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gaussian_chk_to_fchk

使用 Gaussian 的 formchk 工具将 chk 检查点文件转换为 fchk 波函数文本文件。

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Files included (3)

  • SKILL.md2.3 KB
  • scripts/run_gaussian_chk_to_fchk.py6.5 KB
  • skill.json1.6 KB

SKILL.md (original)

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Gaussian chk to fchk Converter

功能说明

使用 Gaussian 的 formchk 工具将 chk 检查点文件转换为 fchk 波函数文本文件。支持 Windows 和 Linux 系统。

触发条件

当需要将 Gaussian 计算生成的 chk 文件转换为 fchk 文本格式时触发。

使用方法

python scripts/run_gaussian_chk_to_fchk.py \
    --input_path input.chk \
    --fchk_output_path output.fchk \
    --compressed_output_path output.zip

参数说明

参数类型必填说明
input_pathstring是输入 chk 文件路径
other_paramstring否额外参数
fchk_output_pathstring是转换后的 fchk 文件路径
compressed_output_pathstring是输出文件压缩包路径

输出参数

参数类型说明
fchk_output_pathstring转换后的 fchk 文件路径
compressed_output_pathstring输出文件压缩包路径

输出结构

输出目录包含:

  • *.fchk - 转换后的波函数文本文件
  • stderr.log - 错误日志(如有)
  • output.zip - 包含所有输出文件的压缩包

依赖

  • Python 3.x
  • Gaussian 16

注意事项

  1. 确保已正确安装 Gaussian 并配置环境变量
  2. 在 Linux 上,环境变量会自动从 ~/.bashrc 中读取
  3. 在 Windows 上,需要设置 g16root 环境变量或确保 Gaussian 安装在默认路径

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