リサーチ・学習のスキル

NIH Metabolomics WorkbenchのAPIから、代謝物の構造や研究データを取得し、名称の標準化や質量分析による候補検索を行うスキル。

• 特定の代謝物を測定した研究の検索
• RefMetによる代謝物名の標準化
• 質量分析値から化合物候補を探したいとき

Neuropixelsの神経記録を読み込み、前処理や位置ずれの補正、神経細胞ごとの信号の分離、品質評価、結果の可視化・書き出しまでを支援するスキル。

• 神経記録の前処理と位置ずれ補正
• Kilosort4で神経信号を分離したいとき
• Allen・IBL基準で信号を選別したいとき

最新情報や科学論文をPerplexityで検索し、出典付きの回答を得るスキル。調査内容に応じたモデル選びや質問の組み立て、結果の保存も支援します。

• 最近の科学論文を探したいとき
• 出典付きで事実確認したいとき
• 最新の技術や手法を比較したいとき

openFDAから医薬品・医療機器・食品などの有害事象報告、回収、承認、物質情報を検索・集計し、安全性や規制に関する調査を支援します。

• 医薬品の有害事象報告の集計
• 医療機器の承認・回収情報の調査
• アレルゲン関連の食品回収の追跡

論文の本文・図表・引用を整理し、変更履歴や図の生成条件を追える形で管理します。PDFやHTMLの再現可能なビルドと自動検証を整えるスキルです。

• 共同執筆のファイルを整理したいとき
• 投稿・修正の変更履歴を追いたいとき
• 図を同じ条件で再生成したいとき

生物の進化関係を表す系統樹を編集・比較し、遺伝子の重複や種分化を調べます。NCBIの分類情報を加え、注釈付きの図をPDFやSVGに出力できます。

• 系統樹の枝や根を整理したいとき
• 遺伝子重複や種分化を調べたいとき
• 系統樹に学名や分類情報を加えたいとき

GDPや失業率、物価、金利などの経済データをFREDから検索・取得します。期間や集計頻度を指定した比較、過去の公表時点の値の確認、地域別データや公表予定の取得に使えます。

