「tip」の検索結果

Loads, converts, and manipulates Hi-C contact matrices in cooler format (.cool/.mcool/.scool) and Juicer .hic, using cooler (Python + CLI), hic2cool, and hictk. Covers the single-resolution mcool URI (file.mcool::/resolutions/<bp>), the load-bearing divisive-vs-multiplicative weight-naming rule (KR/VC/VC_SQRT auto-divisive vs cooler's multiplicative weight), what survives .hic<->.cool conversion (FRAG matrices and norm vectors do not), raw-vs-balanced coarsening, the .pairs upper-triangle/chromsize-order contract, and chrom-naming/bin-table provenance. Use when loading a cooler, converting .hic to .mcool, selecting a resolution, building a cooler from pairs or a matrix, coarsening/zoomifying, importing Juicer norm vectors, or debugging all-NaN balanced matrices and chr1-vs-1 empty fetches.

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Controls error rates across thousands of simultaneous tests in genomics discovery using false-discovery-rate methods (Benjamini-Hochberg 1995; Benjamini-Yekutieli 2001 for arbitrary dependence; Storey q-value with pi0 estimation; local FDR; independent filtering Bourgon 2010; covariate-weighted FDR via IHW Ignatiadis 2016), plus family-wise error control (Bonferroni, Holm) and the GWAS genome-wide threshold. Covers the FDR-versus-FWER choice as the discovery-versus-confirmatory distinction, the dependence assumptions behind BH (PRDS) versus BY, pi0 estimation, the independent-filtering and false-coverage-rate traps, and reproducibility ranking via IDR (Li 2011). Use when correcting p-values from genome-wide tests, choosing between BH/BY/q-value/Bonferroni, setting an FDR threshold, applying IHW or independent filtering, or interpreting q-values. For confirmatory trials with few pre-specified endpoints (closed testing, graphical/gatekeeping), see clinical-biostatistics/multiplicity-graphical.

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Implements missing-data sensitivity analyses for confirmatory clinical trials including MMRM under MAR (with Kenward-Roger correction), reference-based multiple imputation (J2R, CR, CIR, LMCF per Carpenter-Roger 2013), Permutt delta-adjustment / tipping-point analysis, pattern-mixture identifying restrictions (CCMV, NCMV, ACMV), and the Cro vs Bartlett variance debate. Use when handling missing primary or secondary endpoint data in regulatory submissions following NRC 2010 and ICH E9(R1).

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Perform multiple sequence alignment using MAFFT, MUSCLE5, ClustalOmega, or T-Coffee. Guides tool and algorithm selection based on dataset size, sequence divergence, and downstream application. Use when aligning three or more homologous sequences for phylogenetics, conservation analysis, or evolutionary studies.

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Parse and analyze multiple sequence alignments using Biopython. Extract sequences, identify conserved regions, analyze gaps, work with annotations, and manipulate alignment data for downstream analysis. Use when parsing or manipulating multiple sequence alignments.

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Use this skill when a driver holds CDLs in multiple states or has resided in multiple states. Covers what MVRs to pull, federal recordkeeping requirements, and state-specific issues.

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AndroidおよびKotlin Multiplatformプロジェクトのためのクリーンアーキテクチャパターン — モジュール構成、依存関係ルール、UseCase、Repository、データレイヤーパターン

When the user needs to integrate multiple data sources (Canvas API, user memory, file systems) to create comprehensive academic reports. This skill combines course information, assignment details, submission status, and user context to generate actionable insights. Triggers include requests that involve cross-referencing multiple data sources or creating consolidated academic reports from disparate systems.

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When the user needs to set up multiple academic courses in a learning management system (Canvas/LMS) from structured data sources. This skill automates the entire workflow extracting course schedules from emails/attachments, matching instructors from CSV files, creating courses, enrolling teachers, publishing announcements with class details, uploading syllabi, enabling resource sharing for instructors teaching multiple courses, and publishing all courses. Triggers include course schedule setup, Canvas/LMS administration, academic term preparation, instructor assignment, syllabus distribution, and multi-course management.

