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概要と使いどころ
METAINFORMANT rules for directory examples/dna. Use when editing, adding tests, or reviewing code under this path. Read the linked AGENTS.md first; use uv only, write outputs to output/, real implementations.
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METAINFORMANT rules for directory docs/dna. Use when editing, adding tests, or reviewing code under this path. Read the linked AGENTS.md first; use uv only, write outputs to output/, real implementations.
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Extract a public-safe brand and offer profile for paid advertising from an authorized website and operator input. Triggers on: brand DNA, brand profile, brand identity, brand style, brand colors, brand voice, visual identity, style guide, website brand analysis.
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Cell-free DNA analysis pipeline from plasma sequencing to tumor monitoring. Preprocesses cfDNA reads, analyzes fragment patterns, estimates tumor fraction from sWGS, and optionally detects mutations from targeted panels. Use when analyzing liquid biopsy samples for cancer detection or monitoring.
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Designs donor/repair templates for precise CRISPR knock-ins -- choosing the format (ssODN, long-ssDNA/Easi-CRISPR, dsDNA/plasmid, AAV6), sizing homology arms, placing the cut within ~10 bp of the edit, and adding a mandatory codon-checked blocking (PAM/seed) mutation so the edited allele is not re-cut. Frames the HDR-vs-NHEJ-vs-MMEJ pathway competition, the MMEJ (PITCh) and homology-independent (HITI/HMEJ) alternatives for post-mitotic cells, ssODN strand/asymmetry choice, phosphorothioate end-protection, and ranked HDR enhancers. Use when designing a donor for a point mutation, epitope/fluorophore tag, allele replacement, or knock-in, or when HDR efficiency is low. Guide design and base/prime editing are separate skills.
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Detects m6A modifications from Oxford Nanopore direct-RNA-sequencing (ONT DRS) signal data using m6Anet (Hendra 2022 *Nat Methods* 19:1590; multiple-instance-learning neural network over DRACH 5-mer signal). Covers the required upstream pipeline (Dorado / Guppy basecalling -> minimap2 transcriptome alignment with `-ax map-ont -uf -k14 --secondary=no` -> nanopolish eventalign with `--scale-events --signal-index` (m6Anet-required) plus `--summary` / `--threads` housekeeping -> m6anet dataprep -> m6anet inference), per-site vs per-read probability interpretation including the `mod_ratio` per-site stoichiometry column, the DRACH-only modeling constraint, minimum-coverage thresholds (20-50 reads per site for stable probability estimates), multi-condition comparison via xPore (Pratanwanich 2021 *Nat Biotechnol* 39:1394), Nanocompore (Leger 2021 *Nat Commun* 12:7198), ELIGOS (Jenjaroenpun 2021 *NAR* 49:e7), and Dorado native modification calling (RNA004 chemistry, 2024+), reference-transcriptome version pinning, the cDNA-vs-DRS chemistry distinction (cDNA-Nanopore CANNOT be used for modification detection), and orthogonal validation against MeRIP / GLORI. Use when calling m6A from ONT DRS without immunoprecipitation, choosing m6Anet vs xPore vs Nanocompore vs ELIGOS vs Dorado native, interpreting per-site `probability_modified` vs `mod_ratio` vs per-read modification probabilities, comparing methylation between conditions from ONT data, deciding between m6Anet for known DRACH sites and Dorado/Remora for genome-wide screening, pinning RNA002 vs RNA004 chemistry and basecaller model versions, or troubleshooting eventalign / dataprep failures.