• GDP・物価・金利の推移を比較したいとき
• 改定前の経済指標を確認したいとき
• 経済統計の公表予定を取得したいとき

観察結果や予備データと科学文献をもとに、現象を説明する複数の仮説を立て、各仮説の予測・検証実験・支持や棄却の判断基準を研究報告書にまとめるスキル。

• 予備データから仮説を立てたいとき
• 現象の複数の説明を比較したいとき
• 仮説を区別する実験の設計

複数の学術データベースから論文を検索し、選定基準に沿って研究結果を整理。引用情報の検証からMarkdown・PDFの文献レビュー作成まで支援します。

• 論文や学位論文の先行研究をまとめたいとき
• 特定テーマの研究結果を比較したいとき
• 未解明の課題や今後の研究方向の整理

流体の動きをPythonで数値シミュレーションし、乱流や渦、浅い水の流れなどを調べるスキル。計算条件の設定から並列実行、結果の可視化まで扱います。

• 2次元の乱流や渦を計算したいとき
• 密度成層を持つ海洋・大気の流れの研究
• 粘性を変えた計算結果を比較したいとき

公開データベースENAからDNA・RNA配列や解析前の読み取りデータ、ゲノム構造を検索・取得し、研究条件での絞り込みや解析用の一括ダウンロードを支援するスキル。

• 登録番号から配列を取得したいとき
• 研究に属する試料の一覧作成
• 生物種ごとのゲノム検索

VCO/vibeのローカル文書・設定・スキル資料から、判断やルールの根拠を検索します。該当箇所をファイルパスと行番号付きで返し、出典を示した説明を支援します。

• VCOのルールの出典を探したいとき
• スキル群の選択理由の説明
• 設定のしきい値や意味の確認

遺伝子の違いが薬の効き方や副作用にどう関わるかをClinPGxで調べます。遺伝子と薬の関連、診療指針、遺伝子型に応じた投与量の推奨情報を集めるスキルです。

• 遺伝子と薬の関連を調べたいとき
• 遺伝子型に応じた投与指針の確認
• 集団別の遺伝子型の頻度比較

データ分析に入る前に、実験や準実験の設計を整理します。介入群・比較群、測定する結果、必要な前提を選び、結果が弱い実験の追加検証や継続判断も支援します。

• 分析前に研究設計を選びたいとき
• 介入群・比較群・測定項目の整理
• 研究設計の前提を確認したいとき

設計したタンパク質の結合・発現・熱安定性・酵素活性をクラウド実験室で検証するため、配列の最適化から実験依頼、進捗確認、結果取得までを支援するスキルです。

• 設計したタンパク質の結合を試験したいとき
• 発現量・熱安定性・酵素活性を試験したいとき
• 実験前に配列の溶けやすさを改善したいとき

論理・証明・集合・組合せ・整数論を順に学び、演習で理解を確かめるスキル。計算機科学の土台となる数学と、問題を分解して考える力を養います。

• 計算機科学の基礎数学を学びたいとき
• 帰納法や背理法を練習したいとき
• 集合・関数・数え上げの復習

複数の情報源やツールを使う調査で、出典の確認、情報の照合、エラーへの対処を進めるスキルです。未確認の点や調査の限界を明示した報告にまとめます。

• 複数の情報源で根拠を確認したいとき
• 検索やページ取得の失敗への対処
• 取得済みの出典と主張の対応整理

遺伝子や変異、疾患、タンパク質に関する生物学データベースを調べ、識別子の対応付けや情報源の記録を行い、複数の根拠を比較できる表に整理するスキル。

• 遺伝子IDをデータベース間で対応付け
• 変異の臨床的意義の根拠を調べたいとき
• 創薬標的と疾患の関連根拠を比較

手元のプロジェクトのコードを教材に、経験や目標に合うプログラミング学習を進めます。教材・質問・クイズの履歴を残し、理解度に応じた復習につなげます。

• 実際のコードで概念を学びたいとき
• 学習履歴から次のテーマを選びたいとき
• 苦手な概念をクイズで復習したいとき

論文の識別子から著者・題名・掲載誌などを取得し、参考文献用のBibTeXを整えます。既存の引用情報の照合や重複除去を通じて、論文や学位論文の文献整理を支えます。

• DOIなどからBibTeXを作りたいとき
• 投稿前に引用情報を照合したいとき
• 参考文献の重複除去と書式統一

ClinicalTrials.govの臨床試験を、疾患・薬剤・地域・募集状況などで検索します。参加条件や実施施設の確認、試験情報の要約、CSV出力を支援します。

• 疾患と地域から募集中の試験を探したいとき
• 特定の薬剤や介入の試験動向の調査
• 参加条件と実施施設を確認したいとき

化合物の名前・構造・物性からChEMBLを検索し、標的タンパク質への活性値や薬の作用機序を取得して、阻害剤候補の探索や構造と活性の比較に使うスキル。

• 特定の標的に対する阻害剤を探したいとき
• 構造が似た化合物を探したいとき
• 化合物の構造と活性を比較したいとき

データの説明から研究仮説、手法、計算実験、LaTeX論文の作成までを複数のAIエージェントで進めます。既存の仮説や分析結果を渡して途中から使うことも可能です。

• データの説明から研究仮説を探したいとき
• 既存の研究課題の検証手法を考えたいとき
• 計算実験と図の作成

製薬・臨床研究向けに、バイオマーカー別の患者集団の成績比較や、根拠の評価と治療選択のフロー図を含む推奨報告書をLaTeX/PDFで作るスキル。

• バイオマーカー別の患者集団の成績比較
• 根拠の評価を含む治療推奨資料の作成
• バイオマーカーに基づく治療選択の図解