「mapping」の検索結果

Surface every assumption embedded in a plan, strategy, or document, assess how critical and how validated each one is, and identify which ones to test first. Load when the user asks to map assumptions, surface hidden beliefs, find what must be true for this to work, run an assumption audit, or when deep-thinking diagnoses an assumption frame. Also triggers on "what are we assuming", "what must be true for this to work", or "find the untested beliefs". Based on David Bland and Alex Osterwalder's assumption mapping method from Testing Business Ideas.

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Predict B-cell and T-cell epitopes for vaccine antigen design and epitope mapping with BepiPred-3.0, DiscoTope-3.0, the IEDB tools, and EL-mode MHC presentation. Encodes the load-bearing asymmetry that T-cell epitope prediction is mature (it reduces to MHC presentation, AUC>0.9) while B-cell prediction is unreliable (linear predictors ~AUC 0.6 because ~90% of real epitopes are conformational) — so structure-based DiscoTope-3.0 on AlphaFold models is the only defensible B-cell path, propensity scales are obsolete, and NetChop is largely redundant on EL-trained models. Use when mapping epitopes or selecting vaccine antigens. MHC binding lives in mhc-binding-prediction.

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Maps between gene identifier systems (Ensembl, Entrez, HGNC symbol, UniProt, RefSeq, MANE) using AnnotationDbi, biomaRt, mygene, pyensembl, and Ensembl REST. Encodes Ensembl version stripping with GENCODE _PAR_Y preservation, the Ziemann 2016 Excel autocorrect debacle and Bruford 2020 HGNC renames (SEPT*->SEPTIN*, MARCH*->MARCHF*, MARC*->MTARC*, DEC1->DELEC1), OCT4/POU5F1 alias resolution, biomaRt archive endpoints for release pinning, the `filters` (plural) gotcha, MANE Select for clinical reporting, cross-species orthology via Ensembl Compara / OMA / OrthoDB, and tx2gene construction for tximport. Use when converting gene IDs across systems, handling renamed symbols, building tx2gene, pinning to a specific Ensembl release for reproducibility, or mapping cross-species orthologs.

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Query UniProt's REST API (post-2022 endpoint at rest.uniprot.org) for protein sequences, annotations, GO terms, cross-references, ID mappings, and proteomes. Use when fetching UniProtKB entries, navigating the JSON schema, choosing between UniProtKB/UniRef/UniParc/Proteomes resources, deciding stream vs search endpoint for batch retrieval, running ID-mapping jobs with the async pattern, handling isoform suffixes, or filtering reviewed Swiss-Prot vs auto-annotated TrEMBL. Encodes the legacy URL migration (2022), the new JSON schema layout, and bulk-pull patterns.

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Reconstruct ancestral states at internal phylogenetic nodes for sequences (PAML codeml, IQ-TREE --ancestral, GRASP, FastML), discrete traits (corHMM hidden-rate Markov, ape::ace, phytools::make.simmap stochastic mapping, BayesTraits), and continuous traits (phytools::fastAnc, geiger Brownian/OU, RPANDA). Use when designing constructs for ancestral protein resurrection, tracing trait evolution along a tree, performing stochastic character mapping, testing models of trait evolution (BM vs OU vs EB), inferring ancestral genome content via Dollo or DTL reconciliation, or quantifying ancestral-state uncertainty for downstream comparative analyses.

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Detects allele-specific transcription factor or histone modification binding from heterozygous-variant ChIP-seq using WASP (reference-bias filter; mandatory upstream), RASQUAL (joint QTL + bias-corrected testing), BaalChIP (Bayesian beta-binomial with copy-number-aware overdispersion), and AlleleSeq (personalized diploid genome). Handles imprinted-locus awareness, X-inactivation artifacts, cancer copy-number imbalance, and integration with downstream caQTL / bQTL mapping. Use when identifying variants with allelic effects on TF binding, fine-mapping causal regulatory variants, validating deep-learning variant predictions, or characterizing cis-acting regulatory effects.

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Performs gene-level association from GWAS summary statistics via genetically predicted tissue expression using FUSION, PrediXcan, S-PrediXcan, S-MultiXcan, UTMOST, MOSTWAS, kTWAS, EpiXcan, TIGAR-V2, and probabilistic fine-mapping with FOCUS and MA-FOCUS. Use when running TWAS from GWAS sumstats, prioritising candidate causal genes from a GWAS lead locus, picking single-tissue vs cross-tissue models, identifying LD-induced TWAS false positives, choosing ancestry-matched prediction weights, fine-mapping co-regulated TWAS hits, or triangulating TWAS with cis-eQTL Mendelian randomization and colocalization to nominate a causal gene.

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Resolves GWAS associations to candidate causal variants and credible sets via SuSiE, susie_rss, FINEMAP, CAVIAR, DAP-G, PAINTOR, PolyFun, SuSiEx, MultiSuSiE, and FOCUS. Use when narrowing a GWAS lead SNP to a 95 percent credible set, choosing between in-sample and reference LD, calibrating non-sparse loci with SuSiE-inf or FINEMAP-inf, integrating functional priors via PolyFun, fine-mapping across ancestries with SuSiEx, diagnosing LD mismatch via estimate_s_rss and kriging_rss, handling HLA or long-range LD, or feeding credible sets into coloc.susie for colocalization.

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Detect allele-specific chromatin accessibility from ATAC-seq using WASP, GATK ASEReadCounter, or RASQUAL. Use when mapping cis-regulatory genetic variants from heterozygous SNPs, separating cis from trans regulation, building chromatin QTL (caQTL) maps, validating GWAS variant function with allelic imbalance, or detecting reference allele mapping bias before downstream analysis.