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Complete Three.js building system with spatial indexing, structural physics, and multiplayer networking. Use for survival/crafting games, sandbox games, multiplayer construction, or any 3D building mechanics.

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Compose Multiplatform and Jetpack Compose patterns for KMP projects — state management, navigation, theming, performance, and platform-specific UI.

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Substackの編集画面（Tiptap/ProseMirror）で、指摘済みの誤字脱字などの修正リストをスクリーンショット操作なしで高速に反映するスキル。jp-checkの校正結果をSubstack下書きに適用するときなどに使う。

Building a Threat Intelligence Platform (TIP) involves deploying and integrating multiple CTI tools into a unified system for collecting, analyzing, enriching, and disseminating threat intelligence. T

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Implement an accepted change in bounded dependency-ordered increments when the user requests implementation and the scope benefits from multiple coherent slices; do not trigger merely because work touches multiple files, changes behavior, or is over an arbitrary line count.

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Cross-pollination multiplier technique: find a vulnerability in one package, then search for the same pattern across all similar packages to multiply findings.

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Expert at handling file uploads and cloud storage. Covers S3, Cloudflare R2, presigned URLs, multipart uploads, and image optimization. Knows how to handle large files without blocking. Use when: file upload, S3, R2, presigned URL, multipart.

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S3, multipart uploads, CDN integration, and presigned URLs for file storage. Activate on: file upload, S3, presigned URL, multipart upload, CDN, blob storage, image upload, media storage. NOT for: data warehouse storage (use lakehouse-architect), database design (use dimensional-modeler).

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Cooperative vibe coding across machines — real-time collaborative development with humans and AI agents. Covers current tools (Live Share, Code With Me, Zed, Cursor multiplayer, tmux), git-based async patterns, AI agent coordination, and the aspirational future of multi-human multi-agent development. Activate on: "pair programming", "vibe coding together", "collaborative coding", "mob programming", "remote pairing", "code together", "multiplayer coding", "Live Share", "Code With Me", "ensemble programming", "cooperative development". NOT for: building a real-time collaboration ENGINE (use real-time-collaboration-engine), git workflow mechanics (use git-best-practices), single-user AI coding assistance.

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OpenClawのGitHub Secret Scanningアラートを調べ、IssueやPRなどに残る秘密情報の伏せ字化、コメントの削除・再作成、通知とアラート処理を進めるスキル。

• 認証情報の漏えい箇所を調べたいとき
• IssueやPR本文の秘密情報の伏せ字化
• 秘密情報を含むコメントの削除・再作成

OpenClawのターミナル画面を固定のサンプルデータで試作し、実際の描画部品を使った2〜6案をtmuxで並べて操作・比較するスキル。

• 初期設定画面の案を比較したいとき
• チャットや選択画面の配置検討
• 既存画面と改善案を比べたいとき

OpenClaw全体の品質検証を継続し、不具合の再現から根本原因の修正、レビュー、反映確認まで進めます。実環境や負荷の検証結果を、再開可能な報告書に記録します。

• OpenClawの複数領域の不具合調査
• 回帰テストと独立レビューで修正を検証
• 実接続・UI・配布物の動作確認

GitHubのIssueを条件で絞り込み、修正・テスト・PR作成をバックグラウンドのエージェントに任せます。重複作業の回避やレビュー指摘への対応も扱います。

• ラベルや担当者で課題を選びたいとき
• 複数の課題の修正PRを作りたいとき
• 作成したPRのレビュー対応

ブログやRSS/Atomフィードを登録し、更新をスキャンして新着記事を見つけ、記事一覧の確認や既読管理、登録先の追加・削除を行うスキル。

• お気に入りブログの新着確認
• 複数のRSS/Atomを追いたいとき
• 確認した記事を既読にしたいとき

コードレビューの指摘を実際のコードや対応環境と照らし合わせ、妥当性を確認します。不明点の整理、根拠を示した返答、修正ごとのテストまで進めるスキルです。

• 曖昧なレビュー指摘を整理したいとき
• 提案された変更の互換性確認
• 追加機能が使われているか調べたいとき