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概要と使いどころ
Use when preparing full pre-earnings preview reports with executive summary, expectation bar, guidance credibility, KPI dashboard, scenarios, and call questions. Do not use after results or for short summaries unless the user explicitly asks for a summary/short version.
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Use when building PM-facing Public Equity Investing trade pitches, including sparse-context or partial-section requests. Do not use for formal memos; use memo-builder.
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Use as the top-level router for Omniverse Realtime Viewer USD app requests and focused viewer reference documents.
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Run or plan bulk RNA-seq FASTQ-to-count processing with sample-sheet, strandedness, genome annotation, alignment or pseudoalignment, MultiQC, and count-matrix QC checks.
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Submit compact PubChem PUG REST requests for compound properties, descriptions, assay summaries, and substance metadata. Use when a user wants concise PubChem summaries
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Submit compact Clinical Tables NCBI Gene requests for human gene lookup, pagination, and field selection. Use when a user wants concise autocomplete-style human gene search results
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Manage Mixpanel Headless authentication: check session state, list/add/use accounts, run OAuth login, switch projects/workspaces, manage targets, and check bridge credentials.
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Submit compact QuickGO requests for GO terms, annotations, and ontology traversal. Use when a user wants concise QuickGO summaries
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Submit compact NCBI PMC Open Access requests for article/file availability metadata. Use when a user wants concise PMC Open Access summaries; save raw XML only on request.
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Check whether public NGS tools and packages already exist before downloading, installing, or running a sequencing pipeline.
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Fetch compact TPMI PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise TPMI association results for one variant
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Base rules for end users calling NVIDIA cuOpt (routing/LP/MILP/QP/install/server). Not for cuOpt internals — use cuopt-developer for those.
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Route BCL, FASTQ, BAM/CRAM, count-matrix, or VCF sequencing requests to the right public NGS analysis skill and ask only the missing assay-specific setup questions.
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Fetch compact UKB-TOPMed PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise UKB-TOPMed association results for one variant
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Validate FASTQ inputs, run local FastQC/MultiQC QC, interpret QC signals, and optionally execute fastp or Cutadapt trimming branches without overwriting raw reads.
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Validate Illumina BCL run folders and sample sheets, plan demultiplexing, review index/UMI/lane choices, run BCL-to-FASTQ conversion, and interpret demux metrics while surfacing license/download boundaries.
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Submit compact HMDB search requests for metabolites, proteins, diseases, and pathways. Use when a user wants concise HMDB summaries
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Submit compact Genebass gene burden requests for one Ensembl gene ID and one burden set. Use when a user wants concise Genebass PheWAS summaries
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Submit compact Human Protein Atlas requests for gene JSON, search downloads, and page-level tissue or cell-line lookups. Use when a user wants concise Human Protein Atlas summaries; save raw JSON or HTML only on request.
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Submit compact CIViC GraphQL requests for cancer variant interpretation schema inspection and targeted evidence retrieval. Use when a user wants concise CIViC summaries
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GSAP animation reference for HyperFrames. Covers gsap.to(), from(), fromTo(), easing, stagger, defaults, timelines (gsap.timeline(), position parameter, labels, nesting, playback), and performance (transforms, will-change, quickTo). Use when writing GSAP animations in HyperFrames compositions.
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Fetch compact FinnGen PheWAS summaries for single variants by accepting rsID, GRCh37, or GRCh38 input and resolving to the required GRCh38 query. Use when a user wants concise FinnGen association results for one variant
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Submit compact ClinVar Clinical Tables and NCBI Variation requests for search, VCV, RCV, SCV, and RefSNP lookups. Use when a user wants variant-level summaries or identifier mapping
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Install and wire registry blocks and components into HyperFrames compositions. Use when running hyperframes add, installing a block or component, wiring an installed item into index.html, or working with hyperframes.json. Covers the add command, install locations, block sub-composition wiring, component snippet merging, and registry discovery.
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