AI学習用データ選定、ブラウザ表示、利用許諾の確認を支援します。

• AI学習用のがん画像を選びたいとき
• がん種・撮影方法・部位で画像検索
• 放射線・病理画像のブラウザ確認

学習済みの機械学習モデルについて、予測に影響した入力項目や個別の予測理由を整理し、意外な項目の組み合わせや説明の限界を伝えるためのスキル。

• 個別の予測理由を説明したいとき
• 影響の大きい入力項目の確認
• 想定外の特徴量の組み合わせ調査

生物学データの解析手順をPythonで組み立て、Latchに登録・実行する作業を支援します。クラウド上のファイルや試料情報の管理、GPUなどの計算資源の設定も扱います。

• RNA-seq解析の構築とデプロイ
• NextflowやSnakemakeの移行
• Registryでの試料情報と結果の管理

地図上の点・線・領域のデータをPythonで読み込み、位置による結合や面積・距離の計算、座標系の変換、地図の作成、形式変換まで進めるスキル。

• 地域別に地点データを集計したいとき
• 道路付近の建物を抽出したいとき
• 人口で色分けした地図の作成

DNA・RNA・タンパク質の配列をPythonで読み込み、変換や比較、類似配列の検索を行うスキル。構造データの解析や系統樹の作成にも対応します。

• GenBankをFASTAに変換したいとき
• 配列の長さやGC含量を集計したいとき
• BLASTで類似配列を検索・取得したいとき

データの傾向や意味を伝える図表を、軸の尺度、配色、説明の流れから設計し、見る人の知覚や操作性にも配慮した可視化として実装するスキルです。

• 数値から伝わる流れのある図表を作りたいとき
• グラフの尺度や配色を見直したいとき
• 操作して詳細を探れる図表を作りたいとき

取引の外れ値やセンサー値の急上昇など、データ中の不審な記録を調べます。異常検知の手法や判定基準を検討し、人が確認する候補と見落とし・誤検知の確認項目を整理します。

• 取引の外れ値や不正候補を調べたいとき
• センサーの急上昇やまれな障害の調査
• 異常検知の手法と判定基準の比較

Data Commonsの人口・経済・健康・環境の統計をPythonで取得し、地域比較や時系列分析に使える形へ整理。地名や座標からの地域特定も支援します。

• 地域ごとの人口や失業率を比較したいとき
• 過去の統計を取得して推移を調べたいとき
• 地名や座標を検索用の識別子に変換

データに合う目盛りや配色を選び、操作できるグラフや地図を作るためのスキルです。データの取得・整形から、読み手を導く説明の組み立てまで支援します。

• 操作できる図や地図を作りたいとき
• 正確に伝わる目盛りや配色の検討
• データ取得から出力までの処理設計

メモリに収まらない表や数値配列を分割して処理し、複数ファイルの集計や独自の計算を、複数コア・複数マシンで並列実行するPythonの作業を支援するスキル。

• 複数CSVやParquetの一括集計
• メモリを超える数値配列の処理
• JSONやログの整形と分析準備

株価や為替、暗号資産、企業の財務情報、経済指標をAPIで取得するスキルです。過去データやニュースの市場心理分析、50種類以上のテクニカル指標も扱います。

• 過去の株価と出来高を調べたいとき
• 企業の財務諸表や決算の収集
• 為替や暗号資産の価格確認

CSVや集計済みデータから、傾向・分布・比較・相関を伝えるグラフを作成します。読み手に合う図の種類や軸を選び、分析や報告、スライドに使う図表にまとめます。

• 月別のコンバージョン率を図にしたいとき
• 処理の遅延と処理量の関係を調べたいとき
• CSVから簡単なダッシュボードを作りたいとき

DNAnexus上でゲノム解析用アプリの作成、解析データの整理、複数工程の実行を支援し、Pythonによる処理の自動化やジョブ監視まで扱うスキル。

• ゲノム解析用アプリを作りたいとき
• シーケンスデータの登録・整理
• 複数サンプルを一括解析したいとき

データの欠損・重複・値の範囲を検査し、Great Expectationsやdbtで品質チェックを自動化。チーム間で共有するデータ仕様の定義も支援します。

• 注文データの欠損や重複を検査したいとき
• dbtでテーブル間の整合性を確認したいとき
• チーム間でデータ仕様を共有したいとき

分析結果を、背景・課題・発見・提案が伝わる報告書やプレゼンに整えます。図表の見せ方や見出しを工夫し、専門知識のない相手にも判断と次の行動を伝えるスキルです。

• 経営層に分析の要点を伝えたいとき
• 四半期の業績レビュー資料の作成
• 専門外の相手に分析結果を説明