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概要と使いどころ
Infer and visualize intercellular communication from scRNA-seq with CellChat (R). Build CellChat from Seurat/counts → subset CellChatDB ligand-receptor pairs → over-expressed genes per group → communication probabilities → pathway signaling → network centrality (senders/receivers/influencers) → chord/heatmap/bubble plots → cross-condition compare. Human, mouse. Use liana for pure-Python.
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Model interpretability via SHAP (Shapley values from game theory). Covers explainer choice (Tree, Deep, Linear, Kernel, Gradient, Permutation), feature attribution, and plots (waterfall, beeswarm, bar, scatter, force, heatmap). Use to explain ML predictions, rank features, debug models, audit fairness, or compare models. Works with tree, deep, linear, and black-box models.
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Selecting a reference manager and applying citation styles. Compares Zotero, Mendeley, EndNote, Paperpile; covers APA/Vancouver/ACS/Nature styles, DOI management, citation tracking, and Word/Google Docs/LaTeX integration. Use when setting up a reference workflow or fixing citation formatting.
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Unified Python framework for extracellular electrophysiology. Load 20+ formats (SpikeGLX, OpenEphys, NWB, Intan, Maxwell, Blackrock), preprocess, run 10+ sorters (Kilosort4, SpykingCircus2, Tridesclous, MountainSort5) via one API, compute quality metrics (SNR, ISI, firing rate), compare sorters, export NWB/Phy. For format-agnostic multi-sorter workflows. For Neuropixels-specific PSTH/decoding use neuropixels.
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Find and compare current FF&E candidates from a design brief, with sourced purchasing facts and optional CSV-library save. Use to research or source products; not to match from an image or pair coordinating items.
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Extract GWP, life-cycle stages, certifications, and impact metrics from an EPD PDF. Use when given a declaration to parse; not to find or compare EPDs.
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Compare scoped quantity snapshots and explain matches, missing rows and conflicts. Use to reconcile drawing, report or schedule counts; not to extract source documents or update adopted records.
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Evaluate WooAIAssistant against a structured scenario suite with hard invariants + LLM-as-judge rubric scoring. Runs live against the demo store + gpt-5.1 via the woo-mobile-ai backend wrapper, writes a JSONL run record, compares against stored baselines, and surfaces regressions. Always delegated to a subagent so the main context only sees the markdown report.
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Provides GitHub Copilot CLI task delegation in non-interactive mode with multi-model support (Claude, GPT, Gemini), permission controls, output sharing, and session resume. Use when users ask to hand work to Copilot, compare models, or run Copilot programmatically from Claude Code.
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When the user needs to choose between technologies, frameworks, or tools — or says "which framework should I use", "compare X vs Y", "should we migrate from X to Y", "what database should I use", "calculate TCO".
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Use when a page ranks for a keyword but isn't in the top 3 and you want to know exactly what's missing. The agent compares the page to the top-ranking competitors and produces a specific list of entities, subtopics, and relationships to add.
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Analyze construction budget variances. Compare estimated vs actual costs, identify trends, forecast final costs, and generate variance reports for cost control.
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What-if analysis for construction projects: model different scenarios and their cost/schedule/resource impacts. Compare alternatives and optimize decisions.
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Analyze historical construction costs for benchmarking, trend analysis, and estimating calibration. Compare projects, track escalation, identify patterns.
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Calculate embodied carbon in construction materials. Track CO2 emissions, compare alternatives, and generate sustainability reports.
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Analyze field progress photos. Catalog, tag, and compare against planned progress.
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Compare and analyze contractor bids. Score proposals, identify scope gaps, and recommend selections.
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Process construction change orders using CWICR data. Calculate cost impact, compare to original estimate, and generate change order documentation.
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Compare cost estimates across projects, versions, and scenarios. Identify variances, benchmark against standards, and generate comparison reports.
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Analyze construction site photos to track progress, detect safety issues, and compare against BIM models using computer vision.
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Analyze contractor bids against CWICR benchmarks. Identify pricing anomalies, compare bid components, and support bid evaluation decisions.
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Track and analyze historical cost data using CWICR. Compare actual vs estimated costs, build project cost database, and improve future estimates.
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Analyze and compare subcontractor bids against CWICR benchmarks. Evaluate pricing, identify outliers, and support negotiation.
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Tendering and reporting in OpenConstructionERP: prepare tender BOQs, compare bids, manage risks, and generate reports (weekly, monthly, closeout). Use when a project goes to tender or needs reporting.
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