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ABP Framework application layer patterns including AppServices, DTOs, Mapperly mapping, Unit of Work, and common patterns like Filter DTOs and ResponseModel. Use when: (1) creating AppServices, (2) mapping DTOs with Mapperly, (3) implementing list filtering, (4) wrapping API responses.

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Expert 3D modeling specialist with deep knowledge of topology, UV mapping, game-ready and film-ready pipelines, DCC tool workflows (Blender, Maya, ZBrush, 3ds Max, Houdini), retopology, LOD systems, and export pipelines. This skill represents years of production experience distilled into actionable guidance. Use when "3d model, 3d modeling, mesh topology, uv unwrap, uv mapping, retopology, retopo, low poly, high poly, subdivision, subdiv, edge flow, edge loops, polygon modeling, box modeling, hard surface, organic modeling, sculpting, zbrush, blender modeling, maya modeling, 3ds max, LOD, level of detail, game ready mesh, film ready, baking normals, high to low, fbx export, gltf export, texel density, 3d, modeling, topology, uv, game-dev, vfx, blender, maya, zbrush, retopology, lod, hard-surface, organic, sculpting" mentioned.

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INVOKE THIS SKILL for LLM-as-judge evaluation workflows on Arize: creating/updating evaluators, running evaluations on spans or experiments, tasks, trigger-run, column mapping, and continuous monitoring. Use when the user says: create an evaluator, LLM judge, hallucination/faithfulness/correctness/relevance, run eval, score my spans or experiment, ax tasks, trigger-run, trigger eval, column mapping, continuous monitoring, query filter for evals, evaluator version, or improve an evaluator prompt.

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Map advanced persistent threat (APT) group tactics, techniques, and procedures (TTPs) to the MITRE ATT&CK framework using the ATT&CK Navigator and attackcti Python library. The analyst queries STIX/TAXII data for group-technique associations, generates Navigator layer files for visualization, and compares defensive coverage against adversary profiles. Activates for requests involving APT TTP mapping, ATT&CK Navigator layers, threat actor profiling, or MITRE technique coverage analysis.

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Analyzes intrusion activity against the Lockheed Martin Cyber Kill Chain framework to identify which phases an adversary has completed, where defenses succeeded or failed, and what controls would have interrupted the attack at earlier phases. Use when conducting post-incident analysis, building prevention-focused security controls, or mapping detection gaps to kill chain phases. Activates for requests involving kill chain analysis, intrusion kill chain, attack phase mapping, or Lockheed Martin kill chain framework.

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概念や業務の流れ、ソフトウェア構成を図にまとめます。ブラウザで開けるSVG入りHTMLか、編集できるExcalidraw形式で保存するスキルです。

• 教材で概念を図解したいとき
• 業務の流れをフローチャートにしたいとき
• ソフトウェアやクラウドの構成図作成

一度の対話では収まらない大きな企画や変更を、決めるべき問いと依存関係に整理します。課題管理ツールに判断の記録を残し、実行に移るまでの道筋を明らかにするスキル。

• 複数の対話にまたがる大きな計画
• 未決事項と依存関係の整理
• 共同作業で判断の経緯を共有

検索に見つけてもらいやすいサイトを目指し、技術的な問題、ページの見出しや説明文、構造化データ、表示性能を点検し、ページごとの改善案と実装を進めるスキル。

• 検索に登録されない原因を調べたいとき
• タイトル・説明文・見出しの改善
• 記事や商品の構造化データ追加

絞り込んだ競合を九つの観点で採点し、根拠付きの比較カードと戦略の二軸図に整理するスキル。各社の強みや、自社が狙う領域の競合を確認します。

• 競合を共通の基準で比較したいとき
• 出典付きの競合紹介カード作成
• 戦略の二軸で競合を配置したいとき

XとLinkedInのつながりから、会いたい相手への紹介経路を評価するスキル。経路の近さや関係の強さを重み付けし、紹介を頼む候補と接点の不足を整理します。

• 対象者を紹介できる知人探し
• 共通の知人を紹介価値で順位付け
• 対象企業への紹介経路を調べたいとき

学術・技術文献を検索し、選定基準に沿って比較・統合するスキルです。検索履歴や除外理由を残し、根拠の強さと引用を確認したレビューにまとめます。

• 研究テーマの全体像を把握したいとき
• 検索手順を記録した文献レビュー
• 研究結果の矛盾や未解決課題の整理

JavaScript・TypeScriptでEthereum用のハッシュ処理を実装・点検し、SHA3との混同による関数識別子や署名、アドレス算出の誤りを防ぐスキル。

• 関数セレクターやイベント識別情報の計算
• 署名や保存位置のハッシュ処理の点検
• 公開鍵からアドレスを算出したいとき

リアルタイム画面やデータ配信の遅延、情報の鮮度、処理待ちを個別に測り、イベント発生から画面表示までの経路を改善して、稼働環境で結果を確かめるスキル。

• リアルタイム画面の遅延調査
• 配信データの鮮度を確認したいとき
• キューの滞留を減らしたいとき

競合のブランド表現やサービス、実績などを共通の基準で採点し、根拠付きの比較カードと戦略上の二軸図にまとめ、自社が狙う位置の競合を把握するスキル。

• 共通基準で競合を比較したいとき
• 根拠付きの競合カード作成
• 二つの戦略目標で競合を整理したいとき

文章をAIが扱う小さな単位に分け、大量のテキスト処理や独自の語彙学習を支援するスキル。分割結果と元の文章の位置対応、入力の長さ調整も扱います。

• 大量の文章をモデル入力用に処理したいとき
• 文章ファイルから独自の語彙を学習
• 予測結果を元の文章の位置に対応づける