「plugins」の検索結果

Run or plan bulk RNA-seq FASTQ-to-count processing with sample-sheet, strandedness, genome annotation, alignment or pseudoalignment, MultiQC, and count-matrix QC checks.

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Submit compact NCBI Datasets v2 requests for assembly, genome, taxonomy, and related metadata endpoints. Use when a user wants concise NCBI Datasets summaries; save raw JSON or text only on request.

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Check whether public NGS tools and packages already exist before downloading, installing, or running a sequencing pipeline.

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Capture conversations and decisions into structured Notion pages; use when turning chats/notes into wiki entries, how-tos, decisions, or FAQs with proper linking.

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Submit compact STRING API requests for network, interaction partner, and enrichment endpoints. Use when a user wants concise STRING summaries

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Submit compact PRIDE Archive API requests for proteomics project discovery and project-level metadata. Use when a user wants concise PRIDE summaries

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Dispatch WGS, WES, or targeted DNA variant requests to germline, somatic, or UMI-panel skills, then plan public nf-core/sarek, GATK4, DeepVariant, samtools, or bcftools workflows.

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Submit compact ProteomeXchange PROXI requests for datasets, libraries, peptidoforms, proteins, PSMs, spectra, and USI examples. Use when a user wants concise PROXI summaries

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Submit compact PubChem PUG REST requests for compound properties, descriptions, assay summaries, and substance metadata. Use when a user wants concise PubChem summaries

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Submit compact Rhea reaction search requests for biochemical reactions and reaction IDs. Use when a user wants concise Rhea summaries

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Use when asked to install, deploy, run, validate, troubleshoot, or stop NVIDIA AI-Q Blueprint infrastructure.

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Kick off public shotgun metagenomics QC, host-depletion, taxonomic profiling, and functional profiling workflows using nf-core/taxprofiler, Kraken2, Bracken, MetaPhlAn, and HUMAnN.

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Full CRUD and analysis for Mixpanel dashboards. Use when the user asks to build, create, analyze, read, understand, explain, modify, update, enhance, or manage dashboards, or asks about dashboard layout, text cards, or report arrangement. Covers dashboard analysis (read + understand existing), creation (new builds), modification (update existing), and explanation (data-driven annotation).

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Use when asked to run deep research or AI-Q research through a reachable NVIDIA AI-Q Blueprint backend.

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Turn Notion specs into implementation plans, tasks, and progress tracking; use when implementing PRDs/feature specs and creating Notion plans + tasks from them.

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Submit compact Clinical Tables NCBI Gene requests for human gene lookup, pagination, and field selection. Use when a user wants concise autocomplete-style human gene search results

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Run or plan deep germline WGS, WES, targeted-panel, cohort, or trio variant-calling workflows with reference-build, known-sites, QC, joint-calling, and annotation checks.

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Run or plan bulk RNA-seq differential-expression analysis from count matrices with replicate, design formula, contrast, batch, normalization, QC plot, and result-table checks.

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Run or plan targeted DNA panel variant workflows that use UMIs, duplex consensus reads, molecular barcodes, low-frequency calling, target coverage, and panel-specific QC.

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Dispatch bulk RNA-seq requests to FASTQ-to-count QC or count-matrix differential-expression skills using nf-core/rnaseq, STAR, Salmon, featureCounts, MultiQC, and R/Bioconductor workflows.

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Research across Notion and synthesize into structured documentation; use when gathering info from multiple Notion sources to produce briefs, comparisons, or reports with citations.

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Use when the user mentions MagicPath, designs, UI components, themes, canvas selections, or repo-to-canvas UI work; run magicpath-ai to search, inspect, install, or author components.

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Submit compact QuickGO requests for GO terms, annotations, and ontology traversal. Use when a user wants concise QuickGO summaries

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Route BCL, FASTQ, BAM/CRAM, count-matrix, or VCF sequencing requests to the right public NGS analysis skill and ask only the missing assay-specific setup questions.

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