データ分析、機械学習、LLMアプリ、プロンプト設計（9,090 件）
Perform quantitative meta-analysis with effect size calculation, forest plots, funnel plots, and heterogeneity assessment. Use when: user asks to combine results from multiple studies, calculate pooled effect sizes, assess publication bias, or create forest/funnel plots. NOT f...
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質量分析のMS/MSスペクトルを読み込み、ピークやメタデータを整えて類似度を計算し、メタボロミクスで再現可能な比較ワークフローを作ります。
Generate Circos configuration files for circular genomics data visualization. Supports genomic variations (SNPs, CNVs, structural variants), cell-cell communication networks, and custom track configurations for publication-ready circular plots.
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Generate Meta-analysis funnel plots and perform publication bias testing. Takes CSV file with Meta-analysis data as input, outputs funnel plot PNG, Egger test and Begg test results.
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単一細胞データの行列と細胞・遺伝子の注釈をまとめて扱い、`.h5ad`や`zarr`の読み書き、絞り込み、複数データの統合を行います。
Extracts clinical trial baseline data (study, region, participants, etc.) from article text or PMID. Checks PubMed for metadata; always falls back to LLM extraction for full details.
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A comprehensive toolbox for computational molecular biology; use it when you need programmatic sequence/structure parsing, batch bioinformatics pipelines, or automated NCBI/BLAST workflows.
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BiopythonでDNA・RNA・タンパク質のペアワイズ配列アラインメントを行い、複数配列アラインメントの読み書きや形式変換、保存度などの統計計算と絞り込みを支援します。
Analyze data with `adme-property-predictor` using a reproducible workflow, explicit validation, and structured outputs for review-ready interpretation.
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Use Biopython to read/write/convert biological sequence files (FASTA/GenBank/FASTQ, etc.) and perform basic sequence operations; use when you need reliable sequence I/O, lightweight sequence manipulation, or scalable processing of large sequence datasets.
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Generate photorealistic rendering scripts for PyMOL and UCSF ChimeraX.
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Advanced Biopython modules for motifs, population genetics, sequence utilities, restriction analysis, clustering, and GenomeDiagram visualization; use when you need extended bioinformatics analysis beyond basic sequence I/O and alignment.
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遺伝子変異の疾患への影響が、遺伝子発現やメチル化などを介して生じるかを解析し、直接効果・間接効果と媒介割合を推定します。
電子カルテの長文からアレルギー、薬剤、診断、検査値などを抽出し、要点を短い構造化サマリーにまとめるスキルです。
がん種と研究の方向性をもとに、バルク発現データを使う腫瘍バイオマーカー研究の実行計画を、作業量別の構成や検証・図表案とともに組み立てます。
Use when performing correlation analysis between two variables including Pearson and Spearman correlation methods. Supports command-line parameter input, automatic data format detection, parameter validation, result directory creation, and CSV or TXT format result export.
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Use when estimating immune infiltration from bulk RNA-seq expression matrices with ssGSEA/GSVA, comparing case versus control groups, and generating downstream immune-score visualizations. NOT for single-cell RNA-seq, absolute cell proportion estimation, or clinical decision making.
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表形式データから二値分類または回帰のXGBoostモデルを作り、性能表と特徴量の重要度ランキング表・PNG図を出力します。
手元のceRNA参照テーブルと遺伝子・lncRNA候補リストから、共有miRNAの根拠をたどって調節ネットワークを構成し、根拠表やPDF図としてまとめます。
ヒトまたはマウスの遺伝子リストから、Dorotheaの情報を使って関連する転写因子を抽出し、関係表とネットワーク図を作成します。
臨床コホートの生存期間データから単変量・多変量Cox回帰を行い、ハザード比などの結果表とフォレストプロットを作成します。
遺伝子リストとローカルのSTRINGキャッシュからタンパク質間相互作用ネットワークを作成し、ノード・エッジ表や再現可能なPDF図として出力するRのCLIワークフローです。
Use when assessing how well a survival model's predicted probabilities agree with observed outcomes by fitting a Cox model and generating bootstrap calibration curves at one or more prediction horizons from a clinical CSV file. NOT for: nomogram construction, univariate Cox screening, ROC analysis, or decision-curve analysis.
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Use when you need a standardized R CLI workflow to train a two-class random forest model from an expression-like feature matrix, rank variable importance, and generate reproducible error and importance plots. NOT for regression tasks, multi-class classification, missing-value imputation, preprocessing, or remote data fetching.
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