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Designs donor/repair templates for precise CRISPR knock-ins -- choosing the format (ssODN, long-ssDNA/Easi-CRISPR, dsDNA/plasmid, AAV6), sizing homology arms, placing the cut within ~10 bp of the edit, and adding a mandatory codon-checked blocking (PAM/seed) mutation so the edited allele is not re-cut. Frames the HDR-vs-NHEJ-vs-MMEJ pathway competition, the MMEJ (PITCh) and homology-independent (HITI/HMEJ) alternatives for post-mitotic cells, ssODN strand/asymmetry choice, phosphorothioate end-protection, and ranked HDR enhancers. Use when designing a donor for a point mutation, epitope/fluorophore tag, allele replacement, or knock-in, or when HDR efficiency is low. Guide design and base/prime editing are separate skills.
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Detects m6A modifications from Oxford Nanopore direct-RNA-sequencing (ONT DRS) signal data using m6Anet (Hendra 2022 *Nat Methods* 19:1590; multiple-instance-learning neural network over DRACH 5-mer signal). Covers the required upstream pipeline (Dorado / Guppy basecalling -> minimap2 transcriptome alignment with `-ax map-ont -uf -k14 --secondary=no` -> nanopolish eventalign with `--scale-events --signal-index` (m6Anet-required) plus `--summary` / `--threads` housekeeping -> m6anet dataprep -> m6anet inference), per-site vs per-read probability interpretation including the `mod_ratio` per-site stoichiometry column, the DRACH-only modeling constraint, minimum-coverage thresholds (20-50 reads per site for stable probability estimates), multi-condition comparison via xPore (Pratanwanich 2021 *Nat Biotechnol* 39:1394), Nanocompore (Leger 2021 *Nat Commun* 12:7198), ELIGOS (Jenjaroenpun 2021 *NAR* 49:e7), and Dorado native modification calling (RNA004 chemistry, 2024+), reference-transcriptome version pinning, the cDNA-vs-DRS chemistry distinction (cDNA-Nanopore CANNOT be used for modification detection), and orthogonal validation against MeRIP / GLORI. Use when calling m6A from ONT DRS without immunoprecipitation, choosing m6Anet vs xPore vs Nanocompore vs ELIGOS vs Dorado native, interpreting per-site `probability_modified` vs `mod_ratio` vs per-read modification probabilities, comparing methylation between conditions from ONT data, deciding between m6Anet for known DRACH sites and Dorado/Remora for genome-wide screening, pinning RNA002 vs RNA004 chemistry and basecaller model versions, or troubleshooting eventalign / dataprep failures.
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Solidityの自動マーケットメーカーや流動性プールを対象に、再入攻撃、価格操作、交換時の価格ずれ、管理者権限などを点検し、安全な実装例を参照するスキル。
Run one tick of the sales business-pod (ADR-164 §4.1, Phase 2). Loads templates/sales.json, validates it against the pod-schema, resolves agents against ruflo's agent registry, reserves budget via the Phase-2 file-based stub ledger (atomic SQLite tracker is Phase 3 per ADR-164.1), constructs per-agent dry-run prompts, posts a summary envelope to room "sales" via the federation_bbs_publish JSONL backing store, and emits a structured {podName, tickId, agentsRan, totalUsd, envelopeId, status} line for /loop ingestion. Dry-run by default; --live is reserved for Phase 3.
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Looks up precomputed AlphaGenome Atlas effects for any GRCh38 single-nucleotide variant (AVI score with Phred and 18 SHAP feature attributions, plus raw and quantile scores for RNA-seq, DNase, ATAC, ChIP-TF, ChIP-histone, CAGE, PRO-cap, splicing, polyadenylation and contact-map tracks), scores variants or scans windows on demand with the AlphaGenome model for human and mouse (variant scoring, in silico mutagenesis, REF-versus-ALT track prediction), and builds Atlas website deep links. Use when the user mentions AlphaGenome, AlphaGenome Atlas, AVI or AlphaGenome Variant Impact, DeepMind variant effect prediction, or wants to prioritise or mechanistically interpret non-coding, regulatory, splicing, enhancer, promoter, or chromatin-accessibility effects of SNVs from a VCF, credible set, or region. Research use only; not a clinical tool.
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查理·芒格的思维框架与表达方式。基于《穷查理宝典》、伯克希尔/Daily Journal股东会、 USC/哈佛演讲、访谈记录、外部批评等50+来源的深度调研， 提炼5个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用芒格的视角分析问题、审视决策、提供反馈。 当用户提到「用芒格的视角」「芒格会怎么看」「芒格模式」「munger perspective」时使用。 也适用于：投资决策审视、认知偏误检查、跨学科思考训练、逆向思考练习。 即使用户只是说「逆向思考一下」「这有什么认知偏误」「Lollapalooza效应」「能力圈之外」「激励结构是什么」也可触发。 不要在用户只是问「这个决策靠谱吗」「帮我找盲点」等一般性问题时触发——只在涉及逆向思考、认知偏误、跨学科分析等芒格核心方法论时激活。
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唐纳德·特朗普（Donald Trump）的思维框架与行为逻辑。基于著作、长访谈、辩论、 心理分析、前幕僚回忆录、重大决策记录共6个维度的深度调研（320KB+原始资料）， 提炼6个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：（1）思维顾问——用特朗普视角分析谈判、权力、传播问题； （2）行为预判——解读他的公开行为背后的逻辑，预判下一步动作； （3）角色扮演——模拟特朗普在特定场景下的决策和表达。 当用户提到「用懂王视角」「特朗普会怎么看」「懂王逻辑」「trump perspective」 「懂王会怎么做」「从特朗普角度分析」「预测特朗普」时触发。
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马斯克的思维操作系统。基于传记、播客、推文、法庭证词、决策记录和外部批评的深度调研， 提炼5个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用马斯克的视角分析问题、审视决策、拆解成本结构、挑战行业假设。 当用户提到「用马斯克的视角」「马斯克会怎么看」「Musk模式」「马斯克perspective」「elon perspective」时使用。 即使用户只是说「这个成本合理吗」「从第一性原理想想」「白痴指数是多少」「五步算法」「能不能垂直整合」也可触发。 不要在用户只是问「能不能更快」「流程有必要吗」等一般性问题时触发——只在涉及成本拆解、第一性原理、激进迭代等马斯克核心方法论时激活。
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Naval Ravikant的思维操作系统。基于著作、播客、推文、决策记录和外部批评的深度调研， 提炼5个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 激活后沉浸式扮演Naval，直接以「我」的视角回应问题。 当用户提到「用Naval的视角」「Naval会怎么看」「纳瓦尔模式」「Naval perspective」「切换到Naval」时使用。 即使用户只是说「这份工作有杠杆吗」「什么是specific knowledge」「什么是真正的财富」「欲望太多怎么办」「无需许可的路径」也可触发。 不要在用户只是问「我该怎么选择」「帮我想清楚」等一般性决策问题时触发——只在涉及杠杆/特定知识/欲望管理/财富定义等Naval核心概念时激活。
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Paul Graham的思维框架与表达方式。基于200+篇essays、12个播客/访谈、 Twitter/X分析、7位核心批评者视角和完整人生时间线的深度调研， 提炼5个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用PG的视角分析创业、写作、产品和人生选择。 当用户提到「用PG的视角」「Paul Graham会怎么看」「PG模式」「paul graham perspective」时使用。 即使用户只是说「帮我用PG的角度想想」「如果PG会怎么做」「切换到PG」也应触发。
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理查德·费曼的思维框架与表达方式。基于40+个一手来源的深度调研， 提炼5个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用费曼的视角分析问题、审视决策、提供反馈。 当用户提到「用费曼的视角」「费曼会怎么看」「费曼模式」「feynman perspective」「费曼学习法」时使用。 即使用户只是说「这是不是cargo cult」「命名不等于理解」「能不能做个演示替代论证」「我真的理解了还是只记住了名字」也可触发。 不要在用户只是说「帮我解释一下」「用简单的话说」等一般性请求时触发——只在涉及费曼式验证（货物崇拜检测、命名vs理解、反自欺）时激活。
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塔勒布(Nassim Nicholas Taleb)的思维框架与表达方式。基于40+个来源的深度调研， 提炼6个核心心智模型、9条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用塔勒布的视角分析问题、审视决策、质疑主流叙事。 当用户提到「用塔勒布的视角」「塔勒布会怎么看」「塔勒布模式」「反脆弱视角」「taleb perspective」时使用。 即使用户只是说「会不会黑天鹅」「这个有尾部风险吗」「skin in the game」「有没有反脆弱的方法」「杠铃策略怎么用」也可触发。 不要在用户只是做一般风险评估或问「靠不靠谱」时触发——只在涉及极端风险、反脆弱、预防原则等塔勒布核心概念时激活。
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张雪峰的思维框架与表达方式。基于5本著作、15+篇权威媒体深度采访、 30+条一手语录、11个关键决策记录和完整人生时间线的深度调研， 提炼5个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用张雪峰的视角分析教育选择、职业规划、阶层流动等问题。 当用户提到「用张雪峰的视角」「张雪峰会怎么看」「张雪峰模式」「雪峰视角」时使用。 即使用户只是说「帮我用张雪峰的角度想想」「如果张雪峰会怎么说」「切换到张雪峰」也应触发。
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史蒂夫·乔布斯(Steve Jobs)的思维框架与表达方式。基于Isaacson授权传记、Stanford演讲、 Lost Interview、D Conference系列、Make Something Wonderful、30+一手来源的深度调研， 提炼6个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用乔布斯的视角分析产品、审视决策、提供反馈。 当用户提到「用乔布斯的视角」「乔布斯会怎么看」「Jobs模式」「steve jobs perspective」时使用。 即使用户只是说「帮我用乔布斯的角度想想」「如果乔布斯会怎么做」「切换到乔布斯」也应触发。
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Ilya Sutskever的思维框架与表达方式。基于12段一手对话、9篇学术论文、10小时宣誓证词、 27篇推荐阅读清单和14个权威二手来源的深度调研， 提炼6个核心心智模型、8条决策启发式和完整的表达DNA。 用途：作为思维顾问，用Ilya的视角分析AI技术方向、安全策略、研究品味。 当用户提到「用Ilya的视角」「Ilya会怎么看」「Ilya模式」「ilya perspective」 「sutskever perspective」时使用。 即使用户只是说「帮我用Ilya的角度想想」「如果Ilya会怎么做」「切换到Ilya」也应触发。
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External research synthesis from Trail of Bits, SlowMist, ConsenSys, Immunefi, and Cyfrin. Use this for advanced audit methodology, Echidna/Medusa fuzzing setup, Slither custom detector writing, attack pattern deep dives, or the 4-phase learning roadmap.
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Set up a paid-media client, brand, account, data-source, privacy, and mutation-guardrail profile for Claude Ads. Use for onboarding, initial configuration, brand DNA, API tokens or credential profiles, environment-variable or keychain setup, connecting exports or read adapters, safe native or verified-local installation, curl-pipe-bash install requests, declaring KPIs, or preparing a new advertising project.
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Writes, reviews, and debugs property-based tests — Hypothesis, fast-check, proptest, jqwik, rapid, and Echidna or Medusa for Solidity invariants. Use whenever tests should cover a whole input domain instead of a hand-picked list of examples: encode/decode and serialize/deserialize pairs, parsers, canonicalizers and normalizers, validators, numeric and Decimal types, comparators and sort order, data structures, and smart-contract state invariants. Also use when adding cases to an existing @given, fast-check, or proptest suite, when judging whether existing property tests assert anything real, and when a generator has shrunk a counterexample and you need to tell a wrong property from a genuine bug. Not for coverage-guided binary fuzzing (libFuzzer, AFL), mutation-testing campaigns, static analysis, benchmarking, or end-to-end UI tests.